EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-23321 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr19:42939069-42939851 
TF binding sites/motifs
Number: 29             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ALX3MA0634.1chr19:42939373-42939383TCTAATTAAA+6.02
ARGFXMA1463.1chr19:42939373-42939383TCTAATTAAA+6.02
ATF3MA0605.2chr19:42939718-42939730GATGACGTCACT-6.11
ATF3MA0605.2chr19:42939718-42939730GATGACGTCACT+6.14
ATF7MA0834.1chr19:42939717-42939731TGATGACGTCACTG-6.04
CREB3L4(var.2)MA1475.1chr19:42939718-42939730GATGACGTCACT-6.02
Creb5MA0840.1chr19:42939718-42939730GATGACGTCACT+6.37
Foxq1MA0040.1chr19:42939131-42939142TATAAACAATA-6.32
HOXC11MA0651.1chr19:42939506-42939517GGTCGTAAAAC+6.14
HOXC12MA0906.1chr19:42939506-42939517GGTCGTAAAAC+6.14
HOXD10MA1506.1chr19:42939506-42939517GGTCGTAAAAC+6.62
HOXD12MA0873.1chr19:42939506-42939517GGTCGTAAAAC+6.02
Hoxa11MA0911.1chr19:42939506-42939518GGTCGTAAAACT+6.74
JDP2(var.2)MA0656.1chr19:42939718-42939730GATGACGTCACT+6.07
JUNB(var.2)MA1140.2chr19:42939718-42939730GATGACGTCACT+6.07
MIXL1MA0662.1chr19:42939694-42939704TCTAATTAAC+6.02
NFIL3MA0025.1chr19:42939673-42939684ACGTTACATAA-6.32
PHOX2AMA0713.1chr19:42939370-42939381TAATCTAATTA+6.32
POU1F1MA0784.1chr19:42939695-42939709CTAATTAACATATT-6.88
POU1F1MA0784.1chr19:42939580-42939594CTAATTTGCATATC-7.19
POU2F2MA0507.1chr19:42939580-42939593CTAATTTGCATAT+7.04
POU3F1MA0786.1chr19:42939581-42939593TAATTTGCATAT-6.74
POU3F2MA0787.1chr19:42939581-42939593TAATTTGCATAT-6.74
POU3F3MA0788.1chr19:42939581-42939594TAATTTGCATATC-6.09
POU3F3MA0788.1chr19:42939696-42939709TAATTAACATATT-6.36
POU5F1MA1115.1chr19:42939582-42939593AATTTGCATAT-6.62
PROP1MA0715.1chr19:42939370-42939381TAATCTAATTA+6.14
Phox2bMA0681.1chr19:42939370-42939381TAATCTAATTA+6.32
Pou2f3MA0627.1chr19:42939579-42939595ACTAATTTGCATATCA-6.35
Enhancer Sequence
CATTACTCCA TATTACACTG TATTGTTTGG TTGTAATTTT ATTTTCAAAA CGCAACTTGA 60
TATATAAACA ATAAAACAAA ATGCATACCT CTATATGAAA ACGCATAACT AGGCTACAGT 120
TAACCATTAC ACTATGCAAC TATTTGTGTT TTTAATTTTT CTAATTAAGG GAATCTAAAT 180
GAATTTGCAA TTGGGCTTTT GCATATCTGA AATTATTTGT TGAAAGTATC AATTCTGCAT 240
ATTATATTAG TGAGTTTATA ACTCACTTTC TGATACATTA ACTTAGCGTT CATATTTAGC 300
TTAATCTAAT TAAAAATATG TATTTTTGAA CAGGACATTT AATAATCTGG GAGCGTTGAC 360
TTCAAATGTA TTATTTGGCC ATGTAACTTT CATCCCCCTA CTGGACGCAT TAGGAACAAC 420
ATGGCCGTAA AATTGTGGGT CGTAAAACTG CCTGGATCCA AGTCTGCAGA CGCCCCATAT 480
ATCTAAAGCC TGCCCGAAAG GTTGCCACGC ACTAATTTGC ATATCAGTGA TCTTGTAATA 540
TCTGACAAGC GTAAGCCCGT CATGTCTTTA CTCTTTAAGG TGCAGTGTAT TATAATATAG 600
TAAAACGTTA CATAAAGATA TAGGTTCTAA TTAACATATT GCTTTGCCTG ATGACGTCAC 660
TGCATAATCA CAGCTCAACC ACATTTATGT AGTTCAATAA TAATAATAAA AATTCCATCT 720
TTATGTAGTA TAAAAAAATT ATCGTTTTCT TAAATTGACT GGCCATCTCA GCAAAAACAT 780
TA 782