EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-39519 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr3:33855746-33856645 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr3:33856261-33856273GATTGTTTGTTT+6.92
PBX1MA0070.1chr3:33856254-33856266TTTGATTGATTG-6.18
PRDM1MA0508.2chr3:33855992-33856002GTGAAAGTGA-6.02
RORBMA1150.1chr3:33856124-33856135ATTTAGGTCAT+6.02
ZNF24MA1124.1chr3:33856138-33856151CATTCATTCATAC+6.64
ZNF384MA1125.1chr3:33855867-33855879TTTTTTTTTTAT-6.27
ZNF384MA1125.1chr3:33855866-33855878TTTTTTTTTTTA-6.37
ZNF384MA1125.1chr3:33855868-33855880TTTTTTTTTATT-6.62
Enhancer Sequence
GGAGGAAGTG GAAGGTCAGC TACACAATAG AAGACCATAA AAGGGGGTGT TGAGGGTTGC 60
TCCGGGCTGT TGTTGTTGTT GTGGTTGCTG CGTGTTGGAG TTGCTGTTTT CTTTGCTGTG 120
TTTTTTTTTT TATTCGTGTG TTGGTGGTGA AATCGTGGGG AGAGAAAAAG ACGAGAAACA 180
AGAAAGATGC AAAAGGTGAA GAGCTGTTGG CTTTGAAGAT GGAGGTGTGG CGATAAATAC 240
TGTGGTGTGA AAGTGATGGT GGACAGGCTG ACCAGAAAAA CTACACGAGC GATTAAGTGC 300
GAGGGGTCTG CAGGATCTTA TGGGGATTGA AAGCCAAGGT GGACCTGTAC AGAATCAGCG 360
TTGTTTGCCG GGTCAGTTAT TTAGGTCATT CACATTCATT CATACACCCA TACAATTCAC 420
ACCCATTGCT ACTCAATTTC ACAAACTTTC TTTGCAATTC TCTTTCTCTC TGGTTTCTGT 480
TACCTCAGCC ACACGTTATT ATTGTTTGTT TGATTGATTG TTTGTTTGAT GTTTTCTTTC 540
TTTTATTTTA TTGACTTATC TAAGCAGTGA TTTTTTGTTG TTAAAAATCG TTCAACAAAG 600
ATTGAACAGG GGTAAAAAGA ATTAGGTATT ATTTAGAAAA TATATTTTTT GTACTGTGTG 660
ATAAAAATAC AACAGTTGAT TTCATTTAAA GTGTGTTGCG TTGTTATTAT TTATCCTTTT 720
CTTTTGCATT GTGTATGGTG GTTAAATGCC GGCTGTAGCT AACCAGGGTA TTGGTAAATG 780
TTTTTCTTTT TGGCAAGTAA ATCTTGTCTG GCGCCCAAAG TTTAATTAAA AATATTGATA 840
ACTAATTTTT TTTTTTGTTT GAGGTCTGCT GGGAGTGAGA TTAAGGGCCG GGAAAATCT 899