EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-27279 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr20:20014954-20015836 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ArxMA0874.1chr20:20015170-20015187AACATTAATTAATTTAT-6.01
ArxMA0874.1chr20:20015207-20015224AACATTAATTAATTTAT-6.01
Lhx3MA0135.1chr20:20015172-20015185CATTAATTAATTT-6.54
Lhx3MA0135.1chr20:20015209-20015222CATTAATTAATTT-6.54
POU6F1MA0628.1chr20:20015173-20015183ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr20:20015210-20015220ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr20:20015173-20015183ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr20:20015210-20015220ATTAATTAAT-6.02
Enhancer Sequence
AGTGAATTTA TAAACTTCAT AATCCAGGAT CAACACTAGT GAATTTATAA TCTTGATGGT 60
CCAGGATCAA CAGAGGTGAA TTTTAAATTT TTGATGGTCC AGGATCAACA TTAGTGAATT 120
TTATTCTTGA TGGTCCAGGA TCAACATCAG TAAATTTATA AACTCGATGG TCCAGTATCA 180
ACATTAGTGA ATTTATAAAG TTGATGGTCC AGGATCAACA TTAATTAATT TATAATCTTG 240
ATGGTCCAGG ATCAACATTA ATTAATTTAT AATCTTGATG GTCCAGGATC AACATTAGTG 300
AATTTATAAT CTTGATGGTC CAGGATCAAC ATTAGTGAAT TTATAAACTT GATGGTCCAG 360
GATCAACATT AGTGAATTTA TAAACTTGAT GGTCCAGGAT CAACATTAGT GAATTTAAAT 420
TTTTGATGGT CTCGGATCAA CATTAGTGAA TTTATAAACT TGATAGTCCA GGATCAACTT 480
TAGTGAATTT TAATCTTGAT GGTCCAGGAT CAACATTGGT GAATTTTAAT CTTGATGGTC 540
CAGGATCAAC ATCAGTTAAT GTATAAACTT GATGGTCCAG GATCAACTTT AGTGAATTTA 600
TAAACTTGAT GGTCCAGGAT CAACATTGGT GAATTTTAAT CTTGATGGTC CAGGATCAAC 660
GTTAGTAAAT TTAGAATCTT GATGGTCCAG GATCAAAATC AGTGAATTCA TAATCTTGAT 720
GGTCCAGGAT CAACATCAGT GAATTCATAA TCTTGATGGT CCAGGATCAA CATTAGTGAA 780
TTTAGAATCT CGATGGTCCA GTATCAACAT TAGTGAATTT ATAAACTTGA TGGTCCAGGA 840
TCAACATTAA TGAATTTATA ATCTTGATGG ACCAGGACCA AC 882