EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-39579 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr3:35758622-35760317 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr3:35759056-35759075TGGCCAGCAGGTGGCGCTG+9.21
CTCFMA0139.1chr3:35759843-35759862TGGCCAGCAGGTGGCGCTA+9.81
IKZF1MA1508.1chr3:35758870-35758882ACTTCCTGTTCC-6.44
IKZF1MA1508.1chr3:35759658-35759670ACTTCCTGTTCC-6.44
IKZF1MA1508.1chr3:35759965-35759977ACTTCCTGTTTT-6.74
KLF13MA0657.1chr3:35759551-35759569TTGCCACGCCCACTTCAC+6.12
KLF14MA0740.1chr3:35759552-35759566TGCCACGCCCACTT+7.73
SP1MA0079.4chr3:35759550-35759565TTTGCCACGCCCACT+6.18
SP3MA0746.2chr3:35759552-35759565TGCCACGCCCACT+6.71
SP4MA0685.1chr3:35759550-35759567TTTGCCACGCCCACTTC+6.99
SP8MA0747.1chr3:35759553-35759565GCCACGCCCACT+7.22
SPICMA0687.1chr3:35759964-35759978GACTTCCTGTTTTG-6.22
Enhancer Sequence
CAGGTGGCGC TATAACTGTG ACTCAAGATC GGCATGTAGA TGTCTTTAGG AGAGGCATCT 60
CATCTAACCT GTGAATTTTC AGGCAGATCG GACATTGTTT GGCTGAGTTA TAAGCCAAAC 120
TACCTTCTGC TATCAGGTGG CGCTATGACT GTGACTCAAT ATTGTTATGT GAATGTGTTC 180
AGGGGAGGAC TTTTATCAAC CATGTGAAGT TTCAGGCTGA TCGGACTTTG TGTGGTTGAG 240
TTATGAGGAC TTCCTGTTCC ATGGCGAAGC GTTGAGGTTT GTCATGCTGC CACAGACATG 300
CCCTTCTGTG AAAATTTCAG ACCCTAACAA AATGTAATTG CTAGAACTTT CAGATAACAA 360
CCAACCAAAC TTGGAGCTGA TACGAAAAAT TTTGTGGGAG GAGTTTATTA CTCTGTAAAT 420
CATGACATTT CTTGTGGCCA GCAGGTGGCG CTGTAACTGT ATCTGGATAT TGGCATGTAA 480
ATGTGTTCAG GTCAGGACTC TTATTAAACA TGTGAATTTT GAGGCAGATC AGATAATGCA 540
TGCCTGAGTT ATAATGACTT CCGATTTTGT GGCGAATCGT CAAAGTTTGC GAGGCCGCCA 600
CGGACACGCC CATTGACAAA AACTCTAAAG CTTCACAATT TAACATCGCC AAGGCCTTTA 660
GATGACAAAA CCTAATTTTG GTGTCGATCA GATAAAATCC CTAGGAGGAG TTCGTTAAAA 720
TACAACGCCT GGAAATGGCA AAAATGCCAC TTATTTGCCG CAGGAAGTTA AAAATATCCG 780
ACTTCTTGTT GGGTTTGAGA TATGGCTCCA AGAGACTTTT TCGTATGTTT TGGCGTGGTT 840
GAGGTGTGTG CCAATTTTCG TGCATGTGCG TGATTCGTAG ATCAGGGGCT CGTCCGTTTA 900
ATTTTTATAG GTGGCGCTGT CGAGTCATTT TGCCACGCCC ACTTCACTAT TGTTATGGGG 960
ATGTGTTCGG GAAAGGACTT TTATCAAGCA TGTGAAGTTT TAGGCTGATC GGACTTGGTG 1020
TGGTTGAGTT ATAAGGACTT CCTGTTCCAT GGCGAAGCGT TGAGGTTTGT CATGCCGCCA 1080
CAGACACGCC CCTCTGCGAA AACTCTAGAT CTTCACAATA TATCATCGCT AGAGCTTTCA 1140
GATAACACCA CTCAAATTTG GTGCTGGTAC AATAAAGTTT GTGGGAGGAG TTTGTCACAC 1200
TGTAAAACAT GTCATTTCCT GTGGCCAGCA GGTGGCGCTA TAACTGTATC TGGATAGTGG 1260
CATGTAAACG TGTTCAGGTC AGGACGCTTA TCAAGCGTGT GAATTTTGAG GCAGATCGGA 1320
TAATGTATCA CTGAGTTATA ATGACTTCCT GTTTTGTGGC GAATCGTCAA AGTTTGCGAA 1380
GCCGCCACGG ACACACCCAT CGACGAAAAC TCTAAAGCTT CGCAATTTAA CATCGCCAAG 1440
GCCTTTAGAT GACAAAACCT AATTTTGGTG TTGATCGGAT AAAATCCCTA GGAGGAGTTC 1500
GTTAAAATAC AACGCCTGGA AATGGCAAAA ATGCCACTTT TTCGCTGCAG GAAGTTAAAA 1560
ATATCTGACT TCCTGTTGGA TTTGAGATAT GGCTCCAAGA GACTTTTTCG TATGTTTTGG 1620
CATGTTTGAG GTGTGTGCCA ATTTTCGTGC ATGTGCGTGA TTCGTGGATC GGGGGCTCGT 1680
CCGTTTAATT TTTCT 1695