EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-38098 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr3:3824587-3825274 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr3:3825180-3825191ATATTAATTAA+6.62
LMX1BMA0703.2chr3:3825183-3825194TTAATTAAAAC-6.14
YY1MA0095.2chr3:3825256-3825268TCCGCCATCTTG-6.27
Enhancer Sequence
GCTCTGCTCT GTACCTGCTC AGGTGAGGAG CGCAGCTTAA ATGTTCTCCG TCAGGCTATC 60
CTCATACATG GATCAGCAAG CAACAAGCTG CGTGTGACAG AGTTAAGTTT TGAGACTACG 120
TTTTTGCGCG TCATCAGAAA ATACCGTTAA GTGTTTAGGC GGAGATCATT TGAGTTATGA 180
TTAACGTTAC TTTTCTTGCG CCTTTCGTTT CCGAAGTGCC TACAGATCGC GAAGATAATA 240
GCACATTCAC AGACTGGATG GAGTTCAGCG CAGCGCCATG ACATGCGGTT GTGAGAGCGC 300
GCGTCTCCAT GACAACTTCA GCACAGGCTG AGAAAAGGCA TACTCGCGCC AAGATTTAAA 360
TTTTTTTGAA AAATGTAATC TGCCGATTTT AAATATTTTT GTCTTTATCA CACTCTGTTA 420
AAATTCAGAG TTAACACATT ACAACTAACG CTAACATTGC ACTGATTCTA ACTTTTTAAA 480
CAGTAATGTT AACGTTAGTT AGCAACAAGT GAGGCTAAAC ATGTTTTCTG TAATGTACGA 540
CATGTAAACG CACCCTGATT AACTCTACAT TACATTGAAC TGTTACTGTG ATTATATTAA 600
TTAAAACATA CATTTAATAT TTCTTGGATT TGTAAATATT TTACTTACTG TAGTGTGAAG 660
CGAGGCCGAT CCGCCATCTT GAAAAAA 687