EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-39374 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr3:30424288-30425112 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ArntlMA0603.1chr3:30424790-30424800GGTCACGTGC+6.02
Foxa2MA0047.2chr3:30424778-30424790TGTTTACATTGT+6.04
Foxd3MA0041.1chr3:30425063-30425075GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr3:30425067-30425079GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr3:30425071-30425083GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr3:30425075-30425087GTTTGTTTGTTT+6.32
IRF4MA1419.1chr3:30424661-30424676TGGTTTCGGTTTTGG-6.78
IRF5MA1420.1chr3:30424662-30424676GGTTTCGGTTTTGG-6.2
IRF9MA0653.1chr3:30424662-30424677GGTTTCGGTTTTGGT-6.66
Enhancer Sequence
CCTGTCTTGT GTTTGTTGAC GTTGCCTGTT TTGTTGTCTT GTGGTGTTTC TTGTCTGTCT 60
TGTACCTTGT TGGATGTTCC CTTTAGGGAC GCCAGGTGGC GTCCCTTTTG GGGGGGGGTA 120
GTGTCAGGGG TCTGCCAATC TGATCTTGTA AAAACTTGTT TTGGTGGCGG ATCTCTGACA 180
CTACTCGTGT CCGGTCCTGT TTCTGTCTCT GTGTGCGCGC GCGCCGTCGT GGGTGTACGC 240
AGAGTGTGCG CGCTCCTGCT TGACGCGGCC GCGTGCGCGC TCTGCGTCCC TCAGACGCGT 300
GCGCTCTTGT ACTCGTGTTT GTGTTTTCGT CTGTCAGCAG CATGGTGTTT CATTCCCAGC 360
GTCTCAGTCT TGTTGGTTTC GGTTTTGGTC GGCGCTGGGA TGAAGCATGC ATGCTGCATA 420
TGTGAGCGCA TGGTGAGTTC ATTCATCGTG TGCTCGTGTC TTGCGTCTTT TGTCAAAGCA 480
CGTGGCTCGG TGTTTACATT GTGGTCACGT GCTTTTGTCG TGTGCTTCAG TGTTGTGTTA 540
TGTGAGCGCA TGGCTTGTAT TGTCTCTCTG TGTCATGCGC TCTCCCGTCT ATTGTCTAGT 600
TCCACCCTCC TTGTTAACCC ATTATTAGTT TGTCATGTTC ACCTGTGTGT CAATTTACTT 660
TTTGCTTTAT AATCCCCCTC ATGTTTTCAG TCCTTTGCGA GTTCGTCATT ATATGTAGTC 720
GATGTTTACC TGTCTTGCTG TGTCCAGTCC TGCCTTGTCG TGCCTGCCCA GTCAAGTTTG 780
TTTGTTTGTT TGTTTGTTTG ATTTATTGTT TGTTGTAGAA GTGT 824