EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-37948 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr3:1518175-1518844 
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE23MA0817.1chr3:1518811-1518823AAACATATGCTA+6.32
HNF1AMA0046.2chr3:1518427-1518442GTTTAATTATTAATT-6.41
POU2F1MA0785.1chr3:1518439-1518451ATTATGCAAATG+6.62
POU4F1MA0790.1chr3:1518434-1518448TATTAATTATGCAA-6.56
POU4F2MA0683.1chr3:1518432-1518448ATTATTAATTATGCAA-6.48
POU4F3MA0791.1chr3:1518432-1518448ATTATTAATTATGCAA-6.68
RFX1MA0509.2chr3:1518484-1518500AGTTGCTATGGCAACA+6.78
RFX1MA0509.2chr3:1518484-1518500AGTTGCTATGGCAACA-6.78
RFX2MA0600.2chr3:1518484-1518500AGTTGCTATGGCAACA-7.13
RFX2MA0600.2chr3:1518484-1518500AGTTGCTATGGCAACA+7.15
RFX3MA0798.1chr3:1518484-1518500AGTTGCTATGGCAACA-6.79
RFX3MA0798.1chr3:1518484-1518500AGTTGCTATGGCAACA+7.02
RFX4MA0799.1chr3:1518484-1518500AGTTGCTATGGCAACA-6.52
RFX4MA0799.1chr3:1518484-1518500AGTTGCTATGGCAACA+6.92
RFX5MA0510.2chr3:1518484-1518500AGTTGCTATGGCAACA+7.38
RFX5MA0510.2chr3:1518484-1518500AGTTGCTATGGCAACA-7.42
Enhancer Sequence
GCAGACATAC ATGAATAAAG AAGATATGAA CACACACACA CACACACACA CACACACACA 60
CACATACACA CACACACACA TACTTGCACA CACACACACA CACACACACA CACGTCCTCA 120
ATAGAGCAAA TATGTAATGG CAGAGGGGGG ATATTGCTCC CTCAGGAGTG ATCCCATTGA 180
TGCCGATGGG CACGCGCGCG CGCGCGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTTTCTG CTGTGAGTTA 240
TTATTTATGA ATGTTTAATT ATTAATTATG CAAATGCTGT GGTCATCATA GTAAATACTG 300
TGAGTTAACA GTTGCTATGG CAACACAACA AAAACGACCC ATCACTGTAC TTTACACTAT 360
GATAGAGCGG CACGGTGGCG CAGTGGTTAG CTCTGTGTCC TCACAGCAGG TCTCTGGTTT 420
GAGTCTCAGC TGGGTCAGTT GGTGTTTGTG TGTGGAGTTT GCATGTTCTC CCAGTGTTGG 480
TGTGGGTTTC CTCCGGGTGC TCCGGTTTCC CCCACAGTCC AAACACATGC GCTATAGGGG 540
AACTGATCAA CTACACTGGC CGTAGTGTAT GAGTGTGTGT GTGTGAATGG GTGTTTCCCA 600
GTGCTGGGTT GCAGCTGGAA GGACATGCAC TGTGTTAAAC ATATGCTAGT GGTTCATTCC 660
ACTGTGGTT 669