EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-34710 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr24:1019849-1020328 
TF binding sites/motifs
Number: 70             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RFX1MA0509.2chr24:1019860-1019876AGTTGCTATGGTAACA+6.54
RFX1MA0509.2chr24:1019920-1019936AGTTGCTATGGTAACA+6.54
RFX1MA0509.2chr24:1020148-1020164AGTTGCTATGGTAACA+6.54
RFX1MA0509.2chr24:1020205-1020221AGTTGCTATGGTAACA+6.54
RFX1MA0509.2chr24:1019860-1019876AGTTGCTATGGTAACA-6.55
RFX1MA0509.2chr24:1019920-1019936AGTTGCTATGGTAACA-6.55
RFX1MA0509.2chr24:1020148-1020164AGTTGCTATGGTAACA-6.55
RFX1MA0509.2chr24:1020205-1020221AGTTGCTATGGTAACA-6.55
RFX1MA0509.2chr24:1019980-1019996AGTTGCTATGGCAACA+6.78
RFX1MA0509.2chr24:1020035-1020051AGTTGCTATGGCAACA+6.78
RFX1MA0509.2chr24:1019980-1019996AGTTGCTATGGCAACA-6.78
RFX1MA0509.2chr24:1020035-1020051AGTTGCTATGGCAACA-6.78
RFX1MA0509.2chr24:1020265-1020281AGTTGCCATGGTAACA+7.32
RFX1MA0509.2chr24:1020265-1020281AGTTGCCATGGTAACA-7.33
RFX2MA0600.2chr24:1019860-1019876AGTTGCTATGGTAACA-6.82
RFX2MA0600.2chr24:1019920-1019936AGTTGCTATGGTAACA-6.82
RFX2MA0600.2chr24:1020148-1020164AGTTGCTATGGTAACA-6.82
RFX2MA0600.2chr24:1020205-1020221AGTTGCTATGGTAACA-6.82
RFX2MA0600.2chr24:1019860-1019876AGTTGCTATGGTAACA+6.86
RFX2MA0600.2chr24:1019920-1019936AGTTGCTATGGTAACA+6.86
RFX2MA0600.2chr24:1020148-1020164AGTTGCTATGGTAACA+6.86
RFX2MA0600.2chr24:1020205-1020221AGTTGCTATGGTAACA+6.86
RFX2MA0600.2chr24:1019980-1019996AGTTGCTATGGCAACA-7.13
RFX2MA0600.2chr24:1020035-1020051AGTTGCTATGGCAACA-7.13
RFX2MA0600.2chr24:1019980-1019996AGTTGCTATGGCAACA+7.15
RFX2MA0600.2chr24:1020035-1020051AGTTGCTATGGCAACA+7.15
RFX2MA0600.2chr24:1020265-1020281AGTTGCCATGGTAACA-7.44
RFX2MA0600.2chr24:1020265-1020281AGTTGCCATGGTAACA+7.47
RFX3MA0798.1chr24:1019860-1019876AGTTGCTATGGTAACA-6.48
RFX3MA0798.1chr24:1019920-1019936AGTTGCTATGGTAACA-6.48
RFX3MA0798.1chr24:1020148-1020164AGTTGCTATGGTAACA-6.48
RFX3MA0798.1chr24:1020205-1020221AGTTGCTATGGTAACA-6.48
RFX3MA0798.1chr24:1019860-1019876AGTTGCTATGGTAACA+6.73
RFX3MA0798.1chr24:1019920-1019936AGTTGCTATGGTAACA+6.73
RFX3MA0798.1chr24:1020148-1020164AGTTGCTATGGTAACA+6.73
RFX3MA0798.1chr24:1020205-1020221AGTTGCTATGGTAACA+6.73
RFX3MA0798.1chr24:1019980-1019996AGTTGCTATGGCAACA-6.79
RFX3MA0798.1chr24:1020035-1020051AGTTGCTATGGCAACA-6.79
