EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-39350 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr3:29520040-29521180 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr3:29520421-29520433GATTGTTTGTTC+6.02
MEF2AMA0052.3chr3:29521010-29521022GCTATTTTTAGA-6.52
MEF2BMA0660.1chr3:29521010-29521022GCTATTTTTAGA-6.22
MEF2CMA0497.1chr3:29521009-29521024TGCTATTTTTAGATC-7.68
MEF2DMA0773.1chr3:29521010-29521022GCTATTTTTAGA-6.14
ZNF263MA0528.1chr3:29520843-29520864TCCCCCTCCCTCTCCCCCTTC-6.2
ZNF263MA0528.1chr3:29520861-29520882TTCTCTCCCTCCCTCTCCCTC-6.52
ZNF263MA0528.1chr3:29520874-29520895TCTCCCTCTCCCCCTTCCTTT-6.81
ZNF263MA0528.1chr3:29520887-29520908CTTCCTTTCCCTCTCTCCTCC-6.82
ZNF263MA0528.1chr3:29520846-29520867CCCTCCCTCTCCCCCTTCTCT-7.06
ZNF263MA0528.1chr3:29520867-29520888CCCTCCCTCTCCCTCTCCCCC-7.45
ZNF263MA0528.1chr3:29520840-29520861CTCTCCCCCTCCCTCTCCCCC-7.4
ZNF263MA0528.1chr3:29520855-29520876TCCCCCTTCTCTCCCTCCCTC-8.18
Enhancer Sequence
TTAAAATAAA CTGTAAATGG TGACGGGTAT TTTGGCAATA ACGAAATTAA GATAAAGGCT 60
GTGCAAGTTG TTTCTCCACT TCTCTTCACA ATCTGGCATT AGGGCGGCGG TGAAGCTGAA 120
TAATAAAAGA ATAATGCCAC CATTAGCCTG TATACTCTGT CTACATTATG ATTATATGGT 180
TTATTTAATA TTTATATATA ATTTAAAAAC CCTTTACGCA CCAAGATTAG GCTACGTGTG 240
TTTGTGGAGG AACATTATTA AATCCACTGC CTTTAGCGCA GTCTCTCACT CATGGTGCGT 300
CCAGCAGCTG AACACCCTTT CCTGCTGCTA CAGGTCGAGA TGCAGAGTTC TGATCCGGCT 360
GATTTTGCAA GTTTTTGGTA GGATTGTTTG TTCATCTTCT ACCAGTCAGG AACATGCATT 420
TAATTTTCCA TGACAGCAGT TTCACTTTAG CGAATGGCCT CTTCTTTTTA CCTGTCAGCT 480
TGCGGTTTAG GGCTCTACCG TAATACGCAG TGTATGAGCG ACCGCCAAAT ACCTGCGGCT 540
GGAATAACCG CTCCTTCTGA GCTAGTGACT GACTTGACCG CCGTCAAAAT TCTCTTTTTT 600
TACTACTTCG TCATCATTTG TTTTACCTTT GCAGGGATGG ATTTTAATGC AGGGATTTGG 660
ATTTTTTCGG GTCTCACCGG GTTCGGTCAA AGATCTTTAG CTCTAATGCA GACCTCTCGT 720
TCATATTAAC CACGTCTCCC TTCTGTTCAG TTGAAACTCC CAAACTGCAG GACACTTTGA 780
AGCGCGACTC GTCACGTCAC CTCTCCCCCT CCCTCTCCCC CTTCTCTCCC TCCCTCTCCC 840
TCTCCCCCTT CCTTTCCCTC TCTCCTCCAC ACTGTCCCGT GATGACAACC ACACATACGT 900
TTTTGTAGGC ATTAAATAAA GGATATTTAA TATTTTATGA CGGTATAACG GTATTGAAAC 960
TGACACCGTT GCTATTTTTA GATCCCGCGG TATACCATAA TACCGTAATA CCGCCCAAGC 1020
CTACTGTACA GGAGACAGGA CACGTAGAAG ATGATCAACA ATGATCTACA GCCAATCAGG 1080
ACACAGAACA CAATGCGCTG TAGAAAAAAA GCTTGTTAAA TTGCACGATT GCGAAACTGC 1140