EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-22269 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr19:17587184-17588368 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX2MA0465.1chr19:17588114-17588125AAGCAATAAAA+6.32
HOXD9MA0913.2chr19:17588116-17588126GCAATAAAAC+6.02
RFX5MA0510.2chr19:17587505-17587521TGCTGCTATGGCAACG+6.14
RFX5MA0510.2chr19:17587505-17587521TGCTGCTATGGCAACG-6.1
Sox1MA0870.1chr19:17588135-17588150CACAATGAAATTGTG-6.61
Enhancer Sequence
ACTCAGCAGT TAGATCGTGC ACACTTTTAT TAACTTTGCA TTTGTCAACT TTTCCAAGGT 60
GAGTAAAGAG AAACAACTGA GATGCAAGAG TTATTTCAAA CATCAGCCAT ACAATGCATT 120
TAAGACCACT ATATGCTACG TGCTATCTAT TAGCCTTCGT TGCTACTGGA AATGCATAGA 180
CTTCAATGCA AACGCGTTAG CGTTAGTTTA GCTTAGCTTC ACGCTATGCT CTTTGTTTAC 240
AATTCAAGCT GGCGCTGGCG GGCTGCACAT GCACGATTGA ATGTAATTCC GGCAAGTCTC 300
TCTGTACTTC CGGACCAAGG TTGCTGCTAT GGCAACGACC ACAAAGTGGA ATAATAGCAA 360
ATTTCACAGT ATCACTTGAG ATGGCGGCGC ATCTCACACT GTTCAAGCAA AAAGCACTGG 420
TTAGATTTTA TATCTTAACA GTACTGAACG ATTCTCAACT TATGAAAGTG AGACAAAATT 480
AATCAACAGG ATTTCTGAGA TTAATACAAA TCGTGACAGA GATATGGGGG ATCTCAGCAC 540
TCTGTGTTAA GTCTGTTTAG ACTGCAAACA CATCCGTGGA ATCAAACCAC AATTTCAATT 600
GATCAATTTC AAAACTTCTC CTATAAACTA CGCTAGGCAG CTTTCTCTGA GCTCCGCGTT 660
TTAAATAATT TACTAAGTAT TAGCAAATTA CAGGGCAACA AGAATTTAGT TAGCTATGCT 720
AAATCAGTTA CCAGGAGAAA ACACAGCTGA GTTTCCATCC GGGAATCGCG GCGTACGAAA 780
TCATACTGTG AAGGCCTTAT ATAACGTTAT GAGATAAGCA CAAAGGAATA CGCTTTGTCT 840
TTCTCTACAT GCGCTTTAGA GCGGCTTACA GTGTGTCTCG GCGGACAACT TAAATGAAGT 900
TTTACTTTCT TAACAACACT AAATGCAGTC AAGCAATAAA ACAAATGGTA CCACAATGAA 960
ATTGTGCAGT AGCAAAACTT TTGTTCTTTC TAATCTATTC TTTCCGGACA AAAATAGAAA 1020
AGATTAACAA CGTGATTTCT GGGTGTTGTG CTTTAAAAGT TAGATCTGCT TGCCCGAATT 1080
ATTCTCCACC ACTATGTAAG AATCAGCTCT TTGGTTTAAA TCATGTTTAA ACTTTGGGGA 1140
TTCGAATCAA AGATTCGAAC ATGATTCACA TAGAATTATT TAAA 1184