RFX3MA0798.1chr24:1019980-1019996AGTTGCTATGGCAACA+7.02
RFX3MA0798.1chr24:1020035-1020051AGTTGCTATGGCAACA+7.02
RFX3MA0798.1chr24:1020265-1020281AGTTGCCATGGTAACA-7.12
RFX3MA0798.1chr24:1020265-1020281AGTTGCCATGGTAACA+7.48
RFX4MA0799.1chr24:1019860-1019876AGTTGCTATGGTAACA-6.28
RFX4MA0799.1chr24:1019920-1019936AGTTGCTATGGTAACA-6.28
RFX4MA0799.1chr24:1020148-1020164AGTTGCTATGGTAACA-6.28
RFX4MA0799.1chr24:1020205-1020221AGTTGCTATGGTAACA-6.28
RFX4MA0799.1chr24:1019980-1019996AGTTGCTATGGCAACA-6.52
RFX4MA0799.1chr24:1020035-1020051AGTTGCTATGGCAACA-6.52
RFX4MA0799.1chr24:1019860-1019876AGTTGCTATGGTAACA+6.69
RFX4MA0799.1chr24:1019920-1019936AGTTGCTATGGTAACA+6.69
RFX4MA0799.1chr24:1020148-1020164AGTTGCTATGGTAACA+6.69
RFX4MA0799.1chr24:1020205-1020221AGTTGCTATGGTAACA+6.69
RFX4MA0799.1chr24:1019980-1019996AGTTGCTATGGCAACA+6.92
RFX4MA0799.1chr24:1020035-1020051AGTTGCTATGGCAACA+6.92
RFX4MA0799.1chr24:1020265-1020281AGTTGCCATGGTAACA-7.26
RFX4MA0799.1chr24:1020265-1020281AGTTGCCATGGTAACA+7.32
RFX5MA0510.2chr24:1019860-1019876AGTTGCTATGGTAACA-7.13
RFX5MA0510.2chr24:1019920-1019936AGTTGCTATGGTAACA-7.13
RFX5MA0510.2chr24:1020148-1020164AGTTGCTATGGTAACA-7.13
RFX5MA0510.2chr24:1020205-1020221AGTTGCTATGGTAACA-7.13
RFX5MA0510.2chr24:1019860-1019876AGTTGCTATGGTAACA+7.14
RFX5MA0510.2chr24:1019920-1019936AGTTGCTATGGTAACA+7.14
RFX5MA0510.2chr24:1020148-1020164AGTTGCTATGGTAACA+7.14
RFX5MA0510.2chr24:1020205-1020221AGTTGCTATGGTAACA+7.14
RFX5MA0510.2chr24:1019980-1019996AGTTGCTATGGCAACA+7.38
RFX5MA0510.2chr24:1020035-1020051AGTTGCTATGGCAACA+7.38
RFX5MA0510.2chr24:1019980-1019996AGTTGCTATGGCAACA-7.42
RFX5MA0510.2chr24:1020035-1020051AGTTGCTATGGCAACA-7.42
RFX5MA0510.2chr24:1020265-1020281AGTTGCCATGGTAACA+7.54
RFX5MA0510.2chr24:1020265-1020281AGTTGCCATGGTAACA-7.54
Enhancer Sequence
AGTGATTCTA CAGTTGCTAT GGTAACACTA CAACTTCAGC AGGCCTGTTC GATCTGTTGT 60
GGTCATACTA CAGTTGCTAT GGTAACACAC CAATTTCAGT AAGCTTGTTT GATCTGTCGT 120
GGTGATTCTA CAGTTGCTAT GGCAACAACT TCAATAGGCC TTTTTGATCT GTTGTGGTGA 180
TTCAACAGTT GCTATGGCAA CAATTTCAGT AGGCCTGTTT GATCTGTTGT GGTGATTCTA 240
CAGTTGCTAT GGTATCACCA ATTTCAGTAC ACCTGTTTTG TCTGTTGTAG TGATACTACA 300
GTTGCTATGG TAACACAACT TCAGCAGGCC TGTTTGATCT GTTGTAGTGA TACTGCAGTT 360
GCTATGGTAA CACAACAACT TCAGTAGGCC TGTTTAAACT GTTATGCTGA TTCTACAGTT 420
GCCATGGTAA CACAACTTCA GTAGGATTGT TTGATCTGTT GTGCTGATTC TACAGTTGC 479