EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-24243 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr2:13956840-13957482 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr2:13956865-13956878GAATAATTAATTA-7.12
Lhx3MA0135.1chr2:13956868-13956881TAATTAATTAATC+7.34
MEF2AMA0052.3chr2:13957387-13957399TCTAAAAATAAA+6.07
POU4F1MA0790.1chr2:13956863-13956877CTGAATAATTAATT+6.91
POU4F2MA0683.1chr2:13956863-13956879CTGAATAATTAATTAA+7.37
POU4F3MA0791.1chr2:13956863-13956879CTGAATAATTAATTAA+7.14
POU6F1MA0628.1chr2:13956870-13956880ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr2:13956870-13956880ATTAATTAAT-6.02
Enhancer Sequence
ATATGAAATA AATGTCAATT TTGCTGAATA ATTAATTAAT CTATATCTTT AATATTTTTA 60
AAATCATCTC GCTTCGGCCC AGAGAAAGAG GCGCGCGGCA CCAGCGGACC TGTGCTTTCC 120
CAAACAAAGC CCTACAGTAA CTTGCGCTGA ATATGCATAG TTTGGGGGGG GAGGATATAG 180
TAGTGAGTGT TTCCAAAACC CCTATAGTTT CTCTGTCGCA GATCCATCAT TTGAATCACG 240
TCACTATTAA CCCTGCTTTT ATTTATTAAA TGCTTCCCAA CGCCGCATTT CTGTTGAGCG 300
AAAAAAAGCT GCTGAAAATA AATAAAGTTA TGCCAATGCC ATTTTAATAG TTTCATGATA 360
GTAGTAGCTG GTGTGCTTCA TCTGCGTGAT TCTGATTTGA CATTCTTCCG CTAAACTTGC 420
GCTGTCTTGG TGTAAATGGG CTATGAACTG TTGCTATTGA GGCTAAGGTG TAAATAGGCT 480
ATAGTTCTCT CTGCAACTTT CAGGTTTGAG GTGGGGGAAG TGGCAGAGGC AATTCAAATG 540
AACCATCTCT AAAAATAAAA AATGCCACGT ACGCGGCATC TGTGTAAAGA TCATTACCTT 600
ATTTTATTAT TATTATTATT ATTATTATTG TTATTATTAT TA 642