EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-38434 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr3:7654161-7655715 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE40MA0464.2chr3:7655358-7655368ATCACGTGAC+6.02
Foxq1MA0040.1chr3:7655512-7655523TATTGTTTATT+6.62
MITFMA0620.2chr3:7655354-7655372TTTAATCACGTGACCTGG+6.32
MITFMA0620.2chr3:7655354-7655372TTTAATCACGTGACCTGG-6.32
POU1F1MA0784.1chr3:7655113-7655127GTCATTAGCATATT-6.54
POU3F2MA0787.1chr3:7655114-7655126TCATTAGCATAT-6.27
POU3F3MA0788.1chr3:7655114-7655127TCATTAGCATATT-6.11
SREBF2(var.2)MA0828.1chr3:7655358-7655368ATCACGTGAC+6.02
Srebf1(var.2)MA0829.1chr3:7655358-7655368ATCACGTGAC+6.02
TFEBMA0692.1chr3:7655358-7655368ATCACGTGAC+6.02
USF2MA0526.2chr3:7655356-7655372TAATCACGTGACCTGG-6.5
ZNF263MA0528.1chr3:7655132-7655153GGGGGAGGAGGCAGGGAGGGG+6.58
Enhancer Sequence
TAAAATGACT AAAGCTTAGA ATCACTTTAT TCACGTGACC TGGGGCCTCA TGTATCAACG 60
CTGCATACGC ACAAAAACTT TGCGTACGCC AGGTTTCACG CTCAGAATCG CTCACGTTTG 120
GATTTACTAA CAATGAACTG AACGTGGGAA TGTGCGCAGG TTCACGGCAG CTTTCTGGCA 180
GGCGTACGCA CATTTTTTGT GCGTGTCTGT TTTATTTCCA TTGGCGACTC CTAGAGGCAG 240
TTGTGTTAAA TTCCTCTCTA CAAAGTGTCT GAGCCTTGCA ATGGCAGCTG TATGAGACGG 300
GTTCATATAG TAGGTATGTA AGATTTCCAT ACCATACAGT TGACCAGCTA AACATTAAAG 360
CGCAAATTGC AGCAGTCGCA ATGTAATCTG AGCAATCTAC CGCACGCACA TTGCTATAAA 420
GACACTATCT GAAGATGAAT TTGCATGCGT GAATCAGAAA CATTTCCATT CAATAAATGT 480
GCAAATAAAA TATGATGCAC AAACTTATTA ATGATTCCTA CTTGTCTTTC TCTTGATAAA 540
TAGTGGGCAA AATCTGATAT GTAGCGGGGA AAAAAGAAGA AAGAATTTAT CAGTCGCTGG 600
ATTCGAGCCG AGTTTACGCT CGAATATGTC TGTACATGAT CTCAGGCTTC TTATGAGGTG 660
CGCCACTGAG GCCGCTTAGG GTATTGCAAC ATTTTACAGA TATAAACCAC ACTATTTCTT 720
TTTTAAATGC ACTCAGTGCG ATATGTTCAG ACCCAACTGT GTTAACCGTA TCAGCTAAAC 780
TCCCACTCTA TTTTTTTCTT TTGTTGTTAA TTCCGGAGAA GAAACTTGCA AATAACACCG 840
CTTTTCTCCG GTCTACCTCC GAAAGCAGCA CCTCCATTTC ACATTCTGTT CAAAGTTTCT 900
CTTTTTGCTT GCTTTTGCCA TTGCTTTTTC GTTGGGTTTT GCCATTAGCA TAGTCATTAG 960
CATATTCATA CGGGGGAGGA GGCAGGGAGG GGTTTTGTGC TCGTGCATGT TGCGCTCAGT 1020
TTCACGTTCA TTCAGATGTA CAAAAGAATA TGCGTGAGAT TCGGCGTACG CAGTGTTTCA 1080
TACATCTGAA TTTTTTTCTG CGTACGCACA TTTACAGCTT CGTGCGTACG CAATGTTTTA 1140
GTAAGATTTC CACGCAAGTC TTCGTACATG AGGCCCCTGG TGTTTCAAAT CACTTTAATC 1200
ACGTGACCTG GCTGTTTCGG ATCATGCTTC GCTGCAGTGT TTTTCAAAAA AATTACGCTT 1260
TTGGATATGA ATACTGTGTC GAAACATCAG TTTCACGTCA TCCATCCCTA ACAATGAGTT 1320
TTCCTTGCCG TGTTAAACCC TTGCCTTGTT TTATTGTTTA TTCCTGTCTG CTGCCTGCCT 1380
TTTGACCCTC CGCCTGTTGT ATGACCACGA TCCTGGATTT GCCTGTATAC ATGCGTTTGC 1440
TCCTGTATCG ACCGCTGCTT GCCTGACCAT TCTCTTGTAA TAAACCTGCA TGTGGATCTG 1500
CAATGACCTG GAAATGAAAT AAAGGAATAT TTGTAACACA AAGTATTTGA ATGT 1554