EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-37877 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr3:662423-663127 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BATF3MA0835.1chr3:662566-662580TGATGACGTCAGCT-6.31
BATF3MA0835.1chr3:662566-662580TGATGACGTCAGCT+6.57
ELK3MA0759.1chr3:662870-662880TACTTCCGGT-6.02
ETS2MA1484.1chr3:662871-662881ACTTCCGGTC-6.02
ETV1MA0761.1chr3:662870-662880TACTTCCGGT-6.02
ETV4MA0764.1chr3:662870-662880TACTTCCGGT-6.02
Lhx3MA0135.1chr3:662919-662932GATTAATTAATGT-6.03
POU1F1MA0784.1chr3:662963-662977AATATGCTAATGAT+6.58
POU3F2MA0787.1chr3:662964-662976ATATGCTAATGA+6.27
POU3F3MA0788.1chr3:662963-662976AATATGCTAATGA+6.11
POU4F1MA0790.1chr3:662917-662931ATGATTAATTAATG+6.04
POU6F1MA0628.1chr3:662920-662930ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr3:662920-662930ATTAATTAAT-6.02
Enhancer Sequence
CAAACAGCAT TCAAATTCAA GTAAATGTAT TATTTACTTG ATTTTCTTTC ATATAAAGCT 60
AAATCTTTCG AGCGTTTAAT TCCTCTCGTT AATATTAAAT CTATTTCAAA AAGCCTAAAA 120
CTAGCGCGGT GTTTATGACG CGCTGATGAC GTCAGCTCGC GTGCGTCCTC CCCTCAAATC 180
GCTCCGTGCG GAAACTGGCG GCGCGCGCGT GGCACGAGCG ACCGGAGGAA CAGACACAGA 240
TCAGACGCGC CGCTGCGCTC CGGTGTGTTG AATGAATAAA TAAACCCTCG ACGCGTTTAC 300
CGATGACCGC GAGCACTGCA CGGTGAAGGT GAGCAACCGA GGATTTAGAT CCGCATCACA 360
CACATACACA CACACACACC GCTGCAACAT CTGCACTGCT CGAGATTATA CTGATCATCA 420
TAATAATCCG GTGTCGTGAG TGAGGGGTAC TTCCGGTCAC CGATAATCTC AGAGCAGTGC 480
TAGCGTTAGT AATGATGATT AATTAATGTA CTATAGTAGA GCACACAGCT GCTGGTGATA 540
AATATGCTAA TGATGTGGTT TCCTGATGCC TGCATCATCT CTCCGGAACC CTTCTGCTCT 600
GGATATTAGT ATGCTGATGT GTGGAGGACC CGAGCTCTGA CCTGGTTTAT CAGCACACCT 660
GCGCTACAGT CCCGCTGTCT GACTGCTTTA ACAGTGGATA TACA 704