EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-36836 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr25:14140115-14141736 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CUX1MA0754.1chr25:14141673-14141683TAATCGATAA+6.02
CUX2MA0755.1chr25:14141673-14141683TAATCGATAA+6.02
RFX5MA0510.2chr25:14140396-14140412GGTTACTTTAGTAACC+6.08
SP2MA0516.2chr25:14140853-14140870AGGGGGGGGGGACTTAA-6.62
Enhancer Sequence
GGAACGGAAG CACTATAAGT GGATTTGATT GTAAAATCCA CGCATTGGGA GGTTCGGTTC 60
AGAAGCTACT CGTCTGAAAG AGTATTGAAC GGGCCAATTA AGAATGAATT GGCAGCGCAA 120
GCCTGCGCAG GTGAGCGGCA TAAGCAATCA ACTGAGTATA TAAGCTCACC TGGCGCCAGC 180
AGACGCTATC CTTTTTAAGC TGAAGAGACT TTCAACAGCT AAGGGACAGT CATTATGGCG 240
ACGGAGTATA GTGCTTCCGT TCCCCTCCTC GGGGAACGAA GGGTTACTTT AGTAACCTCG 300
AACGTTCCCC TTCGGGGGGA ACTTCAGCAC TATAAGTGGA TTTGATTGTA AAATCCACGC 360
ATTGGGAGCC CATTGAAAGC GCCATAATGA CTGCACCTTA CCAACACCCC CGATGAGGAG 420
ATAGTCAAGC AAGCGTGACG CACCCACATC ATGGGGGGCG CGGTCCTCCA ACGTGTCCCT 480
GGCCCTAATT TATCCTACTT CAACAGAAGT TTTACGGATT TATATATATT TTTTGGGAAG 540
TCGTGAGCAT CTAGATAATT CTAGGAAAAT ACGACAGTAC GTTGGGAAGC GTGCAATCCC 600
GATAGGGAGG ACGCTGCGGA GGCCATCCGT TACCCAAGGG GGGATAGATG GCAGAATTTA 660
CATATGGACT AGCCCTAAAA AGGGGGAGTA CGCATAGCAA AAGAGTGGTT AGCGGGGAGG 720
GAAGACACGG GTCCGCCCAG GGGGGGGGGA CTTAACCGTG GCTGAATAAG CATATGGGAT 780
CGCCTAGTGG GGACCACACA TAGCAGGCAC CTTTACCCAA AACGCGGGCT GACCAGCGGG 840
CAGACCTACA ACGTAGTGGG CCAGCAAGTG ACTCCTCCGC TGAGTCAGTG CTGGGGGCCA 900
CGGAGGAATC TGCAGGGCTC ACCTGACGGG GAACTTTACT GACAGATAAA AAGGCGCACG 960
TATCTCCGTG TTAGGGAAAA TGGCGCAGCA AGCGTGTTTC AACACCCTAC CGAATTGTTC 1020
CCTCAATCAC CAAGGGTTAC CTAATACCCT TGAGGAAACC GGCTCCACTC GCAGATTGTA 1080
AAACCTTGCA AATGTGTTGG GTGTCACCCA GCCCGCAGCT CTACAGATGT CTGTTAGAGG 1140
GGCGCCGCGT GCGCGCGCTC GAGAGGATGC GAAGCTCCGA GTGGAGTGCG CACGCGCTCT 1200
CGGGGGACGC GGCTCATCTC GGCTCTGATA GTGAAAGAAA GGCATCCACA ATCTAGTGGG 1260
AACTTATTTC GGTACGGCAC TTCCCTGCTG CCGACCGCTA TAACAGACGA AGAGCTGCTC 1320
AGATGATCTA AACTCTGAGT GCGGTCCGGA TAATACGCAA AACGCGAACT GGACAATAAA 1380
TAAGGGCTGG GTCTGCCTCC TCCGAGGGCA GCGCTTGCAG GCTCACTACC TCGTATAAAA 1440
ACGGAGTGGT AGGAACCTTG GGCACATATC GCGGGCGGGG TCTCAGGACG AGAGAGAAGC 1500
CAGCCCAATT ACAGGCACGA GTCACTGACC GAAAAATGCC TCCGGGTCCC CGACCCTCTA 1560
ATCGATAACA ACGCGACCAG CAGAGCTGTC TTCAGGGACA GAAATATACT GAGTCGAGGA 1620
T 1621