EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-19224 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr17:49349119-49350227 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
KLF16MA0741.1chr17:49349871-49349882GGGGGCGGGGC-6.02
KLF5MA0599.1chr17:49349872-49349882GGGGCGGGGC-6.02
Lhx3MA0135.1chr17:49349345-49349358TAATTAATTAATA+6.25
Lhx3MA0135.1chr17:49349363-49349376AAATTAATTATTT+6.78
Lhx3MA0135.1chr17:49349342-49349355GAATAATTAATTA-7.12
PBX2MA1113.1chr17:49349477-49349489CCTGTCAATCAC-7.22
PBX3MA1114.1chr17:49349474-49349491CCACCTGTCAATCACTT-6.14
POU4F1MA0790.1chr17:49349340-49349354ATGAATAATTAATT+7.82
POU4F2MA0683.1chr17:49349340-49349356ATGAATAATTAATTAA+7.91
POU4F3MA0791.1chr17:49349340-49349356ATGAATAATTAATTAA+8
POU6F1MA0628.1chr17:49349347-49349357ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr17:49349347-49349357ATTAATTAAT-6.02
SOX10MA0442.2chr17:49349807-49349818AAAACAAAGAC+6.14
SOX10MA0442.2chr17:49349409-49349420GTCTTTGTTTT-6.14
Enhancer Sequence
CCTGAACTTG AAAATATGAT TGGCAGAATC GTAGAAATGC TGGATTAAGA TCGTCTAGGG 60
GGTCGAATCG AGATTGCGAT GTTTTTTTGA TTAATTGTGC AGCTCTAGTT TGGGTGCTCT 120
GTGTTTGTCT GAGGTAATTA ATAAGGGTGT CACGATCCTC CAAATCCTCG ATTCGATTAC 180
ATTTTCGATT CATAAGTCAC GATTCGATTC GAATTTCGAT TATGAATAAT TAATTAATAA 240
TAACAAATTA ATTATTTGTA GCCTACCGTT TAAACTACCT GACCTGCATG GTCTTTGTTT 300
TACCCATAAA CAAATCATAC AGTAAATGAA TAAAGGTAAG TTACACACAT AATTACCACC 360
TGTCAATCAC TTTTTCTGCG GGACTCGTGA ATAGGCAGTG ATCTGTGTCG TTATAATGGC 420
GTCAGTAAAA AAGGTGCACA ACCAACAGGA ACCAGCCAAC AGTATCTGAG GTGTTCGCTA 480
AAATGACTAA GTACTTGTGT GAAAGTAAAA GATGGAAGCA GTCTACTGAC CCGCTGTCTC 540
GAGCGCATGA CAATGTGTGT GCGTCTGTGT CTGTGTGTGT GTTTGAATGA GTGGTGTGTG 600
TTTTCAGCGG TAGTGAGGAA GGAGGGCTGC TCAGAAATGC TACACGCCAG TGAGGATGTG 660
GATCGTTGTC GTTCTAAAAT GCCATTTAAA AACAAAGACA TATTAGTGTT AACAGGGCCT 720
GAGTGTGTAT TTTTCGCAAG CGGATTTGCA ACGGGGGCGG GGCGGAGGAT CGCGATGCGC 780
CCATCGTCTA TCATCCCAAC CATAATACGT ACATAGCAGA GCTTGCAAAC TGTGTTTTTT 840
TGTTTTTGTC GACAACACGA ACGTTGTCAA CATAACTGAC TGGAAATCCA AAATACTTCC 900
ACACCGGCGA CTTCATTGAA AGAGGAGAGG ATTTAAGCTC TGTCGACGGG TCTCCTGCGT 960
CTGCAGTTTA ACAAGCACTT TAACAAGCGT GTTTTTTTCC CGCTTGGCAA GCCAAGCTGA 1020
CGTGACATGG GGGTGTGGCA GCATCGACGA TTCTATTTTT TGATTCGATA ATCGAAGTTG 1080
AGCATAAATT TCGATCGATT TCGATTAA 1108