EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-16120 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr16:25963131-25964314 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
E2F7MA0758.1chr16:25963163-25963177GTTTTCCGCCAAAT+6.03
MTF1MA0863.1chr16:25963537-25963551GTGTCGTGTGTAAA-6.34
RFX3MA0798.1chr16:25964099-25964115AGTAACCATGGAAACA+6.13
RFX4MA0799.1chr16:25964099-25964115AGTAACCATGGAAACA+6.12
RFX4MA0799.1chr16:25964099-25964115AGTAACCATGGAAACA-6.31
SMAD3MA0795.1chr16:25963281-25963291CGTCTAGACA+6.02
Enhancer Sequence
TTTAGTATGT TAAGAGCTGT GCAGGATTTT TAGTTTTCCG CCAAATTCTC TCTGCAGCCC 60
GAAGTTTTGA GCGATGCTCA CGAAGAGCAT CCGAGAGCCA GGGTGCATGA GGACTGGCAC 120
GGGCTGGCCT GGATGCAAGA GGACATAATC CGTCTAGACA TGATGCTAGT GTGGAGCAGA 180
GTGTATCATT GGCACTGTTC GTATCAAGTG CAGAGAGTTT GCAAGATGGA GGAAGATAGT 240
CTGAAACAAT GGTGGATAGT CTATTGGGTG AGAGAGAGCG TAGGTTTCTG CGAAAGGCAA 300
CCAGTGTTGG AGTGTGTGGC GGCTCAGGAG TAATGTGGAT GTTAAGGGAC AGAAGGAAAT 360
GATCCGATAT TTGTAGTGGA GTTACTATTG TTTGATCAGC GAAGCAGTGT CGTGTGTAAA 420
TAAGGTCTAG CTGATTACCT GATTTGTGGG TAGCAGAAGT AGGTGCTCTT TTGAGGTCAA 480
AAGAGGCAAG CAGAGTCTGA AAGTCAGCAG CTTGCAGTCT CTCAATGTGA ATGTTAAAGT 540
CACCTAGCAC CAACAAGGGA GTGTCATAAT TAGAAAAAGA TGAGAGAAGA ACATCCAGTT 600
CATCTAAGAA GTGACCTAAT GTACCCGGTG GGCGGTAGAT GACAACCACA TTTATGTAGA 660
AGGGGTGGAT AATGGTGACT GCATGGAAAT CAAAGGAGCT GATTGTTAGC AGGGACGGTC 720
TCAGAGTAAA TTTCAGGTAG AGTCGATGTC GAAGGTAGAG TCAATAGTCT TTACACTCGT 780
CGGTCTTCAC ACGAGGTGGT CTTCACACGA GGCTGCCGCG ACCGCTGCCG CGGTGAAACT 840
AGTTGCTTAT ATACACCCCA AAGCACTAGC TAATTGAATT CAGCTGGACA CGCCTCGAGA 900
GCCAAAACAA CGACCGAAAC TGCGGCGGAT GACGCGAAAC CGTCTGCGTT CGCCACACAA 960
GCTCTTATAG TAACCATGGA AACAGTGGCT AAACACTTCT AGTGTTATAC ACAACTGAAA 1020
GCAAGTTTAA ATGTCCTACA ACCTTACACA AACAGCTGAA AACAAGTCCT CAAACCATAC 1080
ACAACAACTG AAACAAGTCT AAATGTACTT ACAGGCTGCT GGTCTCGTTG GTAGAGTGCT 1140
TCTCCTTTTC TTTCAGAAAT TTTGTTGGAA TTGAGCCCAG CAT 1183