EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-36966 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr25:17519655-17520864 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr25:17520599-17520618TTGCCAGTAGGGGGCAGAG+7.14
IRF1MA0050.2chr25:17519669-17519690AGAGAGAAAATGAAAACGAAA-6.16
IRF1MA0050.2chr25:17519675-17519696AAAATGAAAACGAAACTTAAC-7.08
IRF1MA0050.2chr25:17519882-17519903ATACACTTTCAGTTTCTCATT+7.18
IRF3MA1418.1chr25:17519672-17519693GAGAAAATGAAAACGAAACTT+6.98
IRF9MA0653.1chr25:17519677-17519692AATGAAAACGAAACT+6.41
Lhx3MA0135.1chr25:17520457-17520470ATTTAATTAATTT-6.07
Enhancer Sequence
AGATAAGCTC TCACAGAGAG AAAATGAAAA CGAAACTTAA CAGCAGTGTG ATGGCCAGTG 60
TGGTGGCCAC ACATTGAGAG TGAGGCATGC ACGCACACAT ACACACACAC ACACACACAC 120
ACACACACAC ACGTTATACT TATTCATTTA AGATTATTTT TTGGTCACAG TTCAGTTATT 180
GTGTTTATAC ATTTTCGTTT CATTCATATC TGATTTAAAT AAGACTCATA CACTTTCAGT 240
TTCTCATTAC CTTTCTTTAT TATTCACAGT ACATTTATTA CTATTTTGGG TGCACACAAA 300
ATCAGTTATC TGTACTGTAT GTTTTGTTAA TTTTAGTTTT CTTTTGAGTT TAAGTTACCG 360
TGCTGCAGTG CCGACGAGGA ACAGAGTTTC CGGGTGTGGT CCGCCCAACT AAAGGTCCGA 420
CGTGCCGCAA GATGCCGTTT TTTGGTTCCG CCTGCCGATA CCATTGGCTT AATGGCTTGG 480
AGGGAGAGCT CATGTTTAGT TTAGGTTCAA TAATGATTTG CAATGTTTGT TTATTCAGAT 540
TTATATTTAG TTTTGCCTTA TTTATAGTTT ATTTAACTTT ATATTTAGAT TTGTATTTAG 600
ATGTTTGGCT TAGTTTATTG TATTTGTAAA TTGTATGTTT TTGTCTCCCC CTTCTTGTTT 660
AATGTGGACT AGTCCCTGTG CTATAAATGT GGTCTGTCTT GTCATTTCAT GGAGTTCTGT 720
TTTTGGTTTA GACATGATTT GTTTGGTTTG AACTCAGTTT GTTTTCCTTG TTTAGTTTAT 780
TGTTCTTTCA ATTGATTTAA TTATTTAATT AATTTATTTT TGAACTTTTT GTGAACCTTT 840
TTGACTTTAT TAAAAAAATA ATTATTTTTG AAAATCTTCT TTTTTGTATG CCCCTTACTG 900
TACGTGCTGG CTCGGTCCCT CACAAGTGGT GTCAGAAGTG GGATTTGCCA GTAGGGGGCA 960
GAGTTTTTTT TTCCTTGGTG AACTTTCTGG GCCATGAACC GAGGAGGACG AAGAGGAGCC 1020
CCAAAGGCTG TTTCAGTGGA GCAACTGGAT GAAGTTGCAC AAGAGCTGGG GGATGAAGAA 1080
TTACAGGAGG TGAGAGAATT TGATGTGGAG ACTGAATGCA CTGAACCAAC AATAGCTGAC 1140
TTGACAGGCT TGTTGAGAGC TCACATGGTA AAAATGGAGG CTCAGGAAGC ACAAAGGATG 1200
GCAGAGCTG 1209