EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-34522 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr23:44470175-44472497 
TF binding sites/motifs
Number: 31             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE40MA0464.2chr23:44471079-44471089ATCACGTGAC+6.02
MITFMA0620.2chr23:44472122-44472140ACGGGTCATGTGACCCTT+6.04
MITFMA0620.2chr23:44472122-44472140ACGGGTCATGTGACCCTT-6.04
NFYAMA0060.3chr23:44471555-44471566GACCAATCAGA+6.14
NR2C2MA0504.1chr23:44472273-44472288AGGGGTCAGAGGTCA+9.03
NR2F1MA0017.2chr23:44472279-44472292CAGAGGTCACGGG+6.52
Nr2f6MA0677.1chr23:44472274-44472288GGGGTCAGAGGTCA+7.03
PBX2MA1113.1chr23:44471851-44471863CCTGTCAATCAC-7.22
PBX3MA1114.1chr23:44471848-44471865TCGCCTGTCAATCACAC-6.51
POU4F3MA0791.1chr23:44470698-44470714TTGCATTATTCATGAG+6.74
RFX1MA0509.2chr23:44472017-44472033CGTTACTATGGCTACC+6.68
RFX1MA0509.2chr23:44472017-44472033CGTTACTATGGCTACC-6.68
RFX2MA0600.2chr23:44472017-44472033CGTTACTATGGCTACC+6.74
RFX2MA0600.2chr23:44472017-44472033CGTTACTATGGCTACC-6.86
RFX3MA0798.1chr23:44472017-44472033CGTTACTATGGCTACC+6.62
RFX3MA0798.1chr23:44472017-44472033CGTTACTATGGCTACC-6.89
RFX4MA0799.1chr23:44472017-44472033CGTTACTATGGCTACC-6.72
RFX4MA0799.1chr23:44472017-44472033CGTTACTATGGCTACC+7.03
RFX5MA0510.2chr23:44472017-44472033CGTTACTATGGCTACC-6.19
RFX5MA0510.2chr23:44472017-44472033CGTTACTATGGCTACC+6.36
RXRBMA0855.1chr23:44472274-44472288GGGGTCAGAGGTCA+7.06
RXRGMA0856.1chr23:44472274-44472288GGGGTCAGAGGTCA+7.01
RxraMA0512.2chr23:44472274-44472288GGGGTCAGAGGTCA+6.98
SP1MA0079.4chr23:44470721-44470736GTAGCCCCGCCCATA+6.08
SP4MA0685.1chr23:44472156-44472173GCAGCCCCGCCCACATC+6
SREBF2(var.2)MA0828.1chr23:44471079-44471089ATCACGTGAC+6.02
Srebf1(var.2)MA0829.1chr23:44471079-44471089ATCACGTGAC+6.02
Stat6MA0520.1chr23:44472084-44472099GGTTCTCTGGAAAAA-6.2
TFEBMA0692.1chr23:44471079-44471089ATCACGTGAC+6.02
USF2MA0526.2chr23:44471077-44471093CAATCACGTGACCCCA-6.22
ZNF143MA0088.2chr23:44472375-44472391CTCCCATAATGCATCA+7.31
Enhancer Sequence
TTCAGGCAGT CCGCTGGATA CCTATTAAAA GAGGAGGGGC GGTGACTGCG AGCACATGCC 60
TTCATTTAAA GCTCCGCCAT TGGTTGTTCG AGGGGCCTTA ACGTATATCG CGCTTTCTGA 120
TTGGCAGACG CGGCTGTCCG TCAGGCTTGG TCTGTGGTGG AATATATAAG CGCGCTGGTC 180
TGCTGTGCCA CAGGGCGAGA TGGAGCACTG CGAGTTCAAG CGCTCATGAA CATTCGACAG 240
ATCAAAGTCT ATTTTTAATC AGCACCATTT TAGCAAAGTG TTTTTCATAT CTGCAGTAGC 300
