EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-38060 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr3:3180812-3181457 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CUX1MA0754.1chr3:3181279-3181289TAATCGATAA-6.02
CUX2MA0755.1chr3:3181279-3181289TAATCGATAA-6.02
FOXK2MA1103.1chr3:3181069-3181080ATGTAAACATG-6.14
HNF1AMA0046.2chr3:3181361-3181376GATTAATCATTAACT+6.31
HNF1AMA0046.2chr3:3181361-3181376GATTAATCATTAACT-7.58
HNF1BMA0153.2chr3:3181362-3181375ATTAATCATTAAC-6.02
HNF1BMA0153.2chr3:3181362-3181375ATTAATCATTAAC+7.34
ONECUT1MA0679.1chr3:3181276-3181290TAATAATCGATAAT-6.17
ONECUT2MA0756.1chr3:3181276-3181290TAATAATCGATAAT-6.32
ONECUT3MA0757.1chr3:3181276-3181290TAATAATCGATAAT-6.05
Enhancer Sequence
GAGGCGGGGC TGCAAACGTT CGCCTATCTG ATTGGGGCTT TTCCTCAATA TTAAGTAGCC 60
CACACACACA GTTCAGTCTC GCATCCTCTT CTTGTCAGTT CAGACTTCGC AAGTTTGATC 120
AAGGCTGCAG TCTCCCCGTT CTCAGTTTGA TATGGAAAAC ATACCGAGGA CACTGGTAAA 180
TCTTCAAAGG GAACAGTGTA CTTTATAACT TCATTCACAT CACCTTGGCT ACGTTGTTTC 240
ACTTTCTCAA CAATAAAATG TAAACATGAT TTAAGGAACT GCCTATTTTC TTTTTAATAT 300
TAGCAACTTA ACAGACAGCA GAAATGTTGA GGCGTCGTGC TGCATATATG AGCGTCATCT 360
TCACTGTGTG GATATTTATA ACAAAACGGA GCCGATAACA ACTGCCTCCT TTCAATTTCA 420
GTGAAAATAC GAAACACAGC CTCTCTTTTG CTGAATATCA GTTTTAATAA TCGATAATTA 480
TAAAAGTATA ACATACAATA AGTTTATACA TTGTAGGAAA TAAAGGCAAG CGATCAGTCA 540
ATGTACCTGG ATTAATCATT AACTTATCTT TGCGCTTAAC CAAAACATGT TACCCGTGAA 600
CAAGTAACTT AATAGATTCC AATGACCAAA GTCAGGGAAT TGGCC 645