EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-38467 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr3:7936964-7938998 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXE1MA1487.1chr3:7937354-7937369TTTGTTTGTTTAATT-6.26
Klf1MA0493.1chr3:7938572-7938583TGGGTGTGGCT-6.14
SP1MA0079.4chr3:7938590-7938605TAAACCACGCCCCTT+6.61
SP4MA0685.1chr3:7938590-7938607TAAACCACGCCCCTTCC+6.72
SPICMA0687.1chr3:7937719-7937733GAAAAGAGGAAGAA+6.47
YY1MA0095.2chr3:7937124-7937136CAAAATGGCGGA+6.11
ZNF263MA0528.1chr3:7937700-7937721GAAGAAGATGGAGGAGGAGGA+6.07
ZNF263MA0528.1chr3:7937739-7937760GCAGCAGGAGGAGGAGGAGGA+6.07
ZNF263MA0528.1chr3:7937703-7937724GAAGATGGAGGAGGAGGAAAA+6.13
ZNF263MA0528.1chr3:7937748-7937769GGAGGAGGAGGAGATGATGAA+6.66
ZNF263MA0528.1chr3:7937751-7937772GGAGGAGGAGATGATGAAGGG+6.69
ZNF263MA0528.1chr3:7937745-7937766GGAGGAGGAGGAGGAGATGAT+6.86
ZNF263MA0528.1chr3:7937706-7937727GATGGAGGAGGAGGAAAAGAG+6.88
ZNF263MA0528.1chr3:7937712-7937733GGAGGAGGAAAAGAGGAAGAA+7.64
ZNF263MA0528.1chr3:7937709-7937730GGAGGAGGAGGAAAAGAGGAA+8.19
Enhancer Sequence
AAGTATTGGT AAAAATGGCT TCCGAACAAT CTTATCTTTG CTAAATCTGA TTTTATTTAC 60
CACTTTAGTT TAGTTTATTC GCTGAATTTC TTCCGCCGGG CTGCAGGCGG CGCCGGCGCG 120
TCACTTAAAC ACACAAACAA CACAAAATGC AGATGAAATC CAAAATGGCG GAACGACGCT 180
GAAATACGAG AAACCTGTGC GAAAAACATC GGAATAACCC CATAAATCCT GCATATTTAT 240
TCAGAATTGC GTTTGATACT CGATTATAAT CATACACTCA TTCTAAGCGC GACATTCGCG 300
CGCTTTTTGT TTGCCGTTAA AGCCGTTTTT GTTTCGTTGT GAAACCGGCG AGACTGTACG 360
ACCAAACCGT GAAAACAAAC CCGCGTATTA TTTGTTTGTT TAATTCTCAT CGTCGTCGCG 420
TTTAAAATAC GCGTAATTCT CGATATATTC AGCGAACAAT ATAAACTAAA ACAACTTAAA 480
AGACGCGAAT GTTAAACTAG TCTCCATTAC TGATATAATA ACAATAAAGC ATAAACACAA 540
TGGAGAAAAA GCAGAGCAAA TCCGACAAAC ATCACCGCCA TCATCACCAC CACCATCATC 600
ACCATCAAAA ACACCGTCAC CACCACCAGA CCTCCAGCAG CAGCAGCGAC GAGTCCGGCG 660
GCAGCAGCCC GGCCCACAGC GCGCCCAAAG CGGCCAACGC CTTCGCCAAC GACGGCAGCT 720
TCATGGAGAT GTTCAAGAAG AAGATGGAGG AGGAGGAAAA GAGGAAGAAA CAGCAGCAGC 780
AGGAGGAGGA GGAGGAGATG ATGAAGGGCA GCTCGTCTGC AGCTCAAGCT CCGCAGGACA 840
AGAAGGCGTT TAGCGCGAGC AGCTTTGTAC GGACGAGCTT TTCTTGAGCG TAAACTTATT 900
CACAATGTTG AGGTAAAGTT GGTTTTATAT TCGCACATTC GTTCCTTTTA GCGGTCCCCG 960
TAGTGTTTAC CACGCTACTA AGAATATTCG GTCTGAAATT ACATTTGAGA ATGCCTTCAA 1020
AACAACATTA ACACCATTTC GTTGGCTGCT AATATGATTT CCCTATTTAG AATGTGCAGA 1080
CGTTTGGCTA ACGTTAGCTC ACATTGCTAG TTTTGTGGTG AACAATTAAT CTGTGCATGC 1140
CATTTAAGAA AATAGTTTGC CTGTCTAAAA TTAAATTCCT GTTTGGTTTC AGTTAAATTC 1200
ACAGAATACC TGCTAAAAAA TCCAGCTTAA ACCAGCCTAG GTTGGTTGGC TGGTTTTAGC 1260
TGGTCGACCA GGCTGGTTTT AGAGGGGTTT TGGCCATTTC CAGCCTGGTC CTAGCTGGTC 1320
AGGCTGAAAA ATGACCAGCT AAATCCAGCA AAAACCAGCT TGACCAGCCT GGTTTAAGCT 1380
GGACATAGCT GGTTTTAGCT GGGCTCCCAG CCTGCTAGGC TGGTCAAGCT GGTTTTAGCT 1440
GGTCATCTCC CAGCCTAACC AGCTAAGACC AGGCTGGAAA TGGCTGGAAA CCAGCCTGGA 1500
AGTGGCCAAA ACCCCTCTAA AACCACCCTG GTTGACCAGC TAAAACCAGC CAACCAGCCT 1560
AGGCTGGTTT AAGCTGAATT TTTCAGCAGG GACGTCAGTC TGATATATTG GGTGTGGCTG 1620
ACAAGTTAAA CCACGCCCCT TCCAACTGTC AGTTTAGACA CAAAAAACGG CGAGTCGTCG 1680
TTTGTTAGGG GTCGATCACA CTGAATGCTA TTTTACGTTC CAATAAAGCG TAATAAGCAG 1740
CGCGCAAAAT GTTCAAAACG TTCAGATCAT GCTATTTCGG CACGATTTCC TTGAAGTTCG 1800
GAGTCATAAA CGACAATTGG GTGTAGTGAC AAAAGATTAA ATCGTTTTAT AGTTCACGAC 1860
AATCGATACC AAGCCTGCGA CACTTCACGA CACAATCGTA GAAAGTCTAG CATGTTTAAT 1920
TTTTTTCTCG TTTTTCATGA CGGGTGACCC AATAGGAACA CATAATATCT CGGTTATATC 1980
AGTGCTGCCG TTATGCGCTG GTTAGGTAAT AATAATTATT TATTTTATTT GTAA 2034