EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-36431 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr25:3521141-3522138 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HOXA9MA0594.2chr25:3521321-3521331CGTTTACGAC-6.02
RFX1MA0509.2chr25:3521351-3521367TGTTACCATGGTAACA+7.41
RFX1MA0509.2chr25:3521351-3521367TGTTACCATGGTAACA-7.41
RFX2MA0600.2chr25:3521351-3521367TGTTACCATGGTAACA+7.37
RFX2MA0600.2chr25:3521351-3521367TGTTACCATGGTAACA-7.37
RFX3MA0798.1chr25:3521351-3521367TGTTACCATGGTAACA+7.39
RFX3MA0798.1chr25:3521351-3521367TGTTACCATGGTAACA-7.39
RFX4MA0799.1chr25:3521351-3521367TGTTACCATGGTAACA+7.07
RFX4MA0799.1chr25:3521351-3521367TGTTACCATGGTAACA-7.07
RFX5MA0510.2chr25:3521351-3521367TGTTACCATGGTAACA+7.49
RFX5MA0510.2chr25:3521351-3521367TGTTACCATGGTAACA-7.49
Enhancer Sequence
CACGTTAATC TGCAATGGTA GTTAAACAGA ATAACATTAC GAGCTTGCAA ACTCACCTAC 60
ATCGTGGTTT CGCTGCAGGG CGTCTATCAC TGATGTTTTA AAAAAATAAA TAAACATTAA 120
ATATGTTTAA ATGATCTCCG TTATCGAGTA TGACACATAA ATGCTGCTCA AACGATTAGC 180
CGTTTACGAC GCTAGCAAGC TAGCTGCTTC TGTTACCATG GTAACAGCAT GACGCTCATC 240
CTGATCCTAA TAATTCATTT TAAATTGAGT GCCAAATAAA TAATAGTTGA GAAAACAGAA 300
CGGATTATTT AAATACATTT TAACGTGTTG AATGTATGTT TAATATCACA AATTCGACTA 360
CTCTACGAGC ACGGAACTCG CTGTTTTTTC CTCTGCATTC ACACGGAACG TCGGACACCA 420
ACACGTCACT AAGTAGGCGG AGCTTTAGGG TTTCCATCGT GCATTGGACG GTTTGAATCA 480
ATGACAGACA TGCGTTTCCT CCAATAAGTA CACAACTTGC TTTTTCCTCA AACCTGATTG 540
GGTAAATCTG TCTTGACGGA CAGCAGTACT GTCCAATCAC ACTCAAGGAT TCACTGAAGC 600
GACCGTTCGT AGCTTATTAT TCGTCAAAGC AGAATTTAAA ACTATTTAAA CCGTTTTGAG 660
CGGGTGCCTA GAAAACAAGA GGCAGCCTAG TCGAAGAGAG AAACTAGCTT CTAATGTTCA 720
ATTAGCGACT AATGTTTATA AACAAAATAC AAGGAAGGAT CGTAACTTCG GATCGTCGGA 780
TTGTTATTTT TGCAGCGCGA TCGTGAATAA AGGCTAAAGA GGTAGATGTC GATTTAACGT 840
TACGTTTTAT TATGCTGCTT TTTACGTTAG CCAAGCTCGC TAACGTTATC GATTCTTGAA 900
AAAGCCACAT CTGTACTATA ATCGCATGTT ATGTTGAGTG TTTATGTTAT TTTTAATGCT 960
AAACCTTAGA TTACAAAAGA TGAAGAATAG TGTCCTT 997