EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-39887 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr3:41766992-41768111 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr3:41767073-41767085AAACAAACATAC-6.37
SOX10MA0442.2chr3:41767491-41767502AAAACAAAGGA+6.32
Sox3MA0514.1chr3:41767491-41767501AAAACAAAGG-6.02
Enhancer Sequence
CAACATTTTG CTACATTAAC CATAGTTTAC TATGGTGATT GTAACAAAAC TGGTTATACA 60
ACTAGTAATC AATGTGCCAA AAAACAAACA TACACATAGA GTTAGTACAC TATACTGTAA 120
TAAACCATGG TTAATGTTCA TAAGGGGTGT GCATGTGACA TTTTAAGAAG TTTCAGTCAA 180
TTGGAAACCT TTAAAGGCAT GTAATTACAC ATAATGAGGC TAACTACATT AAACAAATAC 240
ACTACAGTTC CCGTCACATC TATTCATCCA GGTTAATATT TGAATATCTA CAGCTTATCT 300
CATCAGTAAT TACCATTGAA AGCACCAGGA GATCCAAATA ATGAGATCTC CTGATATTCT 360
CCCAGAGGAG CCATCACAGC ATTCCCAAAA GTCGTTTAGC ATTTGAATAA CCAAAATGGG 420
CTGGAGAAAA GGTAATTCAC CTCAATAGTG GTCACCCCAC CCTTAAACCC ATATCTGCAA 480
TTTCCCATTG TTGTCAATGA AAACAAAGGA AACTGTTCAA CATCTCAGTG CCTGATACCA 540
AAAAAAGTCT AAGATACATA GCAACTATTT AGGGGAAAAA TAAATAAAAG CTGGAATTGT 600
AAACAACAGC TTCGCTAGAT TGGAGCATTC ATGAGAAAGG ACTATCCAAG TTACTACATG 660
TGGTTACATC ATTACAACTG GCAGTGTTCT CAAAAACCAA AGGTGGTAAA ATCTGACAAC 720
TTAAACCCAC TCTTGTTTTT GTGACAGGAA TGCGATGGGT GCTTCAGGCA GCCCTATTGG 780
CATGCAGCAA GCTATTAGAA TGAGAATAGA GGCCTGATGA GAGAGACCTA CAGTAGAGCT 840
TTAGAGCTTA ATGGGCTCCG GGCAGCACAG AAACATGTCT CAGTTTTCAA TGGTTGGCTC 900
ATTGTCCCGC TCAGCAAGGT AGTGGCAGGC CACAAAAGGG GAAGGGTATA GGTTGAAGAG 960
AACTCTTTCA AAGAGGCTGA GTGATCCAGA GCCTGATTCA CCCACAAACA GCAGCGTCCT 1020
TGTCCCAGCT CCACTGTTCC AGAGCTATAC AAAAAGAGCC AAGCGGGTTC ATTCCCAACA 1080
ATACACCTCC CACTTCTTCC TCAAACTCTA ATCAGCCAC 1119