EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-34927 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr24:9335315-9336273 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DMRTA2MA1478.1chr24:9335597-9335609ATTGTAACAATT-6.74
SP1MA0079.4chr24:9336163-9336178TGGGGGCGGGGTTTG-6.37
SP4MA0685.1chr24:9336161-9336178GATGGGGGCGGGGTTTG-6.6
ZNF384MA1125.1chr24:9335619-9335631AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr24:9335620-9335632AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr24:9335618-9335630TAAAAAAAAAAA+6.37
ZNF384MA1125.1chr24:9335617-9335629TTAAAAAAAAAA+6.44
Enhancer Sequence
TGTAAGAGCT GTCTTGGCTC GGTTTACAAG TAGGTGAGCG CGCATAGAGC TGCTAAGGCA 60
ATGCGCGAAG AGGAGGGGCG CGTGAGACAC TCCAAACACC CTCCAACACA CACACACACT 120
CCCTCCCGCA CTCTTCCGTT GAGTGAACCG TACTAACTCC GGGAATACAT ACTAAAAGGA 180
CATGGCATAC AAATCAGCCT TCCTCCAAAT CATGGAATAC TGAGAAAGAG TCAGAACTGA 240
GGACGACTGT TTTGGACGTG CCTGTATACT GTGAAATAAG GTATTGTAAC AATTCCTCAT 300
ACTTAAAAAA AAAAAAACTT GCAGCTTGTC TTCATAAACT CAGCGTATTC TGCAGAAAGC 360
TCGCGCGATC GTCTCGATTC AGTCTTGCGC GCAAACTTCT GGACGCAGCG CGATCTGTAA 420
CTGGAGAAGG CGCGCGCATG TTTGCTTTTC TGGTGTTACT GTTGCAGTAA GAAACCCGAT 480
ATGCGATTCA TTCTGGACTG TGGCACGGCT GGAAAGATGC GAACTAAAAA GACAACAATG 540
GCAGGGGTCT GTGCTAGTTG TAACCAGGTG TGCGCGGGGG GCGCTTGGAA CGGACTGCGG 600
GAGGTTTGAA ACTTAGCAGT AGTTTGGATT TTTATTATAA CTTATCGTCT GTCCCATCGT 660
GCCAGTTTCT CATTTAATTA AGAAAAACCC ATTAAGGTTT TGTGTTTTGA GTTGTCATGC 720
TTTGGTTTGC GTGGGTTGAT GCATGGAGTG AGGCAATGGG CTTGGTGTTG GCATGTGTCG 780
GCGTGTTAAG TTTACAGTAG TAGAAGTTTA TAGGGACACT TTAAATTGGC TGGGGCCAAG 840
GTGTGGGATG GGGGCGGGGT TTGACAGCAA AACGAAGAAA CTCTTTATAT GAAAGAATCT 900
TCTAAATAAA TGTTTTATTA ATTTTAATAG GTACCTACAT TTTCAGTTTA TAATGTAT 958