EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-21110 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr18:40369389-40372491 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Gata4MA0482.1chr18:40370827-40370838TCTTATCTCTT+6.02
HNF4GMA0484.1chr18:40371630-40371645TGCACTTTGGCCTTT-6.24
IRF1MA0050.2chr18:40371437-40371458TTTTTGTTTCATTTTTATATT+6.48
MEF2CMA0497.1chr18:40371432-40371447TTCTATTTTTGTTTC-6.02
MecomMA0029.1chr18:40370822-40370836TCTTGTCTTATCTC-6.16
MecomMA0029.1chr18:40371030-40371044TCTTGTCTTGTCTT-6.34
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr18:40371093-40371108TGACCTTTTGTCCCT-6.36
RARA(var.2)MA0730.1chr18:40369769-40369786TGACCTTTGTGTGTCCT-6.87
Rarb(var.2)MA0858.1chr18:40369769-40369786TGACCTTTGTGTGTCCT-7.09
RarbMA0857.1chr18:40371093-40371109TGACCTTTTGTCCCTT-7.24
RargMA0859.1chr18:40371092-40371108TTGACCTTTTGTCCCT-6.93
SOX10MA0442.2chr18:40371305-40371316TCCTTTGTTTT-6.32
Sox3MA0514.1chr18:40371306-40371316CCTTTGTTTT+6.02
Enhancer Sequence
ACAAACTCGT ACCGACCTGC TTTGTTCTTA TGACCTGCGC TGTCGCATTT CCTGCAGCTG 60
GACTCTAGCA GGCAGGCTCT GGGTGGATCC GCTGCAGGCA ATTTTACTGG AATGACCTGC 120
CAACTCAAAC GGCGTGCCAG CATCTCGAGA AACGCAGCCA AAAACATCAG CGAGTACGGG 180
ATTGCGTTGC TCAGAGAGAA GCTGTAATGA GAGCAGCCGG GGAGTAGCTA AACACTAACA 240
GGTTGCGTGA CTAGTCGTCT CTTTCCACGC AGGGCCTGTC CAGGCTCATA CACCGGAGGG 300
CAAGAATGGA AAACCAAACC AAGACGTTCA ATAGAAAACA TGTTGCACTG GCTGTATATT 360
GAAAAGAAAT TCTAGACTGC TGACCTTTGT GTGTCCTTTG TTTCTGTTTT GCATTAGGTT 420
TCTCTCGCTC TCTTTGCCCA AGCTTGGTGT TTTTCTTATG CTGGGATTGT TATGGTATTG 480
TAGCGTGTCT GTGTAACTCC CTGTGGTGTT TCTATGAATA ATGATTTGAG CTTGTGAGGA 540
ATTTCTGTCA TTGACAATGA ATATGTTCCA GGGTGCTGGA AATATCCCTC TTTTATTTCT 600
TGAAGTAATA TCCAGGCGGA GGGAATGATA CAGCGCTGTG AAGCTGTGAT TAGACTCTCG 660
GTGCTGTATT AAACTGGTGC TCCTCTTGTA CACATCGCTT AATCCATACG GTCTTCCCCC 720
GGCCCCACCA AGAGTGCTGT TCTGCTGATG TAAGCACTTC TGTAAGGATC AGGGATGAGC 780
TTGGGAAAGA AATTCATTTG GAGCTGCCTC GTTATGATAG ACACTTTTCC TGACCCCTTG 840
GCCTTTGACT TCCGCTGAGT GTCCAAACAT TAAAGCTCTT AATCGCTCAA GCACACACGC 900
GGGCAAGAAA AACATAATCT TTATTCCCGT CTCGTCGCCT AGGTCTTTCC ATCTCTTCTT 960
GTTTTCTTAC TTTGACTCTC ATCTTATTCT TTGTGTCCTT CTTGACTTTT ACATCTATCC 1020
TTCTCCATCT GGTCTCCCTT TTTCTCATTG TTCTATTTTG ACCTTTTCTC TCTCACCTCA 1080
TGCCATCTTT ATTTCCTTTT TTCATTTATT TTTTTCCTAT ACTCCAGTCT AGTCTCTCTC 1140
