EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-39123 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr3:23429937-23431165 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BACH2MA1101.1chr3:23430818-23430832CCTGACTCAGCAAG+6.25
HNF1AMA0046.2chr3:23431069-23431084TGTAAATAATTAATT-6.38
HNF1BMA0153.2chr3:23431070-23431083GTAAATAATTAAT+6.42
Lhx3MA0135.1chr3:23431075-23431088TAATTAATTAATA+6.25
Lhx3MA0135.1chr3:23431072-23431085AAATAATTAATTA-6.71
POU4F1MA0790.1chr3:23431070-23431084GTAAATAATTAATT+6.11
POU4F2MA0683.1chr3:23431070-23431086GTAAATAATTAATTAA+6.39
POU4F3MA0791.1chr3:23431070-23431086GTAAATAATTAATTAA+6.38
POU6F1MA0628.1chr3:23431077-23431087ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr3:23431077-23431087ATTAATTAAT-6.02
Enhancer Sequence
CTTATATGAT CCACTGCGCA CATGGGTTGC CTATACTTGA TGCACAGCAC TCATAATTTC 60
ATTATCTCGT CAAACTTCAA AACCAGCAGG AAATTCTAGT TTACAGTGAA GAAGTATAGG 120
CCTGGATTCG TCTCAAGCAT GTGGGCCAGT GTACGTTCAG CTCTCTGACA ACGCCCAATT 180
ACCACAATGA ATCTGTCACA TGGGCAGGCG CAGAATGTGC TAGAAAACTA TAGGTAACAT 240
ATAGGCGCCG AATATCCATC CATATCAGCA GGAAATAGCA TGGTGTTTCG TGCTCGTTCG 300
AGTGGTTTTC CACAAATGCA TGCAAATAAA GAAATACCCA TTAAAACAAG TAGTTTATTT 360
AATGGAATCA TGTGCAACTC CCATTCTGTT GTTTTAAAAC TTTATTACAG TGCCTTTTTA 420
CTGCACTACT CTCTCCGCTG TTATGCAGCA ACAAATCAGC ATGCTTAATT ACATTACACT 480
TCATGCAACA ATATTCCCCG TTAAATTGCA TTTATCTCAG CCACATCGAA TTAATGGTGT 540
CAAGTGTGAG GATCTGCTTT TACATCACAG CCTGCAGTGC AGCAGAAGCT GAATCTCACG 600
GGCTGGATCG CTTGCTCGCA CGCCGCGCTG TGGCTCCAGC TCCTCGGCAG CAGTGAGGGG 660
GAGACCTGCC TTCATTCATA AAGTCACCGG GCTACTCGAG AGTACTACAG CTCCGTGAAA 720
GAGGCGGTGC GCGGCGTCAC TGCACCGCCC ACCCTGAGGA ACGGAGGGGG TTGGTGGAGA 780
ACAGATCTGC ACGTTCACGA GGAAATGGGG GTGTGTAACG GAACAGAAAC TGTCTCATAC 840
AGAACCGAGC ATCCACGCTA TAAGTGGCAC AATGCAGTGC ACCTGACTCA GCAAGGTCTA 900
ATAACGATTT TGTCACGATT TGCACCGCTT CCAGTGCCGT TCTCTTTAAG AGCGCAGCTT 960
ATGGGTTATC GGAGCAGCCT ATGGATTTAC CGCGCTCTGC CATAAAGATT AGCAAACGAA 1020
TAGATTCCAT CATGTTCTGC TCATAAAACG CGCCATAAAA GAGCGGCAAT CATTGCAGAT 1080
AAATTATTTC GTTTCATTCT GAAGTGATCG TGCACATTAG TTTATGTCGG ATTGTAAATA 1140
ATTAATTAAT AATTCGATAC TCTGAATGTC TATGTTGCGA GCTAATGTCA TTTGATATTT 1200
ACTTGGATGA AAGGTGCATA TTTTAAGC 1228