EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-39994 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr3:45100246-45101277 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE40MA0464.2chr3:45101144-45101154GTCACGTGAT-6.02
FOXK2MA1103.1chr3:45100609-45100620ATGTAAACATG+6.14
HNF1AMA0046.2chr3:45100901-45100916GATTAATCATTAACT-6.31
HNF1AMA0046.2chr3:45100901-45100916GATTAATCATTAACT+7.58
HNF1BMA0153.2chr3:45100902-45100915ATTAATCATTAAC+6.02
HNF1BMA0153.2chr3:45100902-45100915ATTAATCATTAAC-7.34
SREBF2(var.2)MA0828.1chr3:45101144-45101154GTCACGTGAT-6.02
Srebf1(var.2)MA0829.1chr3:45101144-45101154GTCACGTGAT-6.02
TFEBMA0692.1chr3:45101144-45101154GTCACGTGAT-6.02
Enhancer Sequence
TGACTTATTT CTTGAGCGCC GAAAACGCTG GAGAGGCCGT TGATTGTGTT GGAAACGCTG 60
CTGCTCCGTC TCAGTGTGGA TGGGGAAAGA CGGAGACATC TGAAAACGGA GGCAGGGCTG 120
CAAACGTTCG CCTATCTGAT TGGGGCTTTT CCTCAATATT AAGTAGCCCA CACACAGTTC 180
AGTCTCGCAT CCTCTTCTTG TAAGTTAAGA CTTCCCAAGT TTGATCAAGG CTGCAGTCTC 240
CCCCTTCTCA GTTTGATATG GAAAACATAC CGAGGACACG CGTAAATCTT CAAAGGGAAC 300
AGTGCACTTT ATAACTTCAT TCACATCACC TTGGCTACGT TGTTTCACTT TCTCAACAAT 360
AAAATGTAAA CATGATTTAA GGAACTGCCT ATTTTCTTTT TAATATTAGC AACTTAACAG 420
ACAGCAGAAA TGTTGAGGCG TCGTGCTGCA TATATGAGCG TCATCTTCAC TGTGTGCATA 480
TTTATAACAA AACGGAGCCG ATAACAACTG CCTCCTTTCA ATTTCAGTGA AAATACGAAA 540
CGCACCCTCT CTTTTGCTGA ATATCAGTTT TAATAATCGA CAATTATAAA AGTATAACAT 600
ACAATAAGTT TATACATTGT AGGAAATAAA GGCAAGCGAT CAGTCAATGT ACCTGGATTA 660
ATCATTAACT TATCTTTGCG CTTAACCAAA ACATGTTACC CGTGAACAAG TAACTTAATA 720
GATTCCAATG ACCAAAGTCA GGGAATTTGC CTATGTCGTT AGATAAAGAC AACAACATGA 780
ATGAAATATC ACGTTTAGCA AATATAGTGA GATTAGATCC AGCGGGAGAT GCGTGATGAG 840
CAGTCCGACA AGCAGAGCTC TCATCTCATG CTGGAGCGCT TGCCCGAGAG TGTCTGTGGT 900
CACGTGATGT GCGTTTTCAG CGTTTTGGTG TGGACGGAGA GCTGTTCAGA AACGCTGGGT 960
AAAACGCGAG TGTGGACGCG GATCGTTTTC ATTCTACAAC GCCGTTTTAA AACTAAAACG 1020
CACTCTTGTA A 1031