EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-22747 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr19:25169920-25171986 
TF binding sites/motifs
Number: 18             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXC2MA0846.1chr19:25170639-25170651TTTGTTTACATT-6.37
FOXK2MA1103.1chr19:25170639-25170650TTTGTTTACAT-6.32
FOXP2MA0593.1chr19:25170639-25170650TTTGTTTACAT-6.14
Foxj3MA0851.1chr19:25170636-25170653ACGTTTGTTTACATTTC-6.69
IRF1MA0050.2chr19:25171000-25171021GAAGCGAAAGTGAAACTGCGC-7.49
IRF3MA1418.1chr19:25170997-25171018GTTGAAGCGAAAGTGAAACTG+6.29
IRF7MA0772.1chr19:25171003-25171017GCGAAAGTGAAACT+6.44
IRF8MA0652.1chr19:25171003-25171017GCGAAAGTGAAACT+6.45
IRF9MA0653.1chr19:25171002-25171017AGCGAAAGTGAAACT+6.63
POU2F1MA0785.1chr19:25171187-25171199AATTTGCATAAA-6.11
POU3F1MA0786.1chr19:25171186-25171198AAATTTGCATAA-6.62
POU3F2MA0787.1chr19:25171186-25171198AAATTTGCATAA-6.32
POU3F3MA0788.1chr19:25171186-25171199AAATTTGCATAAA-6.78
POU5F1MA1115.1chr19:25171187-25171198AATTTGCATAA-6.14
Pou2f3MA0627.1chr19:25171184-25171200TAAAATTTGCATAAAT-6.16
RARA(var.2)MA0730.1chr19:25171553-25171570GGGTCACCCAAACGTCA+6.38
RFX5MA0510.2chr19:25170769-25170785AGTTGCTAAGGTAACA-6.11
Rarb(var.2)MA0858.1chr19:25171553-25171570GGGTCACCCAAACGTCA+6.24
Enhancer Sequence
AAGACTCCAG GAACTAAAAT TTTGGATATA ATATTGATAA TAACAACAAC AACAATAATT 60
ATAAAACACA AGACTTGTTT GTCAGTATAT ATGGTAAAAA ATATAACAAT GGATAATATC 120
ATACCCTCTT CTGATTCAAA GACTACATAA GCCTGGCCCT TGTTGGAAGT GGGATAAATC 180
ACTGTTAAAA CATCTTCTCC TTTGTTACAG CGCCTCAGAA AATGGATAGT TAATTTGTCA 240
ATCATTGCAT CTTCTCGGTA GCTGTCCGGG AGCCCATTCA CTTCAATAAC CATTCCCGTC 300
ATGTCCATCC TAAAACTGAG CAATGAATAA CTGTTAATGA TTGTGATAAA AGTTACAAAT 360
AACCAGTTAT TACAACACAA AATTACATTA TATTTCTTTC TTTAGTTAAA GTTTAGATGT 420
CTGTTCATAT GAACAAAATA TTGGACAAAC AAATTAAACC AATGCTGAAT ACTTTCTAAA 480
TGTTACCAAT ACCACGTCAA CTACAAACCA AAATCAGAAA TAAACTATAA CAATGGAACC 540
CAGATTGAAT GCATTCAGAA AATAACGCAT TTGTACAGAC GTTAACAAAA ATATGAAATT 600
AATAACTTTA TTTATCTCAC AAATTGTTCC CAAATTCCTC AACAATTCAG CAACACGAAA 660
AAGAATGTAC CTAATCCCTA CTGAAACGGC GAGTGTTTAG ACCTTGTTGC TAGTGCACGT 720
TTGTTTACAT TTCAGAATTC GGTTGTTAGT TACATTACTG AATACAGGAT GAGATTGATT 780
GTAATTTAAA TTAAGAGTAA CGTAATGTGC ATTTAAATAT TATGTATTAA GAGTAGATCG 840
CAAATTACTA GTTGCTAAGG TAACAGAAAA AGAAAGTTGT TGGGATATAA AACGTGGCAA 900
ACTAGTTTTA CAGCTGGCGT TTTACCAAAA CATATCGCCA TAGTAACAGG AAATCCCATA 960
GTTTTACAAG TAAAAGCGTA CGGTGATTCT TGGTGGATTC CAGATTTAGA AATTTACCTG 1020
TGGTTGATTG TATAATTTCG TTCGCCAGGA TAAAAAATTA AAGAAATACT CCCTCGTGTT 1080
GAAGCGAAAG TGAAACTGCG CTGATCAGAG CTTGATGAAA ACAAGGGGGC GTGCCTGAGC 1140
TCTCACAGAA AAATTACGAG TAACTTCCTT TAAGTATTTT AATCTGCAGC GGACTGGAGG 1200
ACACTTTACA AAATACGGTT TTCTTTGAGT TTTAGAAAAG TTTTTTTTTC TGTTTTAAAA 1260
AAGCTAAAAT TTGCATAAAT GTCAAATTAA ATGTATTTAA TCAATGACTT ATCCAAGACT 1320
GGAAATAAAT AAAAGCCGCT AAACCAAGAT ACATGTGATG AATTTGTTAT GCAATTTACA 1380
AATTCAAAGG AATAAAATTA CTTTAATTTG TATATTTTGG CAGTCATCAA AACTAATCGT 1440
AAAGAGAACA ATGCAAGTCC ATAAAAAATT GATAACCACT TTTCCCCTTA TAGTCTACAC 1500
TACAGTTCAT ACAGCATTTT AAATAGTTAT AAAACTGTCA CCTGTTATAT CTTTCTAAAT 1560
TGTACGTTAT GTCTACCTTA CGGAGTTAAA AACAGTACGG TTTCAATATA TATTTTTAAT 1620
AAACATCACC AAAGGGTCAC CCAAACGTCA CTAGATGGCG GTGTGTACTG TAAACAAAAC 1680
CAGATTAGTG CAGTAGATCT CTGGTTTGAG AATATCTTTA AACTGCAATA TTGTGAAAAG 1740
GTTATACATT TCACTGTATT TTGCAATGTG ATAAAAATAC AAAACATAAC ACCAGTATTA 1800
GAGAATGTCC AAAAAATAAA AATCTAATAT TGTGTATTCC ACTGATAAAC TTCAAGACCC 1860
TCATTGTGGA TTGAAACTAG TGTTATTGGT GGAATTTGTG CCGGCTTCCA ACTCTTACCT 1920
TTTTGTAGGA GAGAAAAAAA AACCCCTGCA CATCTGAAGC TCACTTGAAT ACAACTTCAT 1980
GACCTTTGCT CAATTTGAAA ACATAATACA AAGTTGCAAG TCTAGAAGTT TTTTCTTCTT 2040
CTAGACATTT AAATAGAATA TATTTC 2066