EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-39581 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr3:35763276-35764588 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr3:35763371-35763390CTGTCAGCAGGTGGCGCTA+6.51
CTCFMA0139.1chr3:35764158-35764177TGGCCAGTTGGTGGCGCTA+6.69
IKZF1MA1508.1chr3:35764280-35764292ACTTCCTGTTTT-6.74
KLF13MA0657.1chr3:35763866-35763884TTGCCACGCCCACTTCAA+6.21
KLF14MA0740.1chr3:35764018-35764032GGACACGCCCCTCT+6.17
KLF14MA0740.1chr3:35763867-35763881TGCCACGCCCACTT+7.73
SP1MA0079.4chr3:35763865-35763880TTTGCCACGCCCACT+6.18
SP3MA0746.2chr3:35763867-35763880TGCCACGCCCACT+6.71
SP4MA0685.1chr3:35763865-35763882TTTGCCACGCCCACTTC+6.99
SP8MA0747.1chr3:35763868-35763880GCCACGCCCACT+7.22
SPICMA0687.1chr3:35764279-35764293GACTTCCTGTTTTG-6.22
Enhancer Sequence
ACATTTAAAT GTCTTCAGAA GAGGAATTTA TTCAACCATG TGTAGTTTCA TGCAGATAAG 60
ACATTGTGTG GCTGAGTTAT AAGCCAAAAT TCCTTCTGTC AGCAGGTGGC GCTATGACTG 120
TGACTCAATA TTGGCATCTA GTTGTGTTCC GGAGAGGAAT TTATTCAACC ATGTGAAGTT 180
TCAGGCAGAT CGGACATTGT GTGGTTGAGT TATAAGGACT TCCTGGTCAA TGGCGAAGCG 240
TTGAGGTTTG TCATGCCACT ACGGACACAC CCCTCAGCGA AAACTCTAAA TCTTCGCAAT 300
TTAACATCAC CAAGGCCTTT AAATGACAAA ACCAAATTTT GGTGTTGATC GGATAAAATC 360
CCTAGGAGGA GTTCGTTAAA ATACAACACC TGGAAATGGC AAAAATGCCT CTTTTTTTCA 420
GCAGGAAGTT AAAAATATCC GACTTCCTGT TGAGTTTGAG ATATGGCACC AAGAGACTTT 480
TTCGTATGTT TCGGCATGTT TGAGGTGTTT GCCAATTTTC GTGCATGTGA GTGATTCGTA 540
CATCAGGGGC TCGTCCGATT AATTTTTGTA GGTGGCGCTG TCGAGTCTAT TTGCCACGCC 600
CACTTCAATA TTGTTATGTA GATGTGTTCA GAAGAGGACT TTTATCAACC ATGTGAAGTT 660
TCAGGCAGAT CGGACATTGT GTGGTTGAGT TATAAAGCCT TCCTGTTCCA TGGCGAAGCG 720
TTGAGGTTTG TCATGCCGCC ACGGACACGC CCCTCTGCAA AAACTCTAGA TCTTCACAAT 780
ATAACATCGC TAGAGCTTTC AGATAACACT ACCCAATTTT GGTGCTGATA CGATAAAATT 840
TGTGGGAGGA GTTTGTTACT CTGTAAAACA TGTAATTTCC TGTGGCCAGT TGGTGGCGCT 900
ATAACTGTAT CTGGATATTG GCATGTAAAC GTGTTCAGGT CAGGACTCTT ATCAAACGTG 960
TGAATTTTGA GGCAGATCGG ATAATGCATG TCTTAGTAAT AATGACTTCC TGTTTTGTGG 1020
CGAATCGTCA AAGTTTGCGA GGCCGCCACG GACACGCCCA TCGACGAAAA CTCTAAAGCT 1080
TCGCAATTTA ACATCGCCAA GGCCTTTAGA TGACAAAACC CAATTCTGGT GTCGATCGGA 1140
TAAAATCCCT AGGAGGAGTT CGTTAAAATA CAACGCCTGG AAATGGCAAA AACGCCACTT 1200
TTTCACTACA GGAAGTCAAA AATATCCGAC TTCCTGTTGG GTTTGAGATA TGGCTCCAAG 1260
AGACTTTTTC GTCTGTTTTG GCATGTTTGA GGTGTGTGCC AATTTTCGTG CA 1312