EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-37681 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr25:34541813-34543149 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX1MA0878.2chr25:34542416-34542427GTTTTATTGCC-6.32
CDX4MA1473.1chr25:34542416-34542427GTTTTATTGCC-6.62
FOXF2MA0030.1chr25:34541846-34541860AATGTTTACCTTTA-6.27
HOXD9MA0913.2chr25:34542416-34542426GTTTTATTGC-6.02
SOX13MA1120.1chr25:34543041-34543052TGCCATTGTTT-6.62
Sox6MA0515.1chr25:34543043-34543053CCATTGTTTT+6.02
ZNF384MA1125.1chr25:34543077-34543089TTTTTTTTTAGA-6.52
Enhancer Sequence
GATTAAAATC TTGTAATTAT TTAAATTTGA GTCAATGTTT ACCTTTATTT AAAAAAGTCT 60
ATTTAAGCAT TGAAATAACA ATAAATACAT ATTAAAGAAG AATAAAATTA ACCGTTTATT 120
AAAAGAGGAA GCTTAAATCA ATGACACGTT TCATACAATA AATTGTCATT CAAAAATATA 180
TTAATTGCTA AGCATGCACA TTTGTGTGAT GAATATAAAA TTATTTTGCA AACAGTTGTA 240
TAGTTGAGGT AACCTAAATC ATTCATAAAA TCACCCACAC ATACAAAACC TTTTTAAAAT 300
TACTCCAGTT TATGAATTGG GATTGAAGAG AAGATTGACC ACCTTTAATT TTGAAAAGAT 360
ACATAAAAAG CTTTGTTACT CGATTTATTG AAATTAAAGG AGATAAGCGC ATCATCTTTT 420
CCTATTAATC TTTTTTAACT ATTAGTATCA TAAATCGTTT AGTCTCTACA TTGCAAACTT 480
AACTCATAAT AGTTTTAATT GTTATAACTC CAGTTGATCT AAATGTTTTC TCAACTAACC 540
AAATCCAACA TTGTATTTTG AAAACAAATC ATAATAGCTT TCATTATCAT ATTAAATTTG 600
TATGTTTTAT TGCCCTTTAA AGAACAAGTG GGTGGCTCTT AAAAGAGCCT TTGGGGAAAT 660
ACAAAATGGA AATCAAGCTA ATTTATTTGC CTTTGGCGGC CTTCTCGGTT TTCTTGGGCA 720
GCAGCACGGC CTGGATGTTG GGCAGCACAC CGCCCTGAGC GATGGTCACT CCGCCCAGAA 780
GCTTGTTCAG CTCCTCGTCA TTGCGTACCG CCAGCTGCAG GTGACGGGGG ATGATACGGG 840
TCTTCTTGTT GTCCCGAGCG GCGTTTCCAG CCAACTCAAG GATCTCAGCG GTCAGATACT 900
CGAGCACAGC GGCCAAGTAG ACTGGAGCAC CGGCACCAAC ACGCTGAGCA TAGTTACCCT 960
TGCGGAGAAG CCTGTGAACA CGGCCAACGG GAAACTGAAG TCCTGCCCTG GAGGAGCGAC 1020
TCTTAGCCTT CGCTCTGGCT TTTCCGCCGG TTTTGCCTCT TCCGCTCATG TTGCTCAGAC 1080
AGTTCTCAAA GACTACGATG TTCTGAAGCT CGACAATCAG CTTTTAAAGC TAACGTACTT 1140
CCCGCCTATT GATCAGAATC TCTATCAGTT GAAAACCAAT CACCGCACTT CCCTCCGAAT 1200
CGCAAGACCC TCCCTCTTTG CAAACTCCTG CCATTGTTTT GTTACAGTTT AAATATAAGA 1260
TTAATTTTTT TTTAGATATT AAATGCTATA AACTACAAAT ACGTGTGAAA GTGTGGAATA 1320
AATTATGTTG TAATTA 1336