EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-39140 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr3:23937090-23937897 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NR4A1MA1112.2chr3:23937277-23937287GTGACCTTTA-6.02
SIX1MA1118.1chr3:23937168-23937179GAAACCTGATA+6.32
SIX2MA1119.1chr3:23937164-23937180AGCTGAAACCTGATAT+8.12
Sox3MA0514.1chr3:23937443-23937453CCTTTGTTTT+6.02
Enhancer Sequence
TAAGTAAAAT CCGGTTTAAG AAGACATTTT TTTTGTTTTA GCAGCATCAT GAAAAACCTT 60
CTCACTCTTG GTCAAGCTGA AACCTGATAT GACTGGACTG GATGTTCGCT AAATGTCTGG 120
TTTATGTTTT TGGCCTAGTT AACCTATTAT TCCAAAAAAA AAATTTTACC TTTAAAGCAT 180
ATAAAACGTG ACCTTTAAGG CATATGTATG TTGTTGTTTT TGTAGTAGTA GTTTCATTCT 240
TATGTGCACA TGTACTGAAG ACTCTCACAT CTGGCAACCA GTTTTAAGCC GCAGTCCAGA 300
TTCTGAAACC TGCATAAAGT TTCATTTTGG TGGTTTAAGC CAAAGTCCAG ATGCCTTTGT 360
TTTTATTTTC GGCTCAAATA TAAATCAATA CCAAATGGCA AAGTATATGG GATCTGCCTA 420
CAAGGAACAA ACTCGATGAA GTTAATAGGG TTGTCAAAAG TAGTTCAGGA CCAATTGGTA 480
CTAACGTTTT TGAAAATCAG TCGACTCATC AGTGGACAGC TCTTGTATGT CAGCTCATAT 540
GCAGACCAGC TGATTGATGC AACTTTGAAA CACTCCAGTG TCTGTATCCG TGTTTGCTCT 600
TTGTGAAAAA AAGAGTGGTG AACTGATGAC CATTAAGGCT AATCAAGGTA ATTTCTGTTG 660
AGCATGTGAA CACAATAGCC AACCAGCAGT GTTTAAGAAT GCGCTTAATG GCACTCACAT 720
GTTAGGGAAC TGAAAATGGA CCTTTTTAAA ATTTGTACCA ACCTTGATAT TTTTGACATC 780
ACAAGAAGTT AACCCCAATG TTGGGAT 807