TTGCTCTTTT TCTCATGTTG TCTCTCCTTC TTTTTTGTAT CATATCATCT GGTTGTCTTG 1200
TATCAGCCTC TCGCCTCTGT CCCTGTCTCC TTTCTTGTCT TGTCTCATCT TTTCATCTCT 1260
TCTATTTTCA TCCTTGTCTT GTCTTTTTGG TCCTTGCTTC TTAAAGTCTC TGACTTCTTT 1320
CTTTTCATTG TGTCTCCTCC TCTAGTCTGG TCTCAACTTG TCTCTCCTTC TCTTTTGTAT 1380
CATATCACCT GGTTGTCTTG TCTCAGCCTT TCGTCTCCTG TCCCTGTCTC CTTTCTTGTC 1440
TTATCTCTTC GTCCCAACTA TTTTCATCCT GTGTCTTATC CTTGTCTTGT CCTTTTGGCT 1500
CTTGCTTCTT CAATTCTCTT GACTCCTTTC TTCTCATTCT GTCTCTATCT CTACTCTGGT 1560
CTCATCTGGT CTCTCCTTCT CTTTTGTATC ATATCATTTA TTTGTGTTTT TTTTCTCAGC 1620
TTCTCTTGTC CCTTTCTCCT TTCTTGTCTT GTCTTGTCTC TACTTAAATA AGTTATTTTT 1680
TCATCCGGTG TCTCATACAT GTCTTGACCT TTTGTCCCTT GCTTATTCAT ATTTCTGACT 1740
CTTTTCTTCT CATTTTGTCT CTACATCTAG TCTGGTCTCA TGTTGTCTCT TATACCTGTC 1800
CCTTGTCATT TGGTATATTG TTCTGATCAA ATAGATTTCT TTCTCATCTC TAGACTCTTG 1860
TTTCCTTTTT TTTGTCCGTT TCCTTTCTCA CCATTTCTGT ATTATTATTC CTTGTCTCCT 1920
TTGTTTTCTT TCTTTAATTG TTGCCTCATC GTCTGTGCTT ACTTCTCAAT TTTTCTCTCC 1980
TCTTCTGATC TAATTTCTCA TACTTGTCTC AACACATTTG GCATGTGTAT CTCATTTAAT 2040
TTGTTCTATT TTTGTTTCAT TTTTATATTT TATAATTGTC TGAAACATTC AATTCTCATC 2100
TCCTCTCCCT GCCACTCCTC TCAGTTCCCG GCTTACCTTG CATTAACTTT TATTTTTCTT 2160
CATCTTATAC TTGTCTCAGC TTGTCTCTTC TTTTCTCTAT TTACTTTTAC CAGTCTGATG 2220
AGTCCTAATA TGTCTTATCA TTGCACTTTG GCCTTTTCCT GTCTTCTTTT TCTAATATTC 2280
ACCTTTTTTA AATTGCGTCT TTTCTAACCT TCTCTTCTTC TCTGCGATGC CTCTCTATCT 2340
CTTCTCATCC CTCAGACTTA TATCATCATC AGTCTTTTCT CTCTTCTCAT CTCACCTAAA 2400
AATGGCCAGA GAAATAGTCA TTTCTATTGA TCCGATCAAA GCATTATAGC CCAGAATCTC 2460
TTACAGTCAG TCAGCCTGTA GAAATGAAGG TCCATTATGG CAACAGATGA GCAGAGAATC 2520
TCCCCTGCTT GTATTTCAGT AGGAGAATTT CCTCAGGTCA CGTCCCATTC CGCTGATCAA 2580
TTGCGAACTG ATCAATCAGC TGCTAATCAA TAGAAGCAGG ATGATTCCAG CAGCATATGC 2640
ATATTACAGC ATGGGAGCAG GTGCACAGGG CCGCTAATTG CAAAAATGTC AATACTGTAT 2700
GTGAGCATGT GTGGCGAGAC ACTCAGGAAG TGGTTTGGGC CTGACTCACT CACTCTCTCT 2760
CTCTTTCTGC CAAGCTGTTT GTTGTCTCCA TGTAAATTGT TTATATCCGT TCGGGCTTTG 2820
CTGGCATGAA TAATTTGTAG CTTTATAAAT ATTTGACTTT ACACTCCTTG TTAATATGCA 2880
CAGATGATTG TCTCTCCAGG ACACGACCCC AACCCCAACA CGCAGACCTC TGAAATCTTC 2940
CTGTTTGAAT GTCTGTTTGA AGACTTCTGT GCCAGTCACA GCAAACACAC CCCTGCCTCC 3000
AGTACCCTTT CTAGGCATGA TTGAACTAGG CAGTCACCTT GTACGCCATC TATTACAGGG 3060
GTGCCAATGA GCATCCCACT GCCCTGCCCA CAGAAAGTAA AG 3102