EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-37601 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr25:31778267-31780056 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EBF3MA1482.1chr25:31779359-31779373CTTCCCTGGGGACG-6.34
IRF1MA0050.2chr25:31778895-31778916AATGAGAAACTGAAAGTGTAT-7.18
Lhx3MA0135.1chr25:31778329-31778342AAATTAATTAAAT+6.07
Rhox11MA0629.1chr25:31779911-31779928AAGCAGCTGTAAATGGT+6.04
Sox3MA0514.1chr25:31779466-31779476AAAACAAAGG-6.02
Enhancer Sequence
GAAGATTTTC AAAAATAATT ATTTTTAATA AAGTCAAAAA GGTTCACAAA AAGTTCAAAA 60
ATAAATTAAT TAAATAATTA AATCAATTGA AAGAACAAAA AACTAAACAA GGAAAACAAA 120
CTGAGTTCAA ACCAAACAAA TCATGTCTAA ACCAAAAACA GAACTCCATG AAATGACAAG 180
ACAGACCACA TTTATAGCAC AGGGACTAGT CCACATTAAA CAAGAAGGGG GAGACAAAAA 240
CATACAATTT ACAAATACAA TAAACTAAGC CAAACATCTA AATACAAATC TAAATATAAA 300
GTTAAATAAA TTATAAATAA GGCAAAACTA AATATAAATC TGAATAAACA AACATTGCAA 360
ATCATTATTG AACCTAAACT AAACATGAGC TCTCCCTCCA AGCCATTAAG CCAATGGTAT 420
CGGCAGGCGG AACCAAAAGA CGGCATCTCG CGGCACGTCG GACCTTTACT TGGGCGGACC 480
ACACCCGGAA ACTCTGTTCC TCGTCGGCAC TGCAGCACGG TAACTTAAAC TCAAAAGAAA 540
ACTAAATTAA CAAAACATAC AGTACAGATA ACCGATTTTG TGTGCACCCA AAATAGTAAT 600
AAATGTACTG TGGAAAATAA AGAAAGGTAA TGAGAAACTG AAAGTGTATG AGTCTTATTT 660
AAATCAGATA TGAATGAAAC GAAAATGTAT AAACACAATA ACTGAACTGT GACCAATAAA 720
TAATCTTAAA TGAATAAGTA TAACGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTATGC 780
CTCACTCTCA ATGTGTGGCC ACCACACTGG CCATCACATA CTCCCTCCCT TCGGGAATGT 840
CACTGGCACA TCGGGACAAG TAGTCAGCCG TAAGGTTTTC TTTGCCAGGG ACATGTCTGA 900
TAATAAACCG GAAGGGCTGC ATGGCCAGGT ACCAGCGGGT AATACGACTG TTGGTATCTT 960
TCATTTCTTG AAGCCATTGT AGAGCTTTAT GATCAGTCTC CAGTATAAAC TCCCGGCCTA 1020
GCAGATAATA CTTTAAAGAG TCCAATGCCC ACTTCACAGC CAAGCATTCC TTTTCCACAA 1080
TGGAATAGCG AACTTCCCTG GGGACGAGCT TTCGACTCAA GAAGGCCACG GGGCGTCGAG 1140
TGTCAGGGCT GCCCTGTAGC AATACAGCTC CCAGGCCTCG ATCTGAAGCA TCAGTTTGCA 1200
AAACAAAGGG TTGGTGGAAA TCAGGGTTAT GCAAGACAGA ATCTTTACTC AAGGCCTTTC 1260
TGAGATCTTG GAAAGCTGCA ACAGTTTCTT GGGTCCACTT CAGCTGATTG GGACTCCTTG 1320
AACCAACCAT GTCAGTCAAT ACTGCAGCCC GCCCAGAAAA GTTGGGAATA AATCTGTGAT 1380
AAAACCCAGC CATACCCAAA AAGGACCTTA ACTCCTTACG AGTTTGTGGC TGTGGACACC 1440
TTTCAATGGC CCGTACCTTC TCCACCTGGG GTCGGAGCAC CCCTTTACCG ATAACAAACC 1500
CCAAGTACTC TGTCTCTGCC TTTGCAATGG TACACTTTTG GGGGTTAACT GTCAGGCCGG 1560
CTGCCTGAAG GCGTTGCAGA ACTTCCTGGA GATGCTGCAG ATGTTGCTGC CATGTGTCAC 1620
TGTACACCAC AATATCATCC AGATAAGCAG CTGTAAATGG TAGTCCTCGC AGTACCTGGT 1680
CCATTAGTCT TTGGAAGCTG GCCGGTGCCC CATGCAGTCC AAAGGCTAGA ACCTTAAAAT 1740
GGAATAGGCC CCAGGGTGTT TTAAACGCAG TGAGTTCTCT GGACTGTGG 1789