EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-29032 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr21:5031431-5033727 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE40MA0464.2chr21:5033620-5033630GTCACGTGAT-6.02
PBX2MA1113.1chr21:5031918-5031930ACTGTCAATCAC-6.14
POU4F1MA0790.1chr21:5032111-5032125GTGCATTATTAATT+6.38
POU4F3MA0791.1chr21:5032111-5032127GTGCATTATTAATTTT+6.03
RREB1MA0073.1chr21:5033240-5033260CCCCCTATCACCACCAAACA+6.02
RREB1MA0073.1chr21:5033230-5033250ACCCCAAGCACCCCCTATCA+6.12
SREBF2(var.2)MA0828.1chr21:5033620-5033630GTCACGTGAT-6.02
Srebf1(var.2)MA0829.1chr21:5033620-5033630GTCACGTGAT-6.02
TFEBMA0692.1chr21:5033620-5033630GTCACGTGAT-6.02
ZNF384MA1125.1chr21:5032390-5032402TTTTTTTTTAAC-6.04
ZNF384MA1125.1chr21:5032389-5032401TTTTTTTTTTAA-6.44
Enhancer Sequence
GACCACTAAC ACTGCATGTT TTGGATGTCA CCTTTGTTTG TCACACCCAT TACAGGTCTT 60
TCAGTCTCTG CTGGTGATCT GAATCAGGAA CATTAATATT TTATATCAGC GAATTCAGTA 120
GATTAACTCA ATAACATGCC AAAACTCAAA ATGTTAGAGA CGTCCTTTAA ATCAAGATAA 180
ATTAACGTTA CAGGAGATCA ATGTGGAGAT CAGCTAACAT TAGTTTTGTC TTCTTAATTA 240
TTATTCCAGA CCCATAAAGA AAATTACATA GCGATCACCT GTAATTTCCC CGTCATGGCT 300
AGGTTAGGCG TGTATCAGCA AACTAATAAA GCCCTCACTT TACAGAATAA GCAGTGTTCT 360
ACCAACACTG TAGGTCAGAA AGTATAGTTT ACTGCTGAAC AACTTATTTT ATCATGGTAA 420
AATAACAAAG AAATCGAATA ACAACACTTC AAGCTCTTCC TGAAGCTCTG ACGGTCTGTT 480
TTAAGAAACT GTCAATCACA ATGATACGGC CCATTAAATT ACTGGCTGAA ATTATACTCA 540
GGGCTCAACA ATAAGGATTG CCTGAAGGCT CGGGCCTACC ATGAGAGACG CTTGGGACAG 600
TAGACAGGAT CATTAATGCC CCAATTGAAA CAGTGCTGCC TTGTCAGAAG TTTTATGCCC 660
TGCTACGATT TGTCAATTGT GTGCATTATT AATTTTGAGC TTTTAAGTCT TTAAATGCTA 720
CCATATTGCT ATTTGGTTTC TCTCATCTGA TTTGATGTTT TGAGCATGCC ATTTTTTTCC 780
CTGTAACTTG GTAACAACCA GTACATTGAA GTGACGGCAA CATCAAGCTA TAAGGGTAAA 840
AGAAAATGGG TTTGTAACGT CTTGGAAGCA GACGTTTACA TGGGAACATG ACGAAAAAAA 900
TTAAGTAATG TTTTGCATAA TTTGCCGTTA GTTTGGCAAG TCAGCCACAT TTGTTAAATT 960
TTTTTTTTAA CTGCAACAAA ATACCTGCAT ATTTTCCACA CTTACAATTT TGCTCATTTT 1020
ACATTTATTA ACATTTTTAA ATATTTAAAT TCTAGATTCA CAGACATTAC TTTTGACACA 1080
TTATTTAAAA TGTGGATAAA AATAGCCATT AATTTCTCTT ATTTTGTGGG TGGGGCCAGT 1140
GAAAATTTTG CCAGAGCAAG TAAAAATCTT AATCATTGGC CCGATATTAA ACCGATACTC 1200
TAGACCAAAT GAAGACCTGC ACCTATATCA GCATAATAAC CAGTGACTTC ATTGACCAGA 1260
ACCATCTTTC GGTAATTTTT TTTATTGCAA GTGTGATTCA TTTTTGTATT TGGGCTCAAT 1320
CCTCGTTTAT TAAACTGAGG CGGTGGGGTT TATGACTTCT ACTGAAGCCA GCGATCTAAT 1380
AGCTGGGAGC ATCATCCAAA AGCAGGCCTG TGGCACACCT CGTTAAGACA AGAGTTCAGA 1440
GCTGGTGTTC CTCCATGAAC ATGGTTGAGA AACACTGGCC TAGCTTGTAT ATTAAAGTGT 1500
TTTTAGTAGT CACTGTTAAT GAATGTAATT GTTCTGATAG CATGAGGCTT TATTTCTTCA 1560
GTTACATTAT ATTTTTTGTA TTTATATGAT CATACTTGAC CATTTAAAAT ATATATTTAT 1620
AACTGTTTGC TTAAGAGTTT TTCCATTCTT TGTATTCTTC CAATTGTTCA TTTAGGTGTT 1680
TCTCTCCGTA TCCTCTCTAT GGATAGTGAT GGATTTCCGG GCTCAGCCTG GGCGTCCGCT 1740
CTAGAATGGG ATTACTACGA CCCAAGTTAC GTCACCCAGA ACCACGTCCC AAAACACAGA 1800
CCCCAAGCAC CCCCTATCAC CACCAAACAA TACTGGGTCT AGAGCTCATT CTCCATAGAG 1860
ATCCTGAAGA ACTCCAGAAC GAGACTCGAT TCAGCCTTTC TCACTCTAGA ATTCGTTGAG 1920
CTGAGTCTGG ATTTAATCTT TCTGGCTTCA GTGCACTTAT GAAATGTTCA CTTGCCGTTT 1980
TAACTGCAAC ACATCACATC TTCACAGTAC ACACTTCATG TATTAAAGTT CACGATCACA 2040
GCTTACTTCT GCAGCAACTC CTAACAGGTT TGTTCTGTTT AATAATTTGC ATTACAGAAT 2100
CACTTCACAG TTGGCCTCAT CACTTCAGAC CACTTTCACA GTGTTTGTCT CACACTTTAC 2160
CTCTCACTGT TTGTTATTTA TATATGTTTG TCACGTGATT CTCAGCATGG AGTTACTGAG 2220
GTGTTTAGAA AAGGCTGTTT GACTCACACT TTTGTATGAA AAAAAGTATT TAGATTGTGC 2280
CTGAATTGAA TAATAA 2296