GCTAGTCAAG TGCAGCTGTG TGTTTACGTA GCTCTAATGA GCGCGGGTCT GTGTACATAG 360
TGTGTCGTGT GCGCTGTTTT TGTTTGATTT TTGGCGTTCG TGTTTACTTT CAGCGCGAGA 420
GAGCCGGAGA AAATATCTCG CTCAGTACTG TGTGTGTGTC TGTGTTAACG GACGTGTGCG 480
TTTGTGTCGG AAAGGGGGGG AGCTTTCGAG AGTCGCGTTT CCGTTGCATT ATTCATGAGC 540
GTCGCGGTAG CCCCGCCCAT AGGCGGAGTT AGTCAAATTA ACGCGCCGTG GAGCTGTTAG 600
ATGAGCCAAA TGTAACACGT GGGTCACAAG CACATCAGTG CCCATAAAAC TATACAGAAA 660
GCAGGCTCAG AGTAGTCAAG TAAGTACTCA TCTGCAAGCG TCACACATTT ATATCTTGTA 720
TATTGTACTT GAATGGTGTG TTTCTGTGTT TCCAGCGGCT GATGGATGTC TACTGTGATG 780
TCAGTGCAAA GTGAGCTTCC TATTGCTGGT GGGGCAGCAG GTTTACTGGC CCACCCGCCG 840
TCCCCACTGC AGACCATTAA AGATGAGGTG ACCGCTAACA TTGTGCTAAC CGAACTCGCA 900
GCCAATCACG TGACCCCACA GGATGGGGTT ACCGCCGAGG GGCCCTTTCA GATTAAAAAT 960
GGCCTACAAA CTCGAACTGA AGTGCAGACG CAGAAACTGG CGCAGAAGCG GCGCTACAGT 1020
ATGAACGTGG CGTTCAAACA TCCGAGTCTC GGTAAGCGAA GACGCCGCGC CAATTCTGAA 1080
TGCGATCCTG TGCTTCCTAC TAACTTCCTG CTGGGCGGGA ATATATTTGA TCCGTTAAAC 1140
CTCAACAGCC TATTGGACGA GGAGGTCAGT AAAGCGCTTA ATGCCGAAAC GCCCAAATCA 1200
TCGCCACTCC CCTCTAAAAA CCGAGACCCG GTGGAGATTC TCATCCCGAA AGATATTACA 1260
GACCCGCTGA ATTTAAGTGG CAGGGGCGGA GATTCGGCTG CCGGTGTGTT GGTTTCTCCA 1320
ATGAAGATCA GACGCAGACA CCGCAACCGC CATCATCCTG GAGCGACCAC AGGCGTTGCC 1380
GACCAATCAG ATTGTGAGAA GTCAAAAACC AATGAAACGA CATTATTTCC TGTAGCTAAT 1440
CCTGAAGAAG CTGCGAACAG TGCCGTTCTT CCGCCTGTCG AGGAGTCGCC GCGTCCGTAT 1500
GAGCTCAACA CGTCGATTAA TTGCCGCGAT GAAGTGGTGC AACCTATTCT GCCACGGCGT 1560
AAGTCACACC CCTCTGCGTC TAGCTCCGCC CCTCAATTAC TCTCTAGGTC CGCCTCTGCG 1620
CCCCATCCGT CCAAACATCG GAAGCGCAGA CGAACTGTCA GTCGCTCGGA CTCTCGCCTG 1680
TCAATCACAC CAACTCCGCC CACCAAGCGG CTAATCACAC ACACTCAAAC CTTTCACACT 1740
CCAGTTATAG GCGGAGCCAG CGGAGCTCCT CCCTTGGGGG CGGAGCGAAG CCATGAACAG 1800
CAGCGCAGGC CGCGGCGCAA ATACCATAAT GGAGCCTACA GCCGTTACTA TGGCTACCGC 1860
ACACCATCGA TGACCGCCGA CCCACGATTG GCTCTTTTTA ATCCCGAATG GTTCTCTGGA 1920
AAAAAAGTTC TAGATGTGGG CTGTAACACG GGTCATGTGA CCCTTGCCAT CGCCAAACAC 1980
TGCAGCCCCG CCCACATCCT GGGCTTGGAC ATTGATGGGG CGCTGGTGCA AGCCGCCCGC 2040
CAGAACCTGC GCCACTTCCT GTCGGAGCTG CAGGACAGGC AGCAGGCGGG AGCAGGTGAG 2100
GGGTCAGAGG TCACGGGGCT GGTGCCGCTG ATGGACCTGC AGCTGGTGTT ACCCAGGTTT 2160
CCTGTCTCCT TCATGCGCTG CCGCGGACCC ATCGCCGCTC CTCCCATAAT GCATCAGTCT 2220
CTAGGCCAGT TCCCCAGCAA CGTCTGCTTC CTGAAGGTAC ACTAACATAG CTGAAGCAGC 2280
AGATCTTCCT GACGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TG 2322