EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-31824 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr22:21106380-21107256 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EHFMA0598.2chr22:21106592-21106604TACTTCCGGTTT-6.02
ELF1MA0473.2chr22:21106592-21106604TACTTCCGGTTT-6.07
ELF2MA1483.1chr22:21106592-21106604TACTTCCGGTTT-6.32
ELF3MA0640.1chr22:21106591-21106604TTACTTCCGGTTT-6.11
ELF4MA0641.1chr22:21106592-21106604TACTTCCGGTTT-6.11
ELK3MA0759.1chr22:21106592-21106602TACTTCCGGT-6.02
ETV1MA0761.1chr22:21106592-21106602TACTTCCGGT-6.02
ETV2MA0762.1chr22:21106592-21106603TACTTCCGGTT-6.14
ETV4MA0764.1chr22:21106592-21106602TACTTCCGGT-6.02
IRF1MA0050.2chr22:21106872-21106893TTTCGTTTTCATTTTCTCTCT+6.16
IRF1MA0050.2chr22:21106866-21106887GTTAAGTTTCGTTTTCATTTT+7.08
IRF3MA1418.1chr22:21106869-21106890AAGTTTCGTTTTCATTTTCTC-6.98
IRF9MA0653.1chr22:21106870-21106885AGTTTCGTTTTCATT-6.41
Enhancer Sequence
AAAAGCAACC AGAATTATAA ATATAAATGT ATACTCAAAC TAAACTCCTC TTTTCTATTG 60
CAAATGTTAA AGGGTCACGA AACACCAAAA CACATGTGTT GAGCTGTTGA CAGTGGTATA 120
TGTGTCCCAC ACTGCTAAAA ACACTATTAG GACACCTATA TTTCACTAAA AAGTGTAAAT 180
TGGTTGTTTT TGCGTTATTT CAAGCAAATT CTTACTTCCG GTTTGAAACA AATTTTTGAA 240
GCTGCGTCAC GGCCATGACA TAATAGCCTG TATTCCAGCG TGCAGACTGG ACATCTGTGC 300
CAGAGTGAGT CTTATTACGT CTTACAGTGT GCTGCATTAA TGCATGAGTA AAGCTTGGTT 360
CAAACCAATC AGCGCGCTCT ATTGTGCAAC TTCATTAATA TTCATTACTG TCAGAGTGTA 420
GATGACAGAG ACGCCACGTT GTGTTGGCAA AACAAGCGTG AAGTGTTGCT TTTATAGTTT 480
GCTGCCGTTA AGTTTCGTTT TCATTTTCTC TCTGTGAGAG CTCAGACTCA CGTGTGGATT 540
AACAGTGTAC GCGACGCGCG ACAACAATAA CTTACGTGTC TAAGGAGGAT TATTGTTTAC 600
CTGAGAGCTG TTCCAGATTC GCTTTAGTCT CCTCTTAATA AAGACGCGGC TCTAGTTGCT 660
GGTGATTGTC CTGTCTCTAC AGATTTGGTA AGTGAGCGAC CAGTGCTCTT TGTTTATTCA 720
GTTCGTATTT TATTCGTATC AAACAAACTA TTGCAACGAG TGTAAACAAG TTAGCACTAA 780
CAGTTACAAC CAAACTATAA CCTCGTGTTG GATTTTGTGA CCGGAATAAC ACACGCGGCT 840
TTCTGACGCT ACCTGCCGTG TGCATCTAAG TTTCCG 876