EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-34070 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr23:30803485-30804615 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF4GMA0484.1chr23:30803641-30803656TGACCTTTGACCTCG-6.47
KLF13MA0657.1chr23:30803523-30803541TAACAATGGGCGTGGCCT-6.75
Klf12MA0742.1chr23:30803525-30803540ACAATGGGCGTGGCC-6.59
NR2C2MA0504.1chr23:30803641-30803656TGACCTTTGACCTCG-8.12
NR2F2MA1111.1chr23:30803639-30803650TTTGACCTTTG-6.62
Nr2f6MA0677.1chr23:30803641-30803655TGACCTTTGACCTC-8.42
RXRBMA0855.1chr23:30803641-30803655TGACCTTTGACCTC-7.95
RXRGMA0856.1chr23:30803641-30803655TGACCTTTGACCTC-8.12
RxraMA0512.2chr23:30803641-30803655TGACCTTTGACCTC-8.12
SP1MA0079.4chr23:30803527-30803542AATGGGCGTGGCCTC-6.58
SP3MA0746.2chr23:30803527-30803540AATGGGCGTGGCC-6.07
SP4MA0685.1chr23:30803525-30803542ACAATGGGCGTGGCCTC-6.45
Enhancer Sequence
TGCTGCCTAA TATGAATCAC GTTTGATCTC GCCGCACATA ACAATGGGCG TGGCCTCGTC 60
CCGTCAGATG CGTCAGATGA GCCGCGGCTG TAGGAGCGAC TGAAGAAGAG GGGGATGGGG 120
ACAATTGTTT TTTGTGTTGC ATTCCTGCAG TGTGTTTGAC CTTTGACCTC GTTGTTGCGT 180
TCTCCTCGTC TTGCATTCCA AACTGAGGAT TTCCTGCAGT ATGCCAAAAG CTGCTGGGGC 240
TCGCCTTTTC TTCGCCCTGT GTGTGTTTAC CACTATTTAA CCAGCGGAGT CGTTCGTTAG 300
CCTAAAAATA ACACACTCAG GAACGCCGCT GCTACAACGA CCGATCGCTT TCTTAGACAA 360
GCCGTTATAC GGAAGAGCGT GCGGGGTTTA AACAGAGCGA GTACTATAGG CGAAACGCAA 420
TCAAACCCCC GTTTGGTGTT GCAGCTATTA GCCTAGCACG CTAGCGGGGC TTGCCGTATA 480
TATCACGCAC ACGTTTCATA TCCGCTGCAG AAATCCGCAC CCGCGCGACA ACACTGAGGA 540
AATGAAGGAC AAACAGAAGA GAAAGAAGGA GCGCACGTGG GCTGAGGCAG CTCGTATGGT 600
AATATATTAA TCATTTTAAG TAAATTATAA CGGTTTAGTG CTTGTGTGAG GGGTTAGGGG 660
TGTTGTAGGG GAGCCGCGAA CAAAGCTGTC TCGAGCTGTT GTCGGGTTGG ACATAAGCAA 720
TCTGCTGCTG TTTGTGTAAC TCTAGGTTTT ATAACCCGGC TTTTACCTTT GCAGTGACAC 780
GAGTCTTAAT CCACAATCCC TGTGTTTATC CTGACGACAT AAGCGATTCA TTTCTAGTGT 840
TTGTGTCCCA TTTGAATGAA GGAGCCCTTG CTGGTAGCCT AGCGTATTAG CAGCTCTGGC 900
TGTTTGACCC TTTGTTTGCA GGGCTTCTTT TAGCGAGCTG AGTAAAATGC TGAAAATATT 960
CAGTGTACAA GGTTTGGTTG TCTTAAAAGA CTGATTTTAA TAAATGTTTG TTGAATGCTT 1020
ATTGTTTAAA CAGTCATTCA TATAGTAGGC CATATTTCTA TGTTTTGTAT GCAGTTCGTG 1080
ATCCCTTGAT CTTCTTTGTT AGCTATTTAT TTATCAGTTA AACGTTTTTA 1130