EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-36401 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr25:2974123-2975253 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr25:2975220-2975239CAGTGCCACCTTTTGGTCA-6.34
CTCFMA0139.1chr25:2974199-2974218CACTGCCCCCTAGTGGTCC-7.27
CTCFMA0139.1chr25:2974943-2974962CACTGCCCCCTAGTGGTCC-7.27
CTCFLMA1102.1chr25:2974200-2974214ACTGCCCCCTAGTG-6.15
CTCFLMA1102.1chr25:2974944-2974958ACTGCCCCCTAGTG-6.15
Enhancer Sequence
CGCATTCACC GATTCACACC AAACTTGGTG TGTGTTATGA CAACTAGGGT CTAAGGTTAA 60
ATGCAGAGTT TCGGCGCACT GCCCCCTAGT GGTCCGGAGA TACTTAAAAC TTGCTTTTTG 120
GCTTATAACG TCTCAACCTT TCGTCCGAAA CTCATGAAAC TGGTCTCATT ACATCCGGCA 180
GAGCATGCCG AGTCAAATGA TGTCTGATTT TCACAGGTCA GCCATTTTGG GCGTCGCCCA 240
TTTCGATTTT TGCCCAAAAA TGCTATATTT TACCAACATA GTCACATATC ATTACAAAAC 300
ATGGTAAGCA TCTGGCACAA TGATAGAGGA CAGTATTAAC AATAATCAAA CCAAATATGA 360
AGTCTCAAAA TCAAACTCTC TAGCGCCACC ACTTGTACAA ACGTTCATGT ATGTTTATCA 420
TGATAAATTT TGAACCAAAT GGGCTACAAT CAAAATTCTT TTTTCCCCTG ATTCCTTGTC 480
TCAGTCCGAT TCAAACGCAC CCTATGTCGT CATTTTCCGT CATGAATTTT TTCGCGCTAT 540
TTAAAATTTT TCGAAAAACC TATTTGATCG AACTTGTCCT AGGCCGTGTC TCCGATTTTC 600
ACCAAAATTT AATCACATGA TCTACAGACC ATGCCAACCA AAAGTTATGG AATTCAAGTT 660
GATTTGACCA ACCGTTTTCG TTAAACTTGC GATCAAATTT AACGTAGAAC TTGCAAAGCT 720
GGACTTGAGA CGATATCTCC GTAACGCATT CACCGATTCA CACCAAACTT GGTGTGTGTT 780
ATGACAACTA GGTTTTGAGG CTATTTGCGG AGTTTCGGCA CACTGCCCCC TAGTGGTCCG 840
GAGATACAAA AAACTTGCTT TTTTGGTTTA TAACGCCTCA ACCTTTCGTC TGAAACTCAT 900
AAAACTGCTC TCATTACATC CGGCAGAGCA TGTCGAGCCG AGTGATGTCT GATTTTTACA 960
GGTCAGCCAT TTTGGGCATC GACCATTTCG ATTTTTGGTG TAAAATGCTA TATTTTACCA 1020
ACACATTCAC ATATCATTAC AAAACATGGT ATGCATCTTC AACCCCATGC CCTGAAAGTC 1080
CTTAAAAACT TCTGGAGCAG TGCCACCTTT TGGTCAAAAG TGCTTGGCCC 1130