EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-33493 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr23:16237773-16239939 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFLMA1102.1chr23:16239547-16239561GGTGCTCCCTTGCC-6.12
ESR2MA0258.2chr23:16239216-16239231AGGGCTCTCTGACCT-6.13
NR2C2MA0504.1chr23:16238922-16238937TGCCCCTTGACCTCC-6.32
ZSCAN4MA1155.1chr23:16238321-16238336CTTGCAGTGTGTGTG-6
Znf423MA0116.1chr23:16238597-16238612GCCACCCAGGGGTCC-6.28
Znf423MA0116.1chr23:16238873-16238888GCCACCCAGGGGTCC-6.28
Znf423MA0116.1chr23:16239054-16239069GCCACCCAGGGGTCC-6.28
Znf423MA0116.1chr23:16238597-16238612GCCACCCAGGGGTCC+6.84
Znf423MA0116.1chr23:16238873-16238888GCCACCCAGGGGTCC+6.84
Znf423MA0116.1chr23:16239054-16239069GCCACCCAGGGGTCC+6.84
Enhancer Sequence
CGCAGGGTAA CCTCTTTCCC TCCATCTAGG GCTCTCTGAC ACCAGAAAGC TACCTAGGGG 60
TCCACCTCTT CCCTGGACTT GCAGTATAGG CCCCAAGGTG CCCCCTTGCC CTCCACCTAA 120
GGCTCTCTGA CCCCAGCAAG CCACTCAGGG GTCCACCTCT CTCCCTGGAC TTGCAGTATA 180
GGCCCCAGTG TGCCCCCTTG CCCTCCACCT AGGGCTCTTT GAGCCCAGCA AGCTATCCAG 240
GGGTCCACCT CTCTCCCTGG ACTTGCAGTG TAGGCCCCAA ATTGCCCCGT GCCCTCTACG 300
TAGGGGTCTT TGACCCCAGC AAGCTACCCT GGGGTCCACC TCTCTCCCTG GACTTGCAGT 360
ATAGGCCCCA GGGTGTGCCG TTGCCCTCCA CCTAGGGCTT TTTGACCCTA GCAAGCCACC 420
AAGAGGTCCA CCTCTCTCCC TGGACTTGCA GTATAGGCCC CAGGGTGCCC CCTTGCCCTC 480
CACCTAGGGG TCTCTGACCC CAGCAAGCTA CCCTGGGGTC CACCTCTCTC CCTGGACTTG 540
CAGTTACACT TGCAGTGTGT GTGAATGTGT GTGTGGATGT TTCCTAGAGA TGGGTTGTGG 600
CTGTAAGACC CTTTCACCTT GGGGTCCCTG ACCCCAGCAA GCTACCCAGG GGTCCACCTC 660
TCTCCCTGGA CTTGCAGTAT AGGCCCCAGG GGGATCCCTT GCCCTCCGTC TAGGGCCTTC 720
TAACCCCAGC AAGATATCCA GGGGTCCACC TCTCTCCCTG GACTTGCAGT ATAGGCCCCA 780
GGGTGCCCCC TTTCCCTCCA CCCAGGGGTC TTTGGCCCCA GCAAGCCACC CAGGGGTCCA 840
CCTCTCTCCC TGGACTAGCA TTAAAGGGCC CAAGGTGCCC CCTTGCCCTT CACCCAGCGC 900
TCTTTGACCC CGCACAAGCC ACCCAGGAGT CCACCTCTTT CCCTGGACTT GCAGAATAGA 960
CCCCAGGGGG CCCATTGCCC TCCACCTAGG ATCATCTGAC CCCAGCAAGT CACCCAGGGG 1020
TCCACCTCTC TCCCTGGACT TGCTGTATAA GCCCCAAGGT GCCCCCTTGC CCTCCACCTA 1080
AGGCTCTCTG ACCCCAGCAA GCCACCCAGG GGTCCACCTC TCCCTGGACT TGCAGTATAG 1140
GGCCCAGGGT GCCCCTTGAC CTCCACCTAG GGCTCTATGA CCCCAACAAG CTACCCAGGG 1200
ATCCAAATCT CTTCCTGGAC TAGCAGTATA GGCCCCAGGA TGCCCCTTTG CCCTCCACCT 1260
AAGGGTCTCT GACCCCAGAA AGCCACCCAG GGGTCCACCT CTGTTCCTGG ACTTGCAGCA 1320
TACGCCCCAG GGTGCCCCCT TGCCCTCCAC CTAGGGGCCT GTGACCCCAG CAACCTACCC 1380
AGGAGCCCAC CTTTCTCCCT GGACTTGCAG TATAGGCCCC AATGTGCCAC TTGCCCTCCA 1440
CCTAGGGCTC TCTGACCTTA GCAAGCCACA AAGAGGACCA CCTCTCTCCC TGGACTTGCA 1500
GTATAGGCCC CAGGGTGCCC CATTGCCCAC CACCTAGGGC TCTCTGACCC CAGCAGGCTA 1560
CCCAGGGGCC TACCTCTCTC CCTTGACTTG CAGTNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 1620
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 1680
NNNNNNNNNN NNNNAGCTCC ACCTAGGGGC CTAAGACCCC TGCAAGCTAC CCAGGTGTCC 1740
ACCTCTCTCC CTGGTCTTGC AATGGAGGCC CCAGGGTGCT CCCTTGCCCT CCACCTAGGG 1800
GCCTCTGACC CCAGCAAGCT ACCCAGGGGT CCACCTCTCT CCCTGGACTT GCAGTATAGG 1860
CCCCAGGGTG CCCCTTGAAT TGAATTGAAT TGAATTTTAT TTGACAGATT TTAGACAAAC 1920
TGTACAAAAA GTATTCCATA CACTTTGTTA AAAAAAACTG TCGAGGATAA AAACACAATA 1980
AAGCCCTGGG CTTATTTCCA TTGTGGTCCT CTGTTAAATA AAAACAATGT ATGGCTTCAA 2040
AATACTAATG AAGAATAAAA CAAACAGTCG CCACAGCGGT ATGAACAGCC AACCCATCCA 2100
GCACAATGTC CATCCAGCCG CCAACCTATT CACACTCAAG TAACATAATT TAAAAGATCC 2160
TCATCC 2166