EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-39372 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr3:30421828-30423081 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ArntlMA0603.1chr3:30422116-30422126GGTCACGTGC+6.02
FOXE1MA1487.1chr3:30422451-30422466GTTGTTTATTTTGCC-6.16
Foxa2MA0047.2chr3:30422104-30422116TGTTTACATTGT+6.04
Foxd3MA0041.1chr3:30422389-30422401GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr3:30422393-30422405GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr3:30422397-30422409GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr3:30422401-30422413GTTTGTTTGTTT+6.32
IRF4MA1419.1chr3:30421987-30422002TGGTTTCGGTTTTGG-6.78
IRF5MA1420.1chr3:30421988-30422002GGTTTCGGTTTTGG-6.2
IRF9MA0653.1chr3:30421988-30422003GGTTTCGGTTTTGGT-6.66
Enhancer Sequence
GCGCGCGCGC CGTCGTGGGT GTACGCAGAG TGTGCGCGCT CCTGCTTGAC GCGGCCGCGT 60
GCGCGCTCTG CGTCCCTCAG ACGCGTGCGC TCTTGTACTC GTGTTTGTGT TTTCGTCTGT 120
CAGCAGCATG GTGTTTCATT CCCAGCGTCT CAGTCTTGTT GGTTTCGGTT TTGGTCGGCG 180
CTGGGATGAA GCATGCATGC TGCATATGTG AGCGCATGGT GAGTTCATTC ATCGTGTGCT 240
CGTGTCTTGC GTCTTTTGTC AAAGCACGTG GCTCGGTGTT TACATTGTGG TCACGTGCTT 300
TTGTCGTGTG CTTCAGTGTT GTGTTATGTG AGCGCATGGC TTGTATTGTC TCTCTGTGTC 360
ATGCGCTCTC CCGTCTATTG TCTAGTTCCA CCCTCCTTGT TAACCCATTA TTAGTTTGTC 420
ATGTTCACCT GTGTGTCAAT TTACTTTTTG CTTTATAATC CCCCTCATGT TTTCAGTCCT 480
TTGCGAGTTC GTCATTATAT GTAGTCGATG TTTACCTGTC TTGCTGTGTC CAGTCCTGCC 540
TTGTCGTGCC TGCCCAGTCA AGTTTGTTTG TTTGTTTGTT TGTTTGATTT ATTGTTTGTT 600
GTAGAAGTGT TTTCCCCCTC GGGGTTGTTT ATTTTGCCTT TTATTTTATT TTTTAATGAA 660
TAAATCCTAC TTCACTCTGC GCTTGGGTCC TTGCTCCTTT TTCCCTTTAC CGGAACGTGA 720
CAGTACGAAC TCGCCAAAAA TGAGGACCCA GCAGAGTGAA GACAGCCCCT TCTCCAGCCG 780
CATACTGCAG CTCATCAGTC TGCAGTCGCT GCGGCAACGT GGCATGAAGG TGGAAAGTTT 840
TGCGGCTAAA TTTTGTGTGG CAGCAGAGGG GCTGGGGTTT AATGATCAAG CCCTGGTGAA 900
CCTCCTTAAC TATGCCCTCG ACAAGCCCCT CAATGTCCAG CAGATGCTGA AATTGGGAGG 960
GCTATCTTAC CATCAGTTTG TGGAGCATTT GGTTCATCAG GCTGCTTATG GCGAACATCC 1020
CAATCCCAGC TCTCTGTTGC CCTCTGCTCT GCAGCTAAAG GAGAGAGTGA TCCTTCAAGA 1080
GAAGAGGATC CCTTACACCA GCGCCACCTC CCAACACATG TCCAGCCCGC AAGGGCTGAC 1140
CCGCACTCAA AAGCGGAGGT TAAAGAGGAA GACCTCTGCT GCAGTGTCGG CTCCAGCCCC 1200
AGAGCGCCCT CCAGTGTCGG CTCCAGCCCC AGAGCGCCCT CCAGTGTCGG CTC 1253