EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-20530 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr18:31323523-31325229 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr18:31325172-31325189CGTATTAATTAATCTTT+6.37
Alx4MA0853.1chr18:31325172-31325189CGTATTAATTAATCTTT+6.67
BHLHE41MA0636.1chr18:31323799-31323809GTCACGTGAC+6.02
BHLHE41MA0636.1chr18:31323799-31323809GTCACGTGAC-6.02
MITFMA0620.2chr18:31323795-31323813GTATGTCACGTGACCTTT+7.42
MITFMA0620.2chr18:31323795-31323813GTATGTCACGTGACCTTT-7.42
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr18:31323805-31323820TGACCTTTTTACCTG-6.15
POU6F1MA0628.1chr18:31325175-31325185ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr18:31325175-31325185ATTAATTAAT-6.02
RarbMA0857.1chr18:31323805-31323821TGACCTTTTTACCTGT-6.64
RargMA0859.1chr18:31323804-31323820GTGACCTTTTTACCTG-6.16
STAT3MA0144.2chr18:31323623-31323634CTTCCCAGAAG-6.14
USF1MA0093.2chr18:31323799-31323810GTCACGTGACC+6.14
ZNF384MA1125.1chr18:31324264-31324276GTTAAAAAAAAA+6.04
Enhancer Sequence
AACACTGAAA CAAATAAAGA CGGGGAAAAC AAGAGAGCTG GCAGAAGGGA CGCGGGCGGC 60
GCTAAAGAAA TGAAAAGAAC AAAACCCAAA CTAAATCTAA CTTCCCAGAA GCATCTAGCT 120
AACTAACTAT GTGAAAAACA GTATAATTAA CACACGAAGA TCTTCCGAGC CCTAACTATC 180
TACTCTATCT ATCTATTCAA AAAGTACAAG GAGTGGCGCT CGCCCCTAAC CTAGTGTACT 240
AGACAGCAGA GCAGTCCTGA GTGTTGCGAA ATGTATGTCA CGTGACCTTT TTACCTGTCC 300
GCTTCGTCCA AGCCTCGTAA ACAACGATAA ACTAAGAACA ATGTACGAAT AACGGACGGA 360
TAACGTGCAC ACAGAAACAA GCAACAACAA AACACAGTTA GACGGGGTAA TTTCTAAACG 420
CACGCGGTAA ATACAAACAA AGCGACGAAA CAGCGAAAGA GACAAATGCA AGCAAGAAAG 480
CAAGAACGAG CGAGTGGTCT GGCGCGCGCT TTTAAGACGG GTGGTCTTTG CTCATTGGAT 540
GTGACGTAAG AGTGACGTAA CCGGGGAGGA ATGACTGACA GCTGAATGGA CCAATGAACA 600
GAACCTGAGA ATACATGAGA GCAGATACGG GAGAACAGAG CGAGAGAGAG AGAGAGAGGG 660
AAAAAACACA GAGAAAACAG AGCACAAAAA ACACAAATAC ATAACACTCC CACCCATGAG 720
AACAAACATA TAATATTGTT TGTTAAAAAA AAATTGTGAA ATAGTAAGAA AAAAAACTCG 780
CAAAACAAAC CATGCGGTTT AATTACGACC AACTACACAC ACCTGGAAAG AGCATCGGCC 840
ACTATATTGT CGGTGCCTTT CTTGTGACGG ATTTCCAGGT TGTAATTCTG TACAATCAAA 900
GCCCAGCGCA TGAGGCGCTG ATTTTGATTG TACATTCGGG AGAGAAAAAC TAACGGATTG 960
TGATCGGTGT AAACAATGAT TGGAAACGAA CTGGAACCAA GGTAAACTTC AAAGTATTGT 1020
AATGCCAATA GTAATGCAAG TGCTTCTTTT TCGATAGTGG AGTAATTAAT TTGGTGTTTG 1080
TTGAATTTTC TGGAAAAATA ACAGACTGGG TGCTCGATAC TATCACGGTC CTCCTGGATA 1140
AGTACCGCGC CAGCACCTAA AGCACTCGCG TCTACTTCCA GTTTAAAAGG AGTGGTGAAA 1200
TCTGGGGCCG CGAGTACAGG AGCGCAGCAG AGCAAAGCTT TTATGCTCTC AAAAGCATGC 1260
TGACACTCAG CTGACCAAAC AAATTGCTGA GAGGGACTAA GTAAATTCGT GAGGGGTGAA 1320
ACCACACTGG AAAAGTTTCG GCAGAAACTC CGATAGTACC CCGACATACC CAAAAACCGG 1380
CGCAACTCTC GCCTGGTTTT AGGTACGGGA AATTCGGCTA TGGCGGAGAC TTTCGCAGCG 1440
ACTGGCCGAA CTTGACCTTG ACCAACTTCC TTACCAAGGT ATGTGACGGT CGCCCTAGCA 1500
AATTCACATT TTGCCAGATT TAATGTTAAT GTGGCGTTGG ACAGTTTTTC AAAAACAGTG 1560
TGCAGCAAAG AAATGTGTTC AGACCATTCA GATGCATAAA CCACTAAATC ATCCAAATAT 1620
GCGTTACAAT TTGGAACGCC GAATAAAACC GTATTAATTA ATCTTTGAAA TGTGGCAGGT 1680
GCGTTTCGCA ATCCGAAGGC CATAAC 1706