EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-27328 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr20:21880305-21881798 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EBF3MA1482.1chr20:21881147-21881161CTTCCCTGGGGAAG-6.19
IRF1MA0050.2chr20:21880623-21880644AATGAGAAACTGAAAGTGTAT-7.18
Rhox11MA0629.1chr20:21881699-21881716AAGCAGCTGTAAATGGT+6.04
Sox3MA0514.1chr20:21881254-21881264AAAACAAAGG-6.02
Enhancer Sequence
CTATAAATAA GGCAAAACTA AATATAAATC TGAATAAACA AACATTGCAA ATCATTATTG 60
AACCTAAACT AAACATGAGC TCTCCCTCCA AGCCATTAAG CCAATGGTAT CGGCAGGCGG 120
AACCAAAAGA CGGCATCTTG CGGCACGTCG GACCTTTAGT TGGGCGGACC ACACCCGGAA 180
ACTCTGTTCC TCGTCGGCAC TGCAGCACGG TAACTTAAAC TCAAAAGAAA ACTAAATTAA 240
CAAAACATAC AGTACAGATA ACTGATTTTG TGTGCACCCA AAATAGTAAT AAATGTACTG 300
TGAATAATAA AGAAAGGTAA TGAGAAACTG AAAGTGTATG AGTCTTATTT AAATCAGATA 360
TGAATGAAAC GAAAATGTAT AAACACAATA ACTGAACTGT GACCAATAAA TAATCTTAAA 420
TGAATAAGTA TAACGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 480
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTATGTGT GCGTGCATGC CTCACTCTCA 540
ATGTGTGGCC ACCACACTGG CCATCACATA CTCCCTCCCT TCGGGAATGT CACTGGCACA 600
TCGGGACAGG TAGTCAGCCG TAAGGTTTTC TTTGCCAGGG ACATGTCTGA TAATAAACCG 660
GAAGGGCTGC ATGGCCAGGT ACCAGCGGGT AATACGACTG TTGGTATCTT TCATTTCTTG 720
AAGCCATTGT AGAGCTTTAT GATCAGTCTC CAGTATAAAC TCCCGGCCTA GCAGATAATA 780
CTTTAAAGAG TCCAATGCCC ACTTCACAGC CAAGCATTCC TTTTCCACAA TGGAATAGCG 840
AACTTCCCTG GGGAAGAGCT TTCGACTCAA GAAGGCCACG GGGCGTCGAG TGTCAGGGCT 900
GCCCTGTAGC AATACAGCTC CCAGGCCTCG ATCTGAAGCA TCAGTTTGCA AAACAAAGGG 960
TTGGTGGAAA TCAGGGTTAT GCAAGACAGA ATCTTTACTC AAGGCCTTTC TGAGATCTTG 1020
GAAAGCTGCA ACAGTTTCTT GGGTCCACTT CAGCTGATTG GGACTCCTTG AACCAACCAT 1080
GTCAGTCAAT ACTGCAGCCC GCCCAGAAAA GTTGGGAATA AATCTGTGAT AAAACCCAGC 1140
CATACCCAAA AAGGACCTTA ACTCCTTACG AGTTTGTGGC TGTGGACACC TTTCAATGGC 1200
CCGTACCTTC TCCACCTGGG GTCGGAGCAC CCCTTTACCG ATAACAAACC CCAAGTACTC 1260
TGTCTCTGCC TTTGCAATGG TACACTTTTG GGGGTTAACT GTCAGGCCGG CTGCCTGAAG 1320
GCGTTGCAGG ACTTCTTGGA GATGCTGCAG ATGTTGCTGC CATGTGTCAC TGTACACTAC 1380
AATATCATCC AGATAAGCAG CTGTAAATGG TAGTCCTCGT AGTACGTGGT CCATTAGTCT 1440
TTGGAAGCTG GCCGGTGCCC CATGCAGTCC AAAGGCTAGA ACCTTAAAAT GGA 1493