EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-37299 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr25:25748290-25748880 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr25:25748598-25748615ACTGATTAATTAAATCA-6.36
CTCFMA0139.1chr25:25748764-25748783GGGGGCCCCCTGGTGGCCA-6.93
CTCFMA0139.1chr25:25748533-25748552AAGCGCCACCTGGTGGCGG-7.24
CTCFLMA1102.1chr25:25748765-25748779GGGGCCCCCTGGTG-6.43
FOXA1MA0148.4chr25:25748485-25748501GTTTGTTTACATAACG-8.27
FOXC2MA0846.1chr25:25748486-25748498TTTGTTTACATA-6.74
FOXD2MA0847.2chr25:25748487-25748500TTGTTTACATAAC-7.04
FOXK2MA1103.1chr25:25748486-25748497TTTGTTTACAT-6.32
FOXP2MA0593.1chr25:25748486-25748497TTTGTTTACAT-6.14
IRF7MA0772.1chr25:25748726-25748740ACTAAAACGAAAGT+6.18
LMX1BMA0703.2chr25:25748603-25748614TTAATTAAATC-6.02
Enhancer Sequence
AGCACATAGG AAGTTGCACT GGCCGCGGGC ACGCGCGAGC GATATAGCGA AGTGAAAGCG 60
CGTCTGTTAG AAAGAAACTA GTGGCAAATT CGGGGGAGCT GGATGTCTGA AACACACAAA 120
TACATTGGCC CAGCTTGGAC AGAAGAAAGT GTCTGTATGC CTGAGATATT CACCATTGCA 180
ATCATCTGTC TTTCAGTTTG TTTACATAAC GCTGGGGTAT GTCCGATGAT CCGCCATTAC 240
GGGAAGCGCC ACCTGGTGGC GGCTGGGTGT ACTGTAGCTA AAGCGGTTAT CTGTTGTCGG 300
GGTTGAAAAC TGATTAATTA AATCAGATCT TTTGTAAATT TAGGTAAATA TCTTGGCGCC 360
TGAGTATGTA TCGCGTCATA AATAACACTA TAAATGGGCA TATAATTTGT CCCACCACTA 420
ATCCACAACT TGACAAACTA AAACGAAAGT CACACAATAA TTTTAAGCAC TCTTGGGGGC 480
CCCCTGGTGG CCACGGGGCC CTAAGCAGCC GCTTAGTTCG CTTATGCCTT GGGCCGGCTC 540
TGAAATAGAG GATAACTTTT TGTTAAACAA AACCTGTTTG TTAAAAAAAA 590