EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-37518 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr25:29265772-29266588 
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ArxMA0874.1chr25:29265841-29265858TTAATTAATTAATGACC-6.06
EWSR1-FLI1MA0149.1chr25:29266191-29266209GGTAGAGAGGAAGGAGGG+6.09
Lhx3MA0135.1chr25:29265842-29265855TAATTAATTAATG+6.46
Lhx3MA0135.1chr25:29265838-29265851TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr25:29265839-29265852AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr25:29265835-29265848GAATAATTAATTA-7.12
PBX2MA1113.1chr25:29265971-29265983CCTGTCAATCAC-7.22
PBX3MA1114.1chr25:29265968-29265985CCACCTGTCAATCACTT-6.14
POU4F1MA0790.1chr25:29265833-29265847ATGAATAATTAATT+7.82
POU4F2MA0683.1chr25:29265833-29265849ATGAATAATTAATTAA+7.91
POU4F3MA0791.1chr25:29265833-29265849ATGAATAATTAATTAA+8
POU6F1MA0628.1chr25:29265840-29265850ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr25:29265844-29265854ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr25:29265840-29265850ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr25:29265844-29265854ATTAATTAAT-6.02
SOX10MA0442.2chr25:29265903-29265914GTCTTTGTTTT-6.14
Enhancer Sequence
ACGAATAAGG GTGTCACGAT CCTCCAAATT TTCGATTCGA TTTTCGATTC GATTTTCGAT 60
TATGAATAAT TAATTAATTA ATGACCAATT AATTATTTGT AGCCTACAGT TTAAACTACC 120
TGACCTGCAT GGTCTTTGTT TTACCCATAA ACAAATCATA CAGTAAATGA ATAAAGGTAA 180
GTTACACACA TAATTACCAC CTGTCAATCA CTTTTTCTGC GGGACTCGTG AATAGGCAGT 240
GATCTGTGTC GTTATAATGG CGTCGGTAAA AAAGACGCAC AACCAACGGG AACCAGCCAA 300
CAGTATCTGA GGTGTTCGCT AAAATGACTA AGTGCAAGTG AGTGAAAGAT TGAAGCAGTC 360
CTCTGACTGC CTGGACCTGC TGTCTCGAGC GCATGTCTGT GTGGATGTGC ATTTTCAGAG 420
GTAGAGAGGA AGGAGGGCTG CTCAGAAATG CTACACGCCA CTGTGGATGT CAAATCGTTG 480
TCGTTCTAAA ATGCCATTTA AAAATAAAGA CGGTGTAAAC AGGGCCTGAG TGTGTACTTT 540
TTGCGAGCGG ATTTGCAACG GGGGCGGGCG GAGGATCGCA ATGCCGGTGT TGTCTATCGG 600
ACGAACAGTA CGTAATACGT ACATAGCAGA GCTTGCAAAA CGGTGATTTT TTTTTGTCGA 660
CAACACGAAC GTTGTCAACA TAACTCACTG AAAATCCAAA ATGCTTACAC ACCGGCGACT 720
TCATTCAAGA GGAGAGGGTT TAAGCTCTGT CGACGGGTCT CCTGCTTCTG CAGTCTAACA 780
AGCACTTCAA CAAGCCTGTT TTTTACCCGC TTGGCA 816