EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-27637 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr20:29027046-29028754 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DUX4MA0468.1chr20:29028587-29028598TGATTGGATTA-6.02
DUXAMA0884.1chr20:29028586-29028599TTGATTGGATTAG-6.01
LHX2MA0700.1chr20:29028459-29028469ACTAATTAAC+6.02
POU1F1MA0784.1chr20:29027124-29027138AATATGCAAATGAA+7.14
POU2F1MA0785.1chr20:29027124-29027136AATATGCAAATG+6.74
POU2F2MA0507.1chr20:29027125-29027138ATATGCAAATGAA-7.82
POU3F1MA0786.1chr20:29027125-29027137ATATGCAAATGA+6.18
POU3F2MA0787.1chr20:29027125-29027137ATATGCAAATGA+6.37
POU3F3MA0788.1chr20:29027124-29027137AATATGCAAATGA+6.02
POU5F1MA1115.1chr20:29027125-29027136ATATGCAAATG+6.32
Pou2f3MA0627.1chr20:29027123-29027139GAATATGCAAATGAAA+6.4
Enhancer Sequence
CAAAAGAAAT GTGGCACCAC AGCTCCTGCT TTATATCAGA ACTGCTTTCA GGTTGAAATG 60
TAAAAGGTCT AAAAAAGGAA TATGCAAATG AAAAGTCTTT CCAGCTGCCA GGAGTTTAGG 120
AAGGGACAGG ACAGAGAAAA GGAGAAAGAC GCAAATACAT AGCTGAGAAC AGTGTGGCAA 180
GGAGAGTCCA GGCTGACTGA CTGTAAAGAA AGACCCTTTT GTTGTGCGTA TTATGTCTCA 240
CACGGTTTCT TTATCTACAC CTTTTAACAC AAAAAAAACA ACGAGAAAAA GGGATTCAGT 300
CCACATATAG GAAACCAAGC AAAGGTTTAT GAGTGGAAGC TTTCCACCAG AGCAACAATT 360
ACATTTGTCC ATATGATATC ATACTGAAAC AACCTCCTGA TCAAGTTTCA ACAGGAAATT 420
TCAGAACACG CAGATTTCAA GCAAACTCAT GTAACTTAAA GATATATGCT ACTGAGAAAA 480
GCAGGAAAGT TGTAGAGTTT GATTACAGGA AGTAGAAAAA CATGGTAACA GTGTTTGCTG 540
TCTTCGACAA AGAGACACCA GCAAATTATA AAGCAATTAC TTGAAGGCAG ATGACACTAA 600
TCTTGTTTTC AAGACGAGGA ATGGCACTGG CGTTATCGCC TCACCGCAGA AACGAGCACA 660
TTTTTATTTA TAAAAGCAAA CACAAAACAG GACAGGTATT ATGAGAAAAC TGGAGAGAGC 720
TGGAGGACAT GGTAATGTAG TTATTCTATG TAAGACAGAA ATAAGCCCTA GTATGTCCGG 780
GCTTAAAAGT CACACGCGCC GACACGTGCA ACTGTTCCGA GAGCAGAATG ACTACAACAA 840
AGAGAGCAGA GTGTGTCCTG CCCTCAAAAT ATTGTTAAAA CAGAACTATA TTTAACCATA 900
AATACAAACC AAATTCTGAA CCATTAACTA TTACGATTAA GTCTCTTACA GTAACGGTAA 960
TAACTTTGAG GTTGTTTGTA ACTTTTAGAC CACAAGTTTT TAAAGTCCTC TTGCAATGTT 1020
TACAGCACAG CGTTTAGAGC ATGTGCGCGT GCGTAAGTTA TATATACGTG TATATGTTTA 1080
GATGTCGTTC TTGCAACGGG GAGACAAATC AGGATGTATA TTACAAGTAC ATTTAACTAA 1140
ACACACTGGC TTTTTCTGAC GTAACAGGGT AAACTCAAGT ATAAAAGGCT ACAACGATGT 1200
TCGTGGTCTG TTGCTGACAA CAATGATACT GTAACGTATT GACAACGAAA ATACTTGCCA 1260
ATAAATATAA AACGGAAACT AACAAATAGT ACACACAAAA TCGACATTAA GCATTGTACT 1320
GGAGAAAAAT GGCAGCCTAT TGGTAATAGG AAACGAACAA CAGGCTTTGT CCGCATCGCT 1380
GGACTGGCGA CTTTTTTAAT CGCGTTATGA CACACTAATT AACAACCACA TTTCCTCTTG 1440
AAACTCGCTA GATAATGAGG TAAAGATAAA GCGATTACAT ATTCAACAAT CAGTCGTTTG 1500
ATCAATGGTT AAAAACCTTT TACTGCTATT GTAATAGTGT TTGATTGGAT TAGGGCTCAC 1560
CAGCGAGCTA ACGTTTATTG TCATTCATGT GAATACTAAA GTCCGTAACA ATCTATAACT 1620
CTTTCTATAT TTAAGTAAGT GCTTAAACTA AATCAGTTTG TTATCATATT TTTCAGCTTT 1680
TCCATTTTAA CCAGTAATAA ACACTCGG 1708