EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-34141 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr23:33600600-33601953 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ATOH1(var.2)MA1467.1chr23:33601558-33601568AACAGCTGTC+6.02
FOXB1MA0845.1chr23:33601921-33601932TATGTAAATAT+6.62
FOXC1MA0032.2chr23:33601921-33601932TATGTAAATAT+6.62
Tcf21MA0832.1chr23:33601556-33601570ACAACAGCTGTCTC-6.05
Enhancer Sequence
CAAATGCACC AGCCTAACAG ACTTCTCTCG AAAACCATTT AGGGACCTCA AACTTATAAA 60
CGACAGTCCA CATCAACAGT ATTACTTGTC CATTTTATCA TTTGAATGAT GGCCATTTAG 120
AAAGTTAATA CCACAGATTT AACATTTTAA AACAAGCTCT TAGAAAAAGT ACCCAACAGT 180
TAGACAACCA CTATTACTGT CCCTGCTCTT CTAATCTGTG TCTAATTTTC CGAGAGCCGG 240
CCTGGATAGG TGCAGCGCCG CCATGACCTC ATTGTCTGTA AACTTACTAT CATCTTTCCT 300
GTCATTAAGG CCGGTCCATT GAGAGACTGG GGACGGGGGT GTGGAGGTGT TCATGAAAGG 360
GCACTGAGGG CATCTCCAGG GGGGGGTCAA GGTACAGGAA GAAACACCCT TTCCTGCCCT 420
AGGGCTGGTC TCAGTGACGC GTAACAGAGG GCTTCCTTAC AAAGACTGCT TTCAGAAAAC 480
CCTCCGGTCA GCCATGGAGA TTCAAGCCCA CTTTAGATGG ACTGAAGAGA TAGAGTGGTA 540
TACGTAGATG ACCATTTGAG TTGAAAAAAA AAAACAAAAA CAAAAGAAAG CAGGCCGGAG 600
ACAGCAAGTG GATGGCATTC TTAAATGAAA TGAGTGGATT CTCCATGTTG TTATTTACAA 660
AAAGAAATAG TGTCTTGAGA CATCAAAGCT TAAATTGACA TCTTGTATTG AAGTACATTG 720
CATTTTGCAC CTCAAACCCT TGTTATTATT AATTAAGTCT TTGTTATTAT TAAACCCTTA 780
TTATTATTAT TAAGTGCCTT TAAGGCAACT CATTTCATGC AGCGGCCTTC TTTGAAACAC 840
CTTGCAGGCA GTATGCTCAG GCATTCCGTT TGAATGTGGA AACATTATCA AATTCTCCAA 900
AATTGCTTGC CAAGCTGACA ATTAAATTTA TTATTAGGAA TCACCAACAA AATAAAACAA 960
CAGCTGTCTC TTTAGTGTAA TTTTTAAATG TTCGAATCAG CAAAATTTGC AGAAGTGCAT 1020
GTCTGGTCCA AGCCCCTCCC CTGGAGTATC ACCAGTCTAC ATCAATTGAT GATTGGATCC 1080
TGTTCTAGAA GGCGGGGCTT CATTCAACAT ATTGACCGTT ACACTTTTTC CCATTCAAAA 1140
CTATGCAAGT GGCATGTCCT TTGTAATCTA TAGTCTTTGT TATTAGCGAC AGCAGTGGCC 1200
ATTACATGAA CTGCAAATGG CTGTGTGCGA ATGCACTTGA AGTAGCAAAC TTTGTTCAAT 1260
TCCATAATTC ACTTACATCT AACATCCCAA AGCTGTTGCT GAGAAGTGGC ATTTAAATAA 1320
ATATGTAAAT ATGTGCCATG AGCTTTGCTT TTA 1353