EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-22270 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr19:17588544-17590042 
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr19:17589615-17589631CATAAAGCAAACATAC+6.35
FOXC2MA0846.1chr19:17589618-17589630AAAGCAAACATA+6.11
FOXD2MA0847.2chr19:17589616-17589629ATAAAGCAAACAT+6.15
FOXE1MA1487.1chr19:17588611-17588626CGTAAAACAAACAAA+6.49
Foxd3MA0041.1chr19:17588615-17588627AAACAAACAAAC-6.32
GRHL1MA0647.1chr19:17589764-17589776AAAACCGGTTTG-6.62
GRHL1MA0647.1chr19:17589764-17589776AAAACCGGTTTG-6.62
GRHL1MA0647.1chr19:17589764-17589776AAAACCGGTTTG+6.74
GRHL1MA0647.1chr19:17589764-17589776AAAACCGGTTTG+6.74
PHOX2AMA0713.1chr19:17590008-17590019TAATTAAATTA-6.62
PROP1MA0715.1chr19:17590008-17590019TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr19:17590008-17590019TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr19:17590008-17590019TAATTAAATTA-6.62
TFCP2MA0145.3chr19:17589765-17589775AAACCGGTTT+6.02
TFCP2MA0145.3chr19:17589765-17589775AAACCGGTTT+6.02
TFCP2MA0145.3chr19:17589765-17589775AAACCGGTTT-6.02
TFCP2MA0145.3chr19:17589765-17589775AAACCGGTTT-6.02
Enhancer Sequence
ACACGGATCT TAAAACGAAA CAAAAGTTTA TTGCTACTCT ACAACACAAA GTACTAATCT 60
AACGTTACGT AAAACAAACA AACGCACATA CATACACACA CTCACAAGCA GTTTGAGGAG 120
AGTTATGACT GAGTGGATTT AACTTCTAGC CTTTGCTAAG TTCTTAGCAT TGCAACCTGA 180
GAGAAACCAT AAAAGCAGAG AATTTTGTTA TTCTTTACTA CTTAAACATA ATTCACACCA 240
GATTCAGTAA TGGATAGAAA CCTCGTTTGT GCTACTTGCG TTCTGATGTA ATTTTTGGTT 300
TCCTCGACTG GTCCAAAGGG AAATCCCGGC GAAGCTGATT GGTCAGCGTA GCAACTTCAG 360
TGACGTGATG GAATTCCCTT GTCGGTGAAG AGGGGTTTCC TTAGTCGGTT GCTAGGGATA 420
CGGATGTTGG ACAAGGCGGC GTTCGAAGTC CTTCCTGGGT TCCTGTAGTT AGGATGAGTT 480
TCAGGGTTTG GATGTGTTGA CCCGATGGCT TGTTGTTGAA GCGGTTGCAC AAGCAGATCG 540
GGGGTCGAGC CGGCAGCAAG TGAAGGTCGC GGTCTGCTGC GTGATGTAAC GAGGCTTCCG 600
GCGAGGCGAT GTAACGGCCA CAGCACGAGA AGAGCGACGT CCGGGCAGCG ACGGCGGTGA 660
CAACTGGCAA AGATGACCGG CAAAAGACGA CGATGAAATT CCTTTGTTCA AAGTTTTATA 720
GGCTTTGGTA GAGGCTGGGT CTACACAATA CTTGTCCAAT CAGATAAGGT GCGGGGTGGA 780
GTCACACCCC AATTCTGCCC TCTAGGAGGC CGGGTTGACA CCTGGTGTGG ATGCTGCTTT 840
GATAGCATAG TGGTTAAAAT AAAGTCTTAT AACATCGACA CTTTTCATAG TATGGTTTCT 900
TTATATAAAC CAATGCATTT GAAATGTTCC TAGCTTTCAA TCGATACCAA ACATGAAGTA 960
TTTCACAAAC ATTCTGTAGA TTTCATTTGT CGCTGAGGGC TATTACTCAA GAACTATCTA 1020
TAACAGTTTT GTTAAACACA TGGAACATGT ACACACAAAA ACCTACAGAA ACATAAAGCA 1080
AACATACATT ACTCAAATAA ACACAGTTTT ACTGTATGTC CATTAAACTT TGGAAGCGTT 1140
TCTGATCGCT TCTGTGTCTG CCTGAGAATG TGTATTCCTT GCAGACGCCA AAGGACAAGC 1200
GAACCAAAAG GTACTTCTCA AAAACCGGTT TGGTGGGTTT TTGATTGTAG AGCCTCTTAT 1260
TGTTTTAGGG TGTAAAGTTA ATTAACACGC AACTGTGATG TTGACTGGCT AGGTATCCTG 1320
TGGATTTGCC TTTTGCTGGG TGCCTGTGGA TTGCTTTGAA AATGAAATCA ATCTCAGACT 1380
CGTAGGCACC AACCAATCTT TTAAGGATAA CATGGTCTGT GGCTTGTTCG GTTCTGGAAC 1440
GATCCGTTGA CTCACTACAC TGTGTAATTA AATTAATAAA AAACAAGGGA ATGTAATT 1498