EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-24150 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr2:12417278-12419392 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr2:12418896-12418915TGCTGTCCTCTGCTGGCGG-6.07
HNF4A(var.2)MA1494.1chr2:12417978-12417993GGGTTCAAAGTTCGA+6.09
Hnf4aMA0114.3chr2:12417978-12417994GGGTTCAAAGTTCGAA+6.33
RXRGMA0856.1chr2:12417978-12417992GGGTTCAAAGTTCG+6.13
SOX10MA0442.2chr2:12419041-12419052GTCTTTGTTTT-6.14
TCF3MA0522.2chr2:12418571-12418581AGCAGGTGTT-6.02
Enhancer Sequence
AGTTCGGCCT TTCGTATGGA GAGCCATATA GAGCACCTGT TTGTGTAGGC TGGCACCACA 60
GAGTCTTGTT TGATGATGAC AGAGCAGGCC TCTGGCATGG TCTGGCCTGA GTGGGGCTTC 120
TTGAGGGTGA CAGCCACCGT TGTTGGCTGT AAGAAGTGTG GGTGCCTATC ACCGGTCGTT 180
AAAGGTGTCT ATATATATGC CTGAAGATGT ATCAGGCTAT TAGCTCTGAT GTAAACATCG 240
TGCGGCGGGG CCGTGAGAGT TAGGACTGGA TGGGTCAACC ATCCGCCGTT CCGATTCAAG 300
TTCAATGTGC AAATGCTGTT GGCAGTTGTC ATGTGTGAGA GTTCAGCATT TGGACAGTAG 360
TGTGTATGCT TGTTAGTTGA ACACAGGTCT GGGGGTGTGT TCAGGCGGAG TGTCGCATAG 420
TGCGAGGCTG ATGGCTGCTG GGTTGTCTGC TCACAGTGCA AGTACAGTGT CATTCACAGT 480
CCGGTTATTC AACATTAAGC CCTTTGAGGC CTGGGGCAGC AAGCGTTGGG GTTGCTAGCT 540
GGTTTGAAGG CTGCAGAGTA GCGACCTTGA CCCCGTCTAT GTTGTTGAGT TCGGGTTCTC 600
GCGGGTTCCA GCAGTTTCCC GCGACCTCGG TGACCTGACA GTCTGTTGGG GTTGACCTGA 660
CGGCTGTGAG AGTTCTCGCA CTTGGGCCCA GATTTTAAAG GGGTTCAAAG TTCGAAAGAG 720
GTTCACACGT ACGCAGCGGA TTTTTACCAT TCAGCAGCAG GTATGTGCCC ATTGGCGACG 780
GGTACACGGG GTGCACTGCA GTCATGGGGA CAGTCGTTAC TTGAATGGGA GCGATGTATG 840
TGAGTTGAAC CTCAGGTCTG GCTGTATGAT TTGCACCATC AGCCTGCCTG GTTGGCATTT 900
AAGTGTTCGT TTTAGTCTCT GAGCTCTTGC TTTGAGTTAC TCAAACAGGA AAGATGACAT 960
TAATGTGAGG TCTGCTCCCG TGCTGACGCG CGTTTTTCAT CTTTCTTTCA TCTCCACGGT 1020
TACAGCCAAG TAGCGCGTTG TTGCCACGCC ATTTTGTTCA GGTTCCCCAA GAGTTGAAGT 1080
GCAGGGGCCT GAGCAGTTGT TTGCACGCAG GTGTGGCTGG TTGGTGAGCT GTGGCTCGGG 1140
AGGTAAACAG ACAACCAGAC CAGTGTTTCC TGGTACCTGA GGTTTCAAGC ATGGTGGCAC 1200
TGGCTGCTTC TTGGGGGAAG CGTGATGCTG CAGTTAGATA CACAGTCTTT AGCTTGTGTT 1260
GGACTCGCAG TACTCTGCGG GGATGGAGCA GAAAGCAGGT GTTCAGGGGG GGTAAATGGT 1320
TTTGGACCCC CCTCTAGTCA TAAGGAGTCT GGCTTGACTT CCTGTAGGGC CCCTTCAAGC 1380
TTTTTAGCAG TTCTGCTGCT CATGACGCCA CCGTGCCGTT GTTTGGTGTC AGGTTTTCAC 1440
CTTTGGCTTT CTCTGGCGTG TAACTAGCTG GATGCTGGTT GCTTGAGCTC CTAGCTACTG 1500
CAGGTTGTTC ATTCCTTGGT TGCTGTTAGG CTCCTTTTGG GCTGCTTGTG GTGAGTGGCT 1560
TGTCCCAGTG TGTCTCTGAG CATCCTGTCT GGTGTTGGGA CATGCGCCTT CCTGGCGGTG 1620
CTGTCCTCTG CTGGCGGAGA AAGGCTTTAA CTCACTGTTT GGAAGTCTTG CGGCTGGGAA 1680
ACAGTAACAT GCCTTTTAAA GTCAGCTCCG GATGAGATTC TGAGACAGGG TAGCTCGTAG 1740
GTGTTTGATA GTCTTTCAAA GCAGTCTTTG TTTTGAACAG ATTTTATGAG CTAAACTCTG 1800
CCGCTGTTGG GTGGTCAGGG CGTGGGGGCA GGGCATTGCC CGTGTGCGGA CTCACCACAG 1860
AAAGCAGGCT TTTGAGAGAG AGAGGATCTG GAAGGTGAAC TCCTCCTCCG TCCGTGGCTC 1920
ATTTCCTGTC TCGAAGTAGG GTTGGTGTAG GCGACTGCAG TATGCTTCTG AGGTCTTGTG 1980
GCTGTTCTGA GACCCATGGC GACAATCAGT CCTTACTCTG ACACGGGGTC AGGTAAAACA 2040
CTCTAGTAAG AGCTCTTGCA TCGGCTCGTA ATCTGCTTTG ATGGCACGGC GCTGTTGATT 2100
CAGGAAACTT CTTG 2114