EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-38556 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr3:9004493-9006367 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr3:9006122-9006141TGCTGTCCTCTGCTGGCGG-6.07
HNF4A(var.2)MA1494.1chr3:9005208-9005223GGGTTCAAAGTTCGA+6.09
Hnf4aMA0114.3chr3:9005208-9005224GGGTTCAAAGTTCGAA+6.33
RXRGMA0856.1chr3:9005208-9005222GGGTTCAAAGTTCG+6.13
SOX10MA0442.2chr3:9006266-9006277GTCTTTGTTTT-6.14
TCF3MA0522.2chr3:9005799-9005809AGCAGGTGTT-6.02
Enhancer Sequence
CAATGTGTGG TTTAGAGTTC GGCCTTTTAT ATGGAGAGCA ATATAGAGCC CCTGTTTGTA 60
TAGGCTGGCA CCACAGAGTC TTGTTTGATG ATGACAGAGC AGGCCTCTGG CATGGTCTGG 120
CCTGAGTGGG GCTTCTTGAG GGTGACAGCC ATCGTGGTTG GCTGTGAGAA GTGTGGGTGC 180
CTATCACCGG TCGTTAAAGG TGTCTATATA TATGCCTGAA GATGTATCAG GCTATTAGCT 240
CTGATGTGAC CATCGTGCGG CGGGGCCGTG AGAGTTAGGA CAGGATGGGT CAACCATCCG 300
CCGTTCCGAT TCAAGTTCAA TGTGCAAATG CTGTGGGCAG TTGTCATGTG TGAGAGTTCA 360
GCATTTGGAC AGTAATGTGT ATGCTTGTGA GTTGAACACA GGTCTGGGGG TGTGTTCAGG 420
CGGAGTGTCG CACCGTGCGA GGCTGATGGC TGCTGGGTTG TCTGCTCAGT GCAAGTACAA 480
TGTCATTCAC AGTCCGGTTA TTCAACATTA AGCCCTTTGA GGCCTGGGGC AGCAAGCGTT 540
GGGGTTGCTA GCTGGTTTGA AGGCTGCAGA GTAGCGACCT TGACCCCCTC TATGTTGTTG 600
AGTTTGGGTT CTCGCGGGTT CCAGCAGTTT CCCGCGACCT CGGTGACCTG ACAGTCTGTT 660
GGGGTTGACC TGACGGCTGT GAGCAAGTTC TCGCACTTGG GCCCAGATTT TAAAGGGGTT 720
CAAAGTTCGA AAGAGGTTCA AACATATCCA GCGGATTTTT ACCATTCAGC AGCAGGTATG 780
TGCCCATTGG CGACGGGTAC ACGGGGTGCA CTGCAGTCAT GGGACAGTAG TTACTTGAAT 840
GGGAGCGATG TATGTGAGTT GAACCTCAGT TGGGCTGTAT GATTTGCACA ATCAGCCTGC 900
CTGGTTGGCA ATTAAGTGTT CGTTTTAGTC TCTGAGCTCT TGCTTTGAGT TACTCAAACA 960
GGAAAGATGA CATTATTGTG AGGTCTGCTC CCGTGCTGAC GCGCGTTTTT CATCTTTCTT 1020
TCATCTCCAC GGTTACAGCC AAGTAGCGCG TTGTTGCCAC GCCATTTTGT TCAGGTTCCC 1080
CAAGAGTTGA AGTGCAGGGG CCTGAGCAGT TGTTTGTACG CAGGTGTGGC TGGTTGGTGG 1140
GCTGTGGCTC GGGAGGTAAA CAGACAACCA GACCAGTGTT TCCTGGTACC TGAGGTTGTA 1200
AGCATGGTGG CACTGGCTGC TTCTTGGGGG AAGCGTGATG CTGCAGTTAG ATGCACAGTC 1260
TTTAGCTTGT GTTGGACTCG CAGTACTCTG CGGGGATGGA GCAGAAAGCA GGTGTTCAGG 1320
GGGGTAAATT GTTTTGGACC CCCCTCTAGT CATAAGGAGT CTGGCTTGAC TTCCTGTAGG 1380
GCCCCTTCAA GCTTTTAGCA GTTCTGCTGC TCATGACGCC ACTGTGCCGT TGTTTGGTGT 1440
CAGGTTTTCA CCTTTGGCTT TCTCTGGCGT GTAACTAGCT GGATGCTGGT TGCTTGAGCT 1500
CCTAGCTACT GCAGGTTGGT CATTCCTTGG TTGCTGTTAG GCTCCTTTTG GGCTGCTTGT 1560
GGTGAGTGGC TTGTCCTAGT GTGTCTCTGA GCATCCTGTC TGGTGTTGGG ACATGCGCCT 1620
TCCTGGCGGT GCTGTCCTCT GCTGGCGGAG AAAGGCTTTA ACTCACTGTT GGAAGTCTTG 1680
CGGCTGGGAA ACAGTAGCGT GCCTTTTAAA GTCAGCTCCG GATGAGACTC TGAGACAGGG 1740
TAGCTTGTAG GTGTTTGACA GTCTTTCAAA GCAGTCTTTG TTTTGAACAG ATTTTATGAG 1800
CTAAACTCTG CCGCTGTTGG GTGGTCAGGG CGTGGGGGCA GGGCATTGCC CGAGTGCAGA 1860
CTCACCACAG AAAG 1874