EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-38341 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr3:7116386-7117174 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EOMESMA0800.1chr3:7116809-7116822GTTTTCACACCTC-6.78
KLF13MA0657.1chr3:7116839-7116857GAAAAGTGGGCGTGTCCA-6.67
KLF14MA0740.1chr3:7116842-7116856AAGTGGGCGTGTCC-7.06
LMX1BMA0703.2chr3:7116935-7116946TTAATTAAATT-6.32
Lhx3MA0135.1chr3:7116932-7116945AAATTAATTAAAT+6.07
PHOX2AMA0713.1chr3:7116936-7116947TAATTAAATTA-6.62
PROP1MA0715.1chr3:7116936-7116947TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr3:7116936-7116947TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr3:7116936-7116947TAATTAAATTA-6.62
SP4MA0685.1chr3:7116841-7116858AAAGTGGGCGTGTCCAG-6.7
SP8MA0747.1chr3:7116843-7116855AGTGGGCGTGTC-6.37
TBR1MA0802.1chr3:7116811-7116821TTTCACACCT-6.02
TBX2MA0688.1chr3:7116811-7116822TTTCACACCTC-6.14
Enhancer Sequence
GCGCAAGCTA GACGCGAGCC CAATGGAGCG ATTGTTTACA AGTGTGGAGT CCCGTGAAGG 60
AGCTCCGGAT GGAAAGTTTT GTTCTGTGTT TACCTCATAG TTAAAGTTGT TGCACGTCCG 120
CCGGTTCCTG CCTCAAAATG AGCGAATTTG AGCCACTTGT ACATCCAGGA AATGTTCAGG 180
AAAAGCAAAA CAGCAGCGAA GAAACTTGAC ACAGAGGAAC ATTTACACCT CACTGCCAAC 240
TAGCGTTTCG GAAGTGTTAA TTCAGACCAA CAGAGACAGC GCACAGAAGT ATAAATGCAC 300
AGCTGCGCGC GTTGCATGCG CCGTGGGTTA CGCCGGTCAC TTGACGCAGA AGTATAATCA 360
GGCTTTAGCC AGAACTCGTC CTAAGACTTA AAGGGCCATG AAACCCCCTC ATTTCAGCTG 420
GGTGTTTTCA CACCTCTACT TTGGAAAAAG TTAGAAAAGT GGGCGTGTCC AGCTCTGTTT 480
AGGGGGGAGT GTCGGAGGAA GAAAAGAGGC TTGGTGTGGG AGTGTCTATT TGGGCACGCT 540
GAATTTAAAT TAATTAAATT AATCATGATA AAACAGGCGG CAGCTGTGCT CTGTCACTTT 600
AATGATTTCG CTTTCATGTG TCTTTTGATC CTCAACTCGT TTGTTTATTA CAAAATGAGG 660
GTTAATATGA ATAATCACTA AACACAGCGT TTTAACACCT ATTTGAACAT TAAAGCGCTC 720
ACGTTAATGA CTTTATATGT GTGTGCGCTC TGCTCGTCAC AATGTGCGAA TGAGATCAAG 780
TGCAGACA 788