EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-38974 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr3:17783281-17784567 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ArxMA0874.1chr3:17783835-17783852ACCGCTAATTAACGGAG-6.3
IRF3MA1418.1chr3:17783443-17783464CAGTTTCCGTTTTATTTCCTG-6.31
MEOX1MA0661.1chr3:17783838-17783848GCTAATTAAC+6.02
Rarg(var.2)MA0860.1chr3:17784010-17784027TGACCTCTGCTGAGCTT-6.62
Enhancer Sequence
TAGTTCACGT GAATAAAGCT GAATATACGG CATTACGTGA GAATTAAACC CATCCGGAAT 60
GAGGCTCGCG GGAGCGCGCT TAAAATCAGC CCCTGTTGAG AGCGTGTGTG TGATCTGCCT 120
CTCCCTTCCG CGTCCTCGTG CACGCAGCAG CAGCTCAAGT GCCAGTTTCC GTTTTATTTC 180
CTGATTATTG CTAGTCCTCG GAACGGACAG GCGGGGGTTT CTGCAGCGGA GAAACGTGGA 240
ATTTGGCCGA ACGGCGCTTT TGAACCTTCA GCTTCGGGAA CAGTGACAGC TTTTCTACAT 300
CTGCCAGCGT TATAATCCAG TGAGTAAGTT AGTGTTTACG CAGTTTTTAA TCACATTTCC 360
CAACCAAGTA ACGTTAAGTT TGATTATATA AATGTATATT GGTTTTTGAA ACAACGTGTT 420
TAGGTGTAAC ACACAAAAAT GGCCTGTGCT TTTTCTTTTT CCAGATGCGC GGGCACTGCC 480
ACGCTGATTT GTTTTGTCTG CATGCAGCGT GGTCGGGCAC TGCCACTCCC CGAAACGCCT 540
GGCTTTGCAT TGTTACCGCT AATTAACGGA GTTCTCATTT AAAACGTGTT CATTGTAGAT 600
TTAGGCGTTG AATTGTATTT AGTGTAATTT GTGCTTATTT TGTAAACCCA CGCTCAAATA 660
TTCCCTGAAG TTGTCTAATA ATTGCGTTTT TGGATGGTTC AGTCTCGTTA TATCCCGCGT 720
GTAAGTGCTT GACCTCTGCT GAGCTTGGAT GGTCACCACT GTGAGTCCGT CTGCTGGGCG 780
TTTGGGCTCT TCTTTGTCTT CCACAGATTA GGTGGCGTGT CCGAATCTAA TTTGCTCACA 840
CAAAGGGTGC TTATCAAAGC CCACAAGCTG CCTACATAGA CAGCATTTGG ACTTCACGTT 900
TGCTTTTCTG AAAGTGCTTA GCAGGCAGCA CACTTAAAGG CATAGTTCAC GCGCAAATTA 960
AATTTTGCTC TCCCTCAAGT GCTTGTACAC CCTTTTAGAA GTTTATTTAT GAAGATATCC 1020
TGAAGAAAGC TTTAACCATT GACTTCCATA GTAGGGAAAA CAAACACTGG AAGTCGAAGG 1080
TTGCAGGCTT TCTGCTTTCT TCAGTATACC TTTTGTTAAA CAGATGAAAG TCAGTCACAC 1140
GGGTTTGGAC GAAGTAGTGG ATGAGTTAAA GGGACAGTTC ACCAAAAAAT GAACTTGTAT 1200
AGCGGCCTTT TTTGTTTTTA CTAATATGGA AGTTAATGGT TACCTGTTTG TAGCATTCTT 1260
CAGAATATTT AGTTTAACAG AACAAA 1286