EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-16109 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr16:25880440-25881552 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CREB3L4MA1474.1chr16:25880674-25880686AGTGACGTGGCG-6.14
Foxd3MA0041.1chr16:25881536-25881548GATTATTTGTTT+6.07
GSX1MA0892.1chr16:25880699-25880709TTTAATTAGG-6.02
RREB1MA0073.1chr16:25881198-25881218GCACAAACCACCACAAACCC+6.11
Enhancer Sequence
TTTGGTTAAA TCCAAACAAG GAAAATAGAT AAGTGTTTAT AAACGGCACA ACCAGCACAA 60
CTGAATGACT GTTTGGTGCA ATATTACGTC GCGGCTCCCA AAGTGTTTTG ATTAGGCAAT 120
ATCTAAACAA TACAAACAGA TAAAGTGTTT ATTTTAATGG CATAAACCAG CACAAATCCA 180
GCACTAAAGA GTGTCACCCG TTTTGTGCAT TTTAGAGGAA ATAATGGGGC GCTGAGTGAC 240
GTGGCGGCTC CCGAAATGTT TTAATTAGGC AATATCTAAT CAATAAACAT ATAAAGTGTT 300
AATTGTTATT GCACAAACCA GCACAAATCC AGCACTAACA TATGACACCT GTTTTGTGCA 360
ATTTAGAGGA AATAATGGGG CGCTGAATGA CATCGCGGCT CCCGAAATGT TTTGATTAGG 420
CAATATCTAA TCAATAAACA TAGATAAAGT GTTTATTTTA ACGGCACAAA CCAGCACAAA 480
TCGAGCACTA ACATATGACA CCTGTTTTGT GCAATTTAGA CAACCTGGGG TGGAGAGTGA 540
CGTCACGGCT CCCGAAATGT TTTGATAAGG CAATATCTAA ACAATAAAAA TAGATAAAGT 600
GTTTATTTTA ACGGCACAAA CCAGCACAAA CCGAGCACAA ACGAATGAGA CCAGTTTGGT 660
GTGATTTAGA CAACATGGGG TGGAGAATGA CGTCACGGCT CCCGAAATAT TTTGGCTATA 720
TCTAAACAAC GAAAATAGAT AAAGTGTTTA TATTAACGGC ACAAACCACC ACAAACCCAG 780
CACAAACGAA TGATACCAGT TTTGTGCAAT TTGGAGGAAA TGGGGTGGAG AGTGACGTCA 840
CGGCTCCCGA AATATTTTGC TTATATCTAA AAGAGGAAAA CAGATACCGT GTTCGTTTTA 900
ACGGCACAAA CCAGCACAAA CCGAGCACAA ACGACCTGTG CTGTTTTGAA GTCAATTGCG 960
CAACATGGGG TGGAGAGTGA CGTAACACGG TTAAAAAAAT AATGCTTAAT ATCTCAGACC 1020
CCAAACCAGC ACAAACGTTC GTTTTTGCGG CACAAATCAG CACAAACGTA GCACAAACGA 1080
ATGGCATAGT TTTGGGGATT ATTTGTTTTT AT 1112