EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-38214 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr3:5703396-5704726 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr3:5703704-5703720AATTAAGTAAACAATT+6.51
FOXC2MA0846.1chr3:5703707-5703719TAAGTAAACAAT+6.92
FOXD2MA0847.2chr3:5703705-5703718ATTAAGTAAACAA+6.98
SPICMA0687.1chr3:5704537-5704551TATTTCCTCTTTTT-6.13
Enhancer Sequence
CTCCTGGTAA TTAGTTATCT CTTAAGAGCG ATCACTATCT GTTCATTGGC TACTACAGCA 60
GAGGAATTTT CGAGATCTAC CTGAGCTCAA ACTCCCCTCT CGCCTTGCAA ACGGGAGGGA 120
GCCCCGGGCT CGAGGATCTC GGTCTCTCCC GGGACTATCT CTTTATAAAT AATCATCAGT 180
TAAGTGTGAA CTCTTGAAAA GGTCAAAAAG GTCATGAGAA GCAAATAAAG ATAAGCTAAT 240
TTTATGTACA TTTAATGTTA TATATGCGAG TGAGTGTTTC AAGTCATGAA ACTAGAGAAG 300
CTTAATGCAA TTAAGTAAAC AATTTTCCCA ATGCTCAAAG TCTAGTGTGA CCGCACCTTT 360
AGAGTAGATG TGCTTTCCCT GAGGATCTGC GGCGGGACGT GTCTCCTAGT TGTGAGTATA 420
TAAGATATAC ACTATATATG ACAAATGGAT TTTCTGACTG AGCAGTCCTC GTCGTGGACA 480
GTGATGCATT CTGAGGCACC TGCGCAATCT CGAATGAGAC TTTTTATGGA GAATAAAACA 540
ACGCCTCAGT TGGACGCTGA TTGCAGGATT GCACTTCTTT TGTAGCGATT CAAATGTTCA 600
AATAAGAAGG CGACTCAACG GGAAGTCTGT CTCAGTGGGA AGTCGTTGTA AACGACCCAG 660
GACTCGTGGA CTCACTGCAG AGTCTGTTGG TTTGAGCATC AGCATATATG AGCAATTCCA 720
GCGATATGGA TGTGACGTTT GCAGTAAAAT CTCGCAGAGA ACGTACACTC ACCTGTCACT 780
TTATTAGGTA CACCTTACTA GTACCGGGTT GTACCCCCTT CTGCCTTCAG AACTGCCTTA 840
ATCCTTCATG GCAGAGATTT AATAAAGTAC TGGAAATATT CCTCAGAGAT TTTGCTCCAT 900
ATTGACATGC GTTTCCTGTT CTTAGCTGAC AGGAGTGACA CCCGATGTTG TCTTCTGCTG 960
CTGTAGCCCA TCCGCCTCAA GGTTGGACGT GTTGTGTGTT CAGAGATGCT CTTCTGCAGA 1020
CCTCGGTTGT AGCGAGTGCT TATTTGAGTT ACTGTTGCCT TTCTATCAGC TGGAACCAGT 1080
CTGCCCATTC TCCTCTGACA TCAACAAGGC ATTTACGCCC ACAGAACTGC CATTCACTGG 1140
ATATTTCCTC TTTTTCAGAC CATTCTCCGT AAATCCTAGA GATGGTTGTG CGTGAAAATG 1200
CCAGTAGATC AGCAGTTTCT GAAATACTCA AACTAGCCCG TCTAGCACCA ACAACCACGT 1260
TCAGTCACTT AAATCCCCTT TCTTATGCTC TGTTTGAACT GCAGCAGATC GTCTTGACCA 1320
TGTCCACATG